Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont évalué l’évasion de la neutralisation des sous-lignées Omicron du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2).
Étude : Évasion de neutralisation par les variantes SARS-CoV-2 Omicron BA.2.12.1 et BA.4/BA.5. Crédit d’image : NIAID
Sommaire
Arrière-plan
Récemment, lors de la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), plusieurs lignées SARS-CoV-2 Omicron (B.1.1.529) ont émergé, BA.2 et BA.1 démontrant une résistance significative aux anticorps neutralisants (NAbs). Actuellement, aux États-Unis (US), la variante Omicron BA.2.12.1 est devenue dominante, alors que BA.4 et BA.5 étaient dominantes en Afrique du Sud. Fait intéressant, les séquences de protéines de pointe (S) des sous-lignées Omicron BA.5 et BA.4 sont similaires. Cependant, la capacité des variantes SARS-CoV-2 Omicron BA.2.12.1, BA.4 et BA.5 à éviter les NAb générés par le COVID-19 ou sa vaccination n’a pas encore été décrite.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont analysé les titres NAb des variantes SARS-CoV-2 WA1/2020, Omicron BA.2, BA.1, BA.4, BA.5 et BA.2.12.1 dans deux séries de cohortes. Les cohortes de l’étude étaient 1) 27 personnes vaccinées par le vaccin BNT162b2 à deux doses d’acide ribonucléique messager (ARNm) COVID-19 et 2) 27 sujets infectés par Omicron BA.2/BA.1.
Les personnes ayant des antécédents de COVID-19, une sérologie positive à la nucléocapside (N) du SRAS-CoV-2, les receveurs d’autres vaccins COVID-19 ou prenant des médicaments immunosuppresseurs ont été exclues de la cohorte vaccinale. De plus, toutes les personnes sauf une dans la cohorte d’infection Omicron ont été vaccinées contre le COVID-19. De plus, les échantillons ont été prélevés environ 29 jours après le diagnostic du SARS-CoV-2.
Résultats et conclusions
Selon les résultats de l’étude, six mois après les vaccinations à deux doses de BNT162b2, les titres médians de pseudovirus NAb contre la souche SARS-CoV-2 WA1/2020 étaient de 124 mais inférieurs à 20 pour toutes les sous-lignées Omicron. Les niveaux médians de NAb ont considérablement augmenté à 275, 410, 829, 900 et 5 783 pour les variantes Omicron BA.4/BA.5, BA.2.12.1, BA.2, BA.1 et WA1/2020, respectivement , deux semaines après la dose de rappel. Ces données impliquent que les niveaux médians de NAb de BA.4/BA.5, BA.2.12.1, BA.2 et BA.1 avaient une baisse de 21,0, 14,1, 7,0 et 6,4 fois, respectivement, relative à WA1/2020. En outre, les concentrations médianes de NAb de BA.2.12.1 et BA.4/BA.5 étaient respectivement 2,2 et 3,3 fois inférieures à celles de BA.1.
Neutraliser les réponses des anticorps aux sous-variants d’Omicron. UN. Caricature montrant les mutations BA.1, BA.2, BA.2.12.1, BA.4 et BA.5 dans le SARS-CoV-2 Spike. BA.4 et BA.5 ont des séquences Spike identiques. NTD, domaine N-terminal ; RBD, domaine de liaison aux récepteurs ; RBM, motif de liaison au récepteur ; SD1, sous-domaine 1 ; SD2, sous-domaine 2 ; FP, peptide de fusion ; HR1, heptade répétée 1 ; HR2, répétition heptadique 2
Dans le groupe d’infection par Omicron, les niveaux médians de NAb étaient de 590, 1 150, 1 910, 1 740 et 11 050 pour les sous-variants Omicron BA.4/BA.5, BA.2.12.1, BA.2, BA.1 et WA1/2020. , respectivement. Ces résultats indiquent une diminution de 18,7, 9,6, 5,8 et 6,4 fois des concentrations médianes de NAb de BA.4/BA.5, BA.2.12.1, BA.2 et BA.1, respectivement, par rapport à WA1/2020. En outre, les concentrations médianes de NAb de BA.4/BA.5 et BA.2.12.1 étaient 2,9 et 1,5 fois inférieures à celles de BA.1.
Neutraliser les réponses des anticorps aux sous-variants d’Omicron. Titres d’anticorps neutralisants (NAb) par un test de neutralisation de pseudovirus basé sur la luciférase chez des individus six mois après la vaccination initiale avec BNT162b2 (Prime) et deux semaines après un rappel avec BNT162b2 (Boost). C. Titres NAb chez les individus suite à une infection par BA.1 ou BA.2. Tous ont été vaccinés à l’exception d’un individu avec des titres NAb négatifs. Les réponses NAb ont été mesurées par rapport aux variantes SARS-CoV-2 WA1/2020, Omicron BA.1, BA.2, BA.2.12.1 et BA.4/BA.5. Les médianes (barres rouges) sont représentées et affichées numériquement avec des différences de pli.
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont montré que les variantes Omicron BA.2.12.1, BA.5 et BA.4 échappent notamment aux NAb provoqués par l’infection et la vaccination par le SRAS-CoV-2. De plus, les concentrations de BA.5/BA.4 NAb, et dans une moindre mesure les niveaux de BA.2.12.1 NAb, étaient inférieures aux titres de BA.2 et BA.1 NAb, ce qui implique que la variante SARS-CoV-2 Omicron a évolué avec des traits d’évasion de neutralisation significatifs. Ces données ont une immense pertinence pour la santé publique et offrent des informations immunologiques pour les flambées actuelles de BA.2.12.1, BA.5 et BA.4 dans les zones à taux de vaccination SRAS-CoV-2 élevés et à infection BA.2/BA.1.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
