Une équipe de chercheurs biomédicaux basés à San Antonio a formé un algorithme d'apprentissage automatique pour identifier plus de deux douzaines de traitements viables pour les maladies causées par des agents pathogènes zoonotiques qui peuvent sauter des hôtes animaux pour infecter les humains. Des scientifiques du Southwest Research Institute (SWRI), de l'Université du Texas de San Antonio (UTSA) et du Texas Biomedical Research Institute (Texas Biomed) ont utilisé le logiciel Rhodium ™ développé par SWRI pour étudier la Nipah Bat-Borne et Hendra Henipavirus, qui sont endémiques dans certaines parties du monde et cause en particulier les infections létales dans les humains.
Grâce à la collaboration, les chercheurs ont cartographié la structure des protéines du virus de la rougeole, qui se trouve dans la même famille de virus que les henipavirus. Avec la rougeole en tant que plan, le rhodium a pratiquement dépisté et classé les composés pour les structures correspondantes et l'efficacité de liaison. Sur 40 millions de composés, le rhodium a identifié 30 inhibiteurs viraux potentiellement viables pour Nipah et Hendra. Bien que la recherche se soit concentrée sur les traitements antiviraux pour les hélipavirus, tout thérapeutique à large spectre développé pourrait potentiellement traiter les virus apparentés, y compris la rougeole.
« Les résultats suggèrent que l'apprentissage automatique peut identifier rapidement les candidats antiviraux à des virus hautement pathogènes qui sont difficiles à étudier en raison des limitations de l'espace et des contraintes de biosécurité », a déclaré le Dr Jonathan Bohmann, scientifique du personnel à SWRI, qui a présenté ces résultats à la conférence internationale Hendra @ 30 Henipavirus à Melbourne, en Australie. « Nos algorithmes nous permettent de faire le meilleur usage des ressources pour fournir une » liste restreinte « de traitements potentiels pour des tests supplémentaires. »
Cette recherche du ministère de la Défense est financée par le programme de recherche médicale évaluée par des pairs (PRMRP), dans le cadre des programmes de recherche médicale dirigés par le Congrès (CDMRP), et ouvre la porte à la recherche de traitements pour Nipah et Hendra. Selon l'Organisation mondiale de la santé, 40 à 75% des personnes infectées par ces maladies meurent.
Les Henipavirus sont des agents pathogènes mortels. Ils sont endémiques pour les populations animales en Asie et en Australie, mais des épreuves de réévolution du bétail et des humains se produisent régulièrement sur une base saisonnière, ce qui est préoccupant en raison du potentiel pandémique. «
Dr Jonathan Bohmann, scientifique du personnel chez SWRI
L'étude de ces maladies infectieuses nécessite une adhésion à des normes de sécurité strictes et à l'accès à un laboratoire de haut niveau BSL-4. En sélectionnant pratiquement les composés, les chercheurs économisent du temps et des ressources.
« Notre travail met en évidence le pouvoir des recherches collaboratives et multidisciplinaires de nos institutions de San Antonio pour rassembler une stratégie complète et cohésive pour développer de nouveaux candidats antiviraux », a déclaré le Dr Stanton McHardy, professeur à l'Université du Texas de San Antonio et directeur de la chimie médicinale et de la centrale de synthèse de la Center for Innovative Drug Discovery.
« Le rhodium fait un très bon travail pour contrôler les composés toxiques et trouver des inhibiteurs efficaces de la maladie », a déclaré le Dr Olena Shtanko, professeur adjoint à Texas Biomed, qui a collaboré avec McHardy et Bohmann en évaluant l'efficacité des composés antiviraux identifiés par le rhodium. « Nous avons fait pas mal de progrès en peu de temps, mais des recherches supplémentaires sont nécessaires. »
Le département pharmaceutique et bio-ingénierie de SWRI fournit des installations inspectées par la FDA qui répondent aux bonnes normes de pratique de fabrication actuelles.
