Dans une récente revue et méta-analyse publiée dans le Médecine BMC Journal, les chercheurs ont évalué des travaux antérieurs menant des essais contrôlés sur des patients subissant une antibiothérapie avec et sans supplémentation en antibiotiques.
Leurs résultats ont montré que la supplémentation en probiotiques ne modifiait pas la diversité du microbiome intestinal entre les cohortes de cas et de témoins, ce qui contredit la croyance populaire.
Étude: La supplémentation en probiotiques pendant le traitement antibiotique est injustifiée pour maintenir la diversité du microbiome intestinal : une revue systématique et une méta-analyse. Crédit d’image : FOTOGRIN/Shutterstock.com
Sommaire
Effets des antibiotiques sur la flore intestinale
Les antibiotiques sont connus pour altérer qualitativement le microbiote intestinal, diminuant considérablement les densités de certaines espèces et, dans des cas extrêmes, les conduisant à l’extinction.
Cela se traduit par un microbiome intestinal à faible diversité et permet aux bactéries potentiellement pathogènes, y compris Staphylococcus aureus, Clostridioides difficileet Clostridium perfringens, pour dominer les communautés bactériennes intestinales. Ce déséquilibre, appelé «dysbiose», a été associé à de nombreux problèmes de santé tels que le dysfonctionnement neurologique, le syndrome inflammatoire de l’intestin et le cancer.
Le microbiote intestinal retrouve généralement sa normalité sans intervention médicale. Cependant, la durée de récupération peut varier considérablement en fonction de la dose, du spectre et de la durée du traitement antibiotique, de l’âge du patient et, surtout, du temps entre les traitements antibiotiques successifs.
Des recherches antérieures ont estimé à deux semaines cette récupération chez les jeunes adultes en bonne santé, mais cela augmente considérablement si un nouveau traitement antibiotique est administré avant que la normalité ne soit atteinte.
Les probiotiques, des préparations contenant des bactéries vivantes, des levures ou des combinaisons de ces microbes, sont souvent prescrits pour prévenir ou inverser la dysbiose. La recherche a étudié les résultats cliniques de l’apport de probiotiques pendant le traitement, avec divers rapports sur leur efficacité dans la restauration du microbiote après le traitement. Cependant, leurs impacts sur la diversité du microbiote fécal restent insuffisants.
Des différences interindividuelles significatives dans les espèces de la flore intestinale ont historiquement confondu les définitions de la «composition normale du microbiote intestinal», rendant difficile l’établissement de méthodes de mesure standardisées.
Les chercheurs et les cliniciens empruntent aux mesures de la diversité écologique, en particulier aux indices de diversité α et β, pour rendre compte de l’abondance et de la diversité de la communauté intestinale. La diversité α est la diversité au sein d’un échantillon, tandis que la diversité β est la diversité entre différents ensembles d’échantillons.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé des approches méta-analytiques pour évaluer les effets des suppléments probiotiques sur le maintien ou la restauration de la diversité du microbiote intestinal pendant le traitement antibiotique.
Ils ont commencé par rassembler 19 596 enregistrements des bases de données Medline, Embase et Cochrane Central Register of Controlled Trials (CENTRAL). Ils ont ensuite utilisé le format PICO-S (population, intervention, comparaison, résultat et conception de l’étude) pour sélectionner les études.
La sélection des titres, des résumés et du texte intégral a permis d’identifier 15 publications pour la synthèse qualitative (revue) et cinq pour la quantitative (méta-analyse). L’examen comprenait 887 patients, tandis que les méta-analyses ont rapporté 335 patients. Les chercheurs ont extrait les caractéristiques des études, les détails des cohortes, les descriptions des antibiotiques et des probiotiques et les résultats de chaque étude.
Les indices de diversité de Shannon et les unités taxonomiques opérationnelles (OTU) observées ont ensuite été calculés pour les analyses quantitatives.
Enfin, les évaluations des biais et de la certitude ont été menées à l’aide des outils Cochrane de risque de biais (RoB2) et Grading of Recommendations, Assessment, Development and Evaluation (GRADE), respectivement.
Résultats de l’étude
La présente revue et méta-analyse n’a pas révélé que la consommation de probiotiques peut prévenir la dysbiose induite par les antibiotiques.
La diversité du microbiome intestinal de Shannon entre les cas (patients consommant des probiotiques) et les témoins (ceux ne consommant pas de probiotiques) était, en moyenne, de seulement 0,23 (non significatif), une seule des cinq études incluses montrant une différence statistique entre les cohortes. Les résultats de l’OTU étaient similaires, sans différences observables entre les cohortes de cas et de témoins.
Trois des neuf études rapportant des indices de diversité α ont montré des améliorations des indices de diversité α entre le cas et les groupes sous supplémentation en probiotiques. Pourtant, ces signaux étaient faibles et restaient inexpliqués.
Une seule des cinq études faisant état de la diversité β a montré des améliorations pour les cohortes de cas. Cependant, ceux-ci n’étaient pas suffisamment importants pour mériter la réputation positive dont jouissent actuellement les probiotiques.
Les analyses taxonomiques du microbiome intestinal ont révélé qu’au niveau du phylum, Firmicutes et Bacteroidetes représentation a considérablement diminué et ont été remplacés par Protéobactéries suite à l’administration d’antibiotiques.
Ces résultats étaient cohérents quelle que soit la cohorte testée. Ces altérations ont été spontanément rectifiées en 56 jours maximum, les probiotiques n’ayant pas contribué à l’accélération de la normalité.
Au niveau du genre, il a été démontré que la supplémentation en probiotiques maintient le niveau de Bifidobactérie genre, qui dans le groupe témoin a diminué pendant le traitement antibiotique. Il a fallu un maximum de 35 jours aux personnes ne consommant pas de probiotiques pour revenir aux niveaux d’avant le traitement.
conclusion
Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé une approche systématique et une méta-analyse distincte pour évaluer les avantages de la consommation de probiotiques sur le maintien du microbiote intestinal pendant le traitement antibiotique.
Leurs résultats démystifient la notion selon laquelle la consommation de probiotiques pendant le traitement peut empêcher ou inverser les alternances de la flore intestinale, un résultat caractéristique de l’administration d’antibiotiques.
Aucun changement dans le microbiote intestinal n’a été observé entre les patients qui consommaient des probiotiques et ceux qui n’en consommaient pas dans la méta-analyse des unités taxonomiques opérationnelles observées. Les indices de diversité de Shannon ont rapporté des résultats similaires, une seule étude rapportant de légères améliorations dans les mesures de diversité sur la consommation de probiotiques.
L’analyse qualitative a révélé que trois des neuf études et une des cinq études amélioraient les indices de diversité α et β, respectivement. Cependant, ceux-ci étaient temporaires et pas assez notables pour recommander les probiotiques comme remède thérapeutique contre la dysbiose.
« La tendance à la restauration du microbiome après une période de suivi de 3 à 8 semaines, indépendamment de la supplémentation en probiotiques et de la rémission des différences entre les groupes d’intervention et de contrôle, remet en question les avantages de la supplémentation en probiotiques de routine pendant le traitement antibiotique.”
