Dans une récente étude publiée sur Le microbe lancetteles chercheurs ont exploré la libération de particules virales dans l’environnement et l’air après une provocation humaine par le coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère.
Sommaire
Arrière-plan
Comprendre la contagiosité et le moment de l’infection est crucial pour mettre en œuvre des stratégies efficaces pour réduire la transmission du SRAS-CoV-2. La mesure des émissions virales pourrait être une technique précise pour déterminer la probabilité de transmission ultérieure et découvrir les voies potentielles, plutôt que de se fier uniquement à la charge virale des écouvillons des voies respiratoires supérieures. La présente étude visait à observer la corrélation entre les émissions virales, les symptômes notés au fil du temps et la charge virale dans les voies respiratoires supérieures chez les personnes atteintes du SRAS-CoV-2.
À propos de l’étude
L’équipe a recruté des adultes en bonne santé âgés de 18 à 30 ans qui n’étaient pas vaccinés et n’avaient aucun antécédent d’infection par le SRAS-CoV-2. L’étude a été menée dans un seul centre à Londres et était une première étude d’infection expérimentale chez l’homme. Les participants ont été dépistés pour la séronégativité et ont été mis en quarantaine au Royal Free London NHS Foundation Trust. L’outil QCOVID a été utilisé pour offrir une estimation personnalisée du risque absolu d’hospitalisation et de décès. Il a identifié les participants qui ont dépassé un seuil de risque prédéterminé. Avant l’inoculation, l’individu a subi une échocardiographie et une radiographie pulmonaire.
Les participants ont été placés dans des chambres individuelles à pression négative. L’étude consistait à administrer 10 doses infectieuses de culture tissulaire à 50 % (TCID50) de SARS-CoV-2 de type sauvage pré-alpha aux participants via des gouttes nasales. Les participants ont été maintenus en quarantaine pendant au moins 14 jours après avoir été vaccinés jusqu’à ce qu’ils satisfassent aux critères de sortie. Une collecte quotidienne d’écouvillons nasaux et pharyngés a été effectuée. L’étude a également recueilli des échantillons d’air à une distance d’un mètre de la tête du participant.
Une collecte quotidienne des surfaces environnementales et des écouvillons manuels a été effectuée. L’étude a mené des analyses virologiques sur tous les échantillons, y compris les échantillons de nez et de gorge, les masques, l’air et les échantillons environnementaux. La réaction en chaîne de la polymérase (PCR) a été utilisée pour quantifier l’acide ribonucléique ribosomique (ARNr) du gène domestique humain 18S dans tous les échantillons afin de déterminer l’impact de l’efficacité de l’échantillonnage ou d’estimer les émissions totales de particules sur l’observation. Des journaux de symptômes autodéclarés ont été utilisés pour recueillir les scores des symptômes trois fois par jour.
Le principal résultat de l’étude était d’étudier la contamination de l’environnement et de l’air chez des adultes en bonne santé participant au modèle de provocation humaine SARS-CoV-2. Les méthodes utilisées pour cette exploration comprenaient l’échantillonnage de l’haleine expirée, l’échantillonnage de l’air et l’écouvillonnage de surface. L’étude a également décrit les voies de transmission du SRAS-CoV-2 et les associations entre les facteurs de l’hôte et les émissions virales comme résultat secondaire.
Résultats
L’étude a recruté 36 participants entre le 6 mars et le 8 juillet 2021. Sur 34 participants séronégatifs, 18 ont signalé une infection par le SRAS-CoV-2 après la provocation. Les participants infectés ont présenté des symptômes légers à modérés et avaient des charges virales élevées dans le nez et la gorge pendant une longue période après une courte période d’incubation. L’air, l’haleine et les chambres des personnes non infectées étaient exemptes de contamination virale. L’étude a également montré que les 18 participants infectés ont libéré des particules chargées de virus dans l’air.
La contamination virale s’est avérée constante parmi les cinq surfaces qui ont été écouvillonnées. L’étude a révélé que le SRAS-CoV-2 viable a été détecté sur 16 masques et 13 écouvillons de surface, mais pas sur des échantillons de main ou des échantillons d’air Coriolis.
L’étude a mené une analyse de corrélation sur tous les échantillons des participants pour déterminer l’association entre la charge virale dans le virus émis et les écouvillons, ainsi que les symptômes. Les mesures de la charge virale de surface et de l’air se sont avérées regroupées. La charge virale de la main et du masque a été regroupée avec la charge virale nasale. Les écouvillons à main ont montré des associations plus fortes avec les télécommandes de télévision et les poignées de salle de bain. La charge virale nasale a montré une corrélation plus forte avec les charges virales du masque, des mains, de l’air et de surface que la charge virale de la gorge. Notamment, les scores d’émissions et de symptômes ont montré une corrélation minimale.
Des niveaux constants d’ARNr 18S du gène domestique humain ont été trouvés dans des échantillons d’air quotidiens du même individu, ce qui suggère que la quantité de particules en suspension dans l’air expulsées n’a pas changé pendant l’infection et que les particules détectées dans l’échantillon d’air sont restées stables. Les différences dans l’ARNr 18S des masques étaient plus significatives, indiquant que ce type d’échantillonnage est plus variable et pourrait être influencé par divers facteurs tels que les niveaux d’activité individuels, les événements expiratoires ou l’alignement du masque pendant la période d’échantillonnage d’une heure.
L’ARN viral a été identifié dans le masque, l’air et les écouvillons de surface avant l’apparition de tout symptôme signalé. Les émissions d’ARN viral représentaient respectivement 2 %, 8 %, 9 % et 10 % de l’aire totale sous la courbe (AUC) pour les écouvillons manuels, les écouvillons de surface, l’air et les émissions de masque. L’étude a également montré que la majorité de la contagiosité a été détectée après que le participant a été signalé pour la première fois comme étant malade, car seulement 7% des émissions dans l’environnement et l’air se sont produites avant le premier symptôme signalé.
Conclusion
L’étude a découvert qu’après avoir infecté des individus en bonne santé avec le SRAS-CoV-2, il y avait une quantité importante de contamination virale dans l’environnement et l’air environnants. La contamination s’est avérée importante mais variée et provenait probablement de l’épithélium nasal. Les premiers symptômes déclenchant l’auto-test pourraient détecter une grande proportion d’infectiosité, car les émissions virales sont survenues après que les participants ont signalé les premiers symptômes et ont été testés positifs par le test antigénique à flux latéral (LFT).
La corrélation entre les émissions virales et la charge virale s’est avérée plus forte dans le nez que dans la gorge, ce qui suggère que la muqueuse nasale infectée est une source importante de virus pour la transmission virale.
L’équipe a noté que le LFT a le potentiel d’être une méthode plus efficace pour identifier les individus infectieux par rapport au dépistage de la fièvre en raison de ses résultats rapides. L’étude conclut que l’hygiène des mains, ainsi que le nettoyage des surfaces, jouent un rôle important dans la diminution du risque de transmission.
