Des chercheurs du Karolinska Institutet ont découvert que les gènes codant pour nos récepteurs des lymphocytes T varient considérablement d’une personne à l’autre et d’une population à l’autre, ce qui peut expliquer pourquoi nous réagissons différemment aux infections, par exemple. Les résultats, présentés dans la revue Immunity, démontrent également que certaines variantes génétiques sont héritées des Néandertaliens.
Les lymphocytes T qui font partie de notre système immunitaire jouent un rôle central dans la protection contre les infections et le cancer. Avec l’aide des TCR, les cellules reconnaissent les envahisseurs étrangers et les cellules tumorales.
« On ignorait auparavant à quel point les gènes TCR humains sont variables », explique Gunilla Karlsson Hedestam, professeur au département de microbiologie, biologie tumorale et cellulaire du Karolinska Institutet et auteur principal de l’étude.
À l’aide d’un séquençage en profondeur d’échantillons de sang, les chercheurs ont examiné les gènes TCR chez 45 personnes originaires d’Afrique subsaharienne, d’Asie de l’Est, d’Asie du Sud et d’Europe. Les chercheurs ont montré que ces gènes varient considérablement d’une personne à l’autre et d’un groupe de population à l’autre. Les résultats ont été confirmés par des analyses de plusieurs milliers de cas supplémentaires issus du projet 1000 Genomes.
Nous avons constaté que chaque individu, autre que des jumeaux identiques, possède un ensemble unique de variantes du gène TCR. Ces différences révèlent des mécanismes possibles qui sous-tendent le large éventail de réponses aux infections et aux vaccins que nous observons au niveau de la population. »
Martin Corcoran, premier auteur de l’étude
« Nous avons découvert 175 nouvelles variantes génétiques, ce qui double le nombre de variantes connues du gène TCR. Une découverte inattendue et surprenante est que certaines variantes génétiques proviennent de l’homme de Néandertal et que l’une d’entre elles est présente chez jusqu’à 20 % des humains modernes en Europe et en Asie. «
Gunilla Karlsson Hedestam explique que la variation de ces gènes ne peut pas être détectée avec les méthodes standard utilisées dans le séquençage du génome entier, mais avec le développement de méthodes spécialisées de séquençage en profondeur et de logiciels d’analyse qui permettent une définition très précise des gènes des récepteurs des cellules B et T, c’est maintenant possible.
« Comme ces gènes sont parmi les plus variables de notre génome, les résultats fournissent également de nouvelles informations sur la façon dont notre système immunitaire s’est développé au cours de l’histoire, explique Martin Corcoran. Nous sommes particulièrement intéressés à découvrir la fonction des variantes du TCR que nous avons. hérité des ancêtres néandertaliens. La fréquence de ces variantes chez l’homme moderne suggère une fonction avantageuse dans notre biologie et nous tenons à le comprendre », ajoute Martin Corcoran.
Les découvertes et la nouvelle base de données de gènes TCR que les chercheurs publient maintenant peuvent être d’une grande importance dans le développement de nouvelles approches thérapeutiques à l’avenir.
« La compréhension de la génétique humaine est fondamentale pour le développement de traitements ciblés. Les méthodes décrites dans l’étude offrent de nouvelles opportunités, notamment dans le domaine du cancer où les lymphocytes T sont au cœur de plusieurs formes prometteuses d’immunothérapie », déclare Gunilla Karlsson Hedestam.
Les résultats peuvent également éclairer d’autres domaines de recherche.
« Les découvertes peuvent conduire au développement de nouveaux diagnostics et thérapies dans une gamme de disciplines médicales, y compris la médecine de précision », déclare Gunilla Karlsson Hedestam.
Quelle est la prochaine étape de votre recherche ?
« Nous étudions actuellement la signification fonctionnelle de plusieurs des variantes de gènes nouvellement découvertes et comment cette variation affecte nos réponses des lymphocytes T. Nous prévoyons également des études approfondies impliquant de grands groupes d’individus pour examiner le rôle de la variation du gène TCR dans les maladies que nous connaissons. impliquent des lymphocytes T, comme les maladies infectieuses, le cancer et les maladies auto-immunes », explique Gunilla Karlsson Hedestam.
Le financement principal de l’étude provient d’une subvention avancée de l’ERC et du Conseil suédois de la recherche.
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