Les scientifiques collaborent pour surveiller l’ARN du SRAS-CoV-2 chez les espèces animales domestiques et en liberté

Dans une récente étude publiée sur bioRxiv* serveur de prétirage, les chercheurs ont collaboré avec des partenaires communautaires pour surveiller les infections à coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) chez les animaux domestiques et en liberté ayant une sensibilité connue au virus dans l’Ohio, aux États-Unis (États-Unis).

Arrière plan

La pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) est présumée être d’origine zoonotique, et l’agent étiologique SARS-CoV-2 est connu pour infecter près de 25 espèces. La capacité du virus à infecter et à se transmettre entre plusieurs espèces est préoccupante car les populations animales peuvent agir comme des réservoirs viraux, entraînant la réémergence du virus avec de nouvelles mutations et des capacités d’évasion immunitaire améliorées.

Alors que des études avec des modèles animaux et des enquêtes sur la structure de l’enzyme de conversion de l’angiotensine-2 (ACE-2) ont rapporté le potentiel d’infection à large hôte du SRAS-CoV-2, la surveillance des populations animales, en particulier celles qui entrent en contact avec l’homme, est essentiel pour réduire la possibilité de réémergence virale.

À propos de l’étude

Dans la présente étude, les chercheurs se sont concentrés sur les espèces animales connues pour être sensibles au SRAS-CoV-2 ; se trouvaient à proximité d’environnements humains tels que des animaux de compagnie, des animaux dans des hôpitaux ou des zoos pour animaux sauvages et des animaux agricoles ; ou ceux à haut risque d’infections tels que les animaux médicalement compromis dans les hôpitaux vétérinaires ou ceux qui sont hébergés de manière dense dans des granges et des abris.

Les échantillons ont été prélevés dans divers endroits de l’Ohio, notamment des centres de protection de la faune, des zoos, des aquariums, des hôpitaux vétérinaires, des sociétés de protection des animaux, des centres de sensibilisation, des parcs métropolitains et des foires de comté. De plus, des échantillons ont également été prélevés par des citoyens privés tels que des chasseurs et des trappeurs pour l’étude.

Les échantillons comprenaient des prélèvements oropharyngés, nasaux, conjonctivaux, rectaux ou choanaux, selon l’animal. Dans certains cas, des écouvillons ont été prélevés sur plusieurs jours pour s’assurer que les infections potentielles n’étaient pas manquées pendant les tests. Pour les animaux présentant une sensibilité connue au SRAS-CoV-2, tels que les furets et les chats, plusieurs types d’échantillons par écouvillonnage ont été collectés lorsque cela était possible. La réaction en chaîne par polymérase de transcriptase inverse en temps réel (rRT-PCR) a été utilisée pour tester les échantillons pour l’acide ribonucléique (ARN) du SRAS-CoV-2.

Résultats

Les résultats ont rapporté que l’ARN du SRAS-CoV-2 n’a été détecté chez aucun des 800 animaux couvrant 34 espèces qui ont été testés sur 16 mois, malgré l’augmentation de la prévalence des infections par le SRAS-CoV-2 parmi les populations humaines à l’époque.

Cependant, les auteurs ont discuté du fait que l’absence d’ARN du SRAS-CoV-2 dans leurs échantillons de test pourrait être due à des changements dans la dynamique de l’infection. Alors que la présente étude n’a trouvé aucune preuve d’ARN du SRAS-CoV-2 dans les 78 échantillons nasaux prélevés sur des cerfs en liberté entre octobre et novembre 2020, une autre étude menée entre janvier et mars 2021 a rapporté que 129 des 360 (35 %) libres -les cerfs éloignés étaient positifs pour le SRAS-CoV-2.

Les auteurs pensent que puisque cette dernière étude a testé les populations de cerfs après que le COVID-19 ait atteint un pic parmi les populations humaines et après la saison de chasse au cerf dans l’Ohio, l’augmentation des infections par le SRAS-CoV-2 parmi la population de cerfs pourrait être le résultat d’une augmentation contact direct ou indirect avec l’homme.

De plus, des études similaires menées à travers les États-Unis ont signalé une infection généralisée par le SRAS-CoV-2 parmi les populations de cerfs. L’absence initiale d’infections par le SRAS-CoV-2 parmi les populations de cerfs n’a pas non plus exclu la menace de réémergence du COVID-19 à partir des réservoirs animaux. De plus, la réémergence du virus à partir de réservoirs animaux avait déjà été observée chez les chats, les visons, les hamsters et éventuellement les cerfs.

L’une des limites de la présente étude était que les animaux n’étaient testés que pour l’ARN du SRAS-CoV-2 et non pour les anticorps anti-SRAS-CoV-2, ce qui aurait aidé à détecter des infections antérieures au SRAS-CoV-2 et indiqué la susceptibilité potentiel de l’espèce animale.

Alors que la plupart des études de surveillance du SRAS-CoV-2 ont porté sur des animaux d’élevage, les populations de visons, de cerfs et de chauves-souris en liberté sont connues pour être des réservoirs potentiels du SRAS-CoV-2, tout comme les souris sylvestres, que l’on trouve partout en Amérique du Nord. La surveillance des infections par le SRAS-CoV-2 parmi les espèces animales en liberté est essentielle car les infections généralisées par le SRAS-CoV-2 parmi les espèces animales peuvent avoir un impact non seulement sur la santé, mais aussi sur d’autres aspects de la vie, tels que l’agriculture, l’économie et la santé des écosystèmes.

conclusion

Dans l’ensemble, les résultats suggèrent que bien que cette étude de surveillance à grande échelle du SARS-CoV-2 n’ait détecté l’ARN du SARS-CoV-2 dans aucune des 34 espèces animales domestiques et en liberté testées dans l’Ohio, l’absence de SARS-CoV- 2 infections ne peuvent pas exclure le potentiel de réservoirs viraux existant dans ces populations.

Les animaux en liberté tels que les visons, les cerfs, les chauves-souris et les souris sylvestres sont connus pour être sensibles au SRAS-CoV-2, et il est important de surveiller les infections par le SRAS-CoV-2 non seulement chez les espèces animales domestiques, mais aussi en liberté. diverses populations animales susceptibles d’entrer en contact avec l’homme.

*Avis important

bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.