Une étude montre comment les retards moteurs et l'hypotonie peuvent aider les cliniciens à diagnostiquer précocement les troubles génétiques chez les enfants, tout en éliminant les obstacles auxquels certains sont confrontés pour accéder à ces tests qui changent la vie.
Étude : Facteurs cliniques associés au diagnostic génétique en cas de suspicion de troubles neurogénétiques dans une clinique de soins tertiaires. Crédit d'image : Chinnapong/Shutterstock
Une étude récente dans la revue La génétique en médecine a étudié les facteurs phénotypiques ou cliniques liés aux diagnostics génétiques chez les personnes atteintes de maladies neurodéveloppementales (NDD).
Sur la base de ces facteurs, les chercheurs ont généré un arbre de décision pour aider les cliniciens à identifier les individus susceptibles d'être testés positifs aux tests génétiques.
Sommaire
Arrière-plan
Les TND, notamment les troubles du spectre autistique (TSA), la déficience intellectuelle et les retards de développement globaux, sont hautement héréditaires et affectent les patients tout au long de leur vie.
Les progrès récents dans les tests génomiques ont permis à davantage de personnes atteintes de maladies neurodéveloppementales de recevoir un diagnostic génétique.
Des études rapportent plusieurs variantes génétiques dans les NDD. Ces variantes incluent les réarrangements chromosomiques, les délétions, les insertions, le nombre de copies (CNV) et les variantes mononucléotidiques (SNV).
Des études antérieures ont montré que les patients NDD avec un diagnostic génétique sont plus susceptibles de développer des comorbidités telles que des troubles de la motilité gastro-intestinale, l'épilepsie, une maladie cardiaque, une maladie rénale et des problèmes urinaires que ceux sans diagnostic génétique.
De même, les patients atteints de TSA avec un diagnostic génétique ont une probabilité accrue d'avoir des retards moteurs que ceux atteints de TSA mais sans diagnostic génétique.
À propos de l'étude
Dans la présente étude, des chercheurs américains ont étudié les facteurs cliniques liés aux diagnostics génétiques chez les individus atteints de maladies neurodéveloppementales.
L’échantillon de l’étude comprenait des personnes se présentant à la clinique de soins tertiaires Care and Research in Neurogenetics (CARING) de l’Université de Californie à Los Angeles (UCLA).
Les chercheurs ont examiné rétrospectivement les dossiers neurodéveloppementaux de 316 personnes fréquentant la clinique entre janvier 2014 et janvier 2019. Ils ont classé les individus selon les rapports de tests génétiques.
Les chercheurs ont obtenu les données des participants à partir des dossiers médicaux électroniques. Les tests génétiques comprenaient les tests du syndrome du X fragile, les puces à ADN chromosomiques (CMA), les tests d'acide désoxyribonucléique (ADN) mitochondrial, le séquençage de l'exome (ES) et le séquençage d'un seul gène.
Les participants avaient des troubles neurogénétiques suspectés ou connus et ont effectué un ou plusieurs tests génétiques. Les chercheurs ont extrait les variantes génétiques des rapports cliniques et les ont classées comme probablement bénignes, probablement pathogènes (LP), pathogènes (P) ou variantes de signification incertaine (VUS).
Sur la base des variantes, les chercheurs ont divisé les participants en groupes pathogènes ou pathogènes probables, groupe d’étude négatif et groupe ES négatif.
Le groupe LP/P comprenait des individus dont les rapports de tests génétiques montraient des variantes LP/P ou d’autres diagnostics moléculaires précis. Le groupe d'étude négatif comprenait des individus dont les tests génétiques n'ont montré aucune variante LP/P mais peuvent présenter des variantes génétiques bénignes, des variantes VUS ou aucune variante. Les individus du groupe ES négatif ont complété ES sans variantes LP, P ou VUS.
Les chercheurs ont examiné l’âge auquel les individus s’asseyaient pour la première fois, marchaient, prononçaient un mot et prononçaient la première phrase. Ils ont également analysé les antécédents de retards moteurs, d'hypotonie, de retards de langage, de convulsions, de maladies neurologiques, de cardiopathies congénitales, de trouble déficitaire de l'attention avec hyperactivité (TDAH), de microcéphalie, de macrocéphalie, de périmètre crânien et d'interventions précoces.
Les régressions logistiques ont déterminé des rapports de cotes (OR), contrôlés par l'âge, l'origine ethnique et d'autres variables telles que le statut socio-économique, mesurés par l'indice de défavorisation régional (ADI). L'analyse de l'arbre de classification et de régression (CART) a identifié des variables qui font la distinction entre les individus avec et sans diagnostic génétique.
L’équipe a déterminé les retards moteurs en suivant les directives précoces de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) et des Centers for Disease Control and Prevention (CDC).
Les interventions précoces comprenaient celles reçues pour des troubles du développement avant l'âge de trois ans. La macrocéphalie dénotait une circonférence occipitofrontale d'un individu dépassant la moyenne de deux écarts types. Les individus atteints de microcéphalie avaient une circonférence occipitofrontale inférieure de deux écarts types à la moyenne.
Résultats
Parmi les 316 participants, 246 ont effectué des tests génétiques, dont 152 (62 %) présentaient une variante LP/P. Les 94 autres personnes n'en présentaient aucune, bénigne ou une variante du VUS (c'est-à-dire le groupe de tests négatifs).
Dans le groupe LP/P, 62 individus ont reçu des diagnostics génétiques, dont 12 variantes partagées et 50 variantes uniques. L'âge moyen de présentation était de neuf ans.
Les personnes dont les tests génétiques étaient positifs étaient généralement des femmes et avaient des antécédents d'hypotonie, de retards moteurs, d'intervention précoce et de maladie cardiaque congénitale.
L'analyse CART a montré que 75 % des personnes présentant un retard moteur ont reçu un diagnostic génétique. Parmi les individus sans hypotonie, les retards moteurs, l’âge de marche et l’âge lors de l’évaluation initiale étaient des prédicteurs cruciaux des diagnostics génétiques.
Les individus présentant des retards moteurs étaient plus susceptibles d'avoir une variante LP/P que ceux sans de tels retards, par rapport aux cohortes négatives (OR : 4,3) et ES-négatives (OR : 6,0).
Un retard d'un mois dans l'âge de marcher a augmenté la probabilité d'être porteur d'une variante LP/P de 5 à 11 %, reflétant une forte association avec les étapes du développement. Par rapport au groupe ES-négatif, les retards de langage étaient également significativement liés à la présence de variantes LP/P (OR, 3,2).
L'étude révèle que l'hypotonie et les retards moteurs sont associés à des maladies génétiques chez les enfants atteints de troubles du développement neurologique. Il suggère que les cliniciens devraient dépister les déficiences motrices et envisager des tests génétiques pour les patients souffrant d'hypotonie.
Disparités socio-économiques dans l’accès aux tests génétiques
L’étude a également mis en évidence des disparités dans l’accès aux tests génétiques, influencées par des facteurs socio-économiques. Les participants qui n'ont pas effectué le séquençage de l'exome (ES) avaient tendance à vivre dans des quartiers plus défavorisés, tels que mesurés par l'indice de privation de zone (ADI). Ces patients étaient également plus susceptibles d’avoir un statut d’assurance incertain, ce qui rendait plus difficile l’accès à des tests génétiques avancés.
Cela souligne la nécessité d’un accès équitable aux services de diagnostic génétique pour garantir que tous les patients, quel que soit leur statut socio-économique, puissent bénéficier de ces progrès.
De futures études à grande échelle pourraient créer des outils d’aide à la décision cliniquement bénéfiques pour stratifier les patients atteints de NDD en vue de tests génétiques, améliorant ainsi la précision et l’accessibilité du diagnostic, en particulier pour les populations mal desservies.
