Conclusion: Sur les 198 nouveaux médicaments oncologiques approuvés par la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis entre 1998 et 2022, environ 43 % étaient des thérapies oncologiques de précision, dont l’utilisation est guidée par des tests de biomarqueurs.
Revue dans laquelle l’étude a été publiée : Découverte du cancerune revue de l’Association américaine pour la recherche sur le cancer (AACR).
Auteurs: Debyani Chakravarty, PhD, assistant généticien moléculaire au Département de pathologie et de médecine de laboratoire et scientifique principal de la base de connaissances en oncologie de précision OncoKB du Memorial Sloan Kettering Cancer Center (MSK), était l’auteur principal de l’étude. Sarah P. Suehnholz, PhD, scientifique principale, OncoKB chez MSK, a été la première auteure.
Arrière-plan: « Pour cette étude, nous marquons le début du domaine de l’oncologie de précision en 1998 avec l’approbation du trastuzumab (Herceptin), l’une des premières thérapies moléculairement ciblées indiquées pour le cancer du sein HER2-positif. Depuis lors, le domaine s’est développé de façon exponentielle avec la découverte de nouveaux biomarqueurs et les approbations de médicaments correspondantes, en partie grâce à une diminution progressive du coût du séquençage génomique et aux améliorations de la technologie de séquençage », a déclaré Chakravarty. « À notre connaissance, il n’y a pas eu d’évaluation systématique de l’ampleur de la croissance de ce domaine et de la mesure dans laquelle son expansion a bénéficié aux patients atteints de cancer. »
Comment l’étude a été menée : Pour quantifier l’expansion et l’impact de l’oncologie de précision, Chakravarty et ses collègues ont examiné les médicaments oncologiques approuvés par la FDA de 1998 à 2022. « Nous avons défini une thérapie oncologique de précision comme un médicament qui est le plus efficace dans un sous-ensemble de patients défini moléculairement et pour lequel un profilage moléculaire avant le traitement est nécessaire pour une sélection optimale des patients », a déclaré la première auteure Sarah P. Suehnholz, PhD, scientifique principale chez OncoKB chez MSK.
Dans la deuxième partie de l’étude, les chercheurs ont utilisé deux versions d’OncoKB, déployées en 2017 et 2022, pour évaluer l’exploitabilité clinique des altérations génétiques détectées par le test de séquençage MSK-IMPACT dans un ensemble de 47 271 échantillons de tumeurs solides. Par exemple, les auteurs ont déterminé si une certaine mutation dans la tumeur d’un patient, considérée comme prédictive de la réponse à un médicament expérimental en 2017, était ensuite reconnue comme un biomarqueur prédictif de la réponse à un médicament approuvé par la FDA en 2022. Les données génomiques utilisées dans cette étude L’étude est accessible au public via le projet AACR GENIE, un registre de données clinico-génomiques réelles rassemblées grâce au partage de données entre centres internationaux de lutte contre le cancer.
Résultats: Parmi les 198 nouveaux médicaments oncologiques approuvés par la FDA, 82,8 % ont été classés comme thérapies moléculaires ciblées, c’est-à-dire des médicaments dont le mécanisme d’action est connu mais qui ne nécessitent pas de tests de biomarqueurs pour la sélection des patients. Environ 43 % (86 sur 198) ont été classés comme médicaments oncologiques de précision. Il s’agit notamment des inhibiteurs de kinases, des anticorps monoclonaux, des inhibiteurs de petites molécules, des conjugués anticorps-médicament et des inhibiteurs de points de contrôle immunitaires, entre autres, qui nécessitent tous un dépistage de biomarqueurs génomiques pour la sélection des patients.
L’analyse a montré une lente expansion du taux d’approbations par la FDA des thérapies oncologiques de précision de 1998 à 2017 et une augmentation rapide de 2017 à 2022. « Le nombre le plus élevé a été enregistré en 2020, avec 12 approbations de la FDA, et ce nombre semble diminuer. 2021 et 2022, ce qui suggère que nous avons peut-être atteint le sommet des thérapies oncologiques de précision basées sur un seul biomarqueur », a déclaré Chakravarty. « Cette découverte souligne également la nécessité d’approches combinées innovantes capables de traiter de multiples altérations génomiques, ainsi que de thérapies ciblées efficaces chez les patients dont les tumeurs sont provoquées par des altérations de gènes suppresseurs de tumeurs ou de facteurs de transcription courants. »
Pour évaluer l’innovation dans le domaine, les chercheurs ont en outre classé les thérapies oncologiques de précision en quatre catégories en fonction de la nouveauté de leur mécanisme d’action. Ils ont constaté que 42 % de ces médicaments opéraient selon un mécanisme d’action similaire à celui d’un traitement précédemment approuvé ou d’une résistance ciblée à un médicament existant.
« La majorité de ces thérapies ne ciblent que sept biomarqueurs, ce qui met en évidence la portée étroite du développement de médicaments oncologiques de précision au cours de cette période », a ajouté Chakravarty. « Plusieurs cibles sont restées inutilisables depuis 1998. Nous faisons maintenant des progrès avec certaines, par exemple en ciblant des formes mutantes spécifiques de KRAS, mais nous devons continuer à augmenter le nombre d’altérations génétiques exploitables. »
Les résultats de la deuxième partie de l’étude ont montré que la fraction des échantillons de patients présentant des altérations génomiques qui les rendent éligibles à un traitement avec des thérapies oncologiques de précision standard ou à l’inscription à un essai clinique avec des données cliniques prometteuses a presque doublé (de 18,1 % à 35,9 %) de 2017 à 2022. En parallèle, il y a eu une diminution de près de 50 % (de 44,2 % à 22,8 %) de la fraction d’échantillons présentant des altérations oncogènes qui ne peuvent actuellement pas donner lieu à une action.
Commentaires de l’auteur : « Malgré la croissance spectaculaire de ce domaine, l’impact clinique de l’oncologie de précision fait toujours l’objet de débats. En cartographiant minutieusement et systématiquement le paysage de l’oncologie de précision, notre étude a révélé que ces thérapies constituent un pilier des soins actuels en oncologie », a déclaré Chakravarty. « Malheureusement, ces médicaments peuvent être extrêmement coûteux et la couverture d’assurance détermine souvent si un patient les recevra. Nos résultats confirment que la couverture des thérapies oncologiques de précision est essentielle et ne devrait pas être réservée à quelques privilégiés. »
Un autre aspect mis en évidence par cette étude est l’importance des tests génétiques universels qui peuvent aider à développer des traitements ciblant les altérations génomiques rares, quel que soit le site d’origine de la tumeur, a ajouté Chakravarty.
Limites de l’étude : Selon les auteurs, l’une des limites de leur analyse est qu’elle ne permet pas de savoir si les patients ont réellement reçu le traitement de précision pour lequel ils ont été jugés éligibles. « Les patients éligibles peuvent ne pas recevoir de médicament oncologique de précision pour plusieurs raisons liées à leur maladie ou à notre paysage actuel des soins de santé », a déclaré Chakravarty. « Il est également important de noter que tous les patients traités avec une thérapie génomique compatible n’en bénéficieront pas de la même manière. »
Quant aux autres limites, l’étude n’a pas acquis d’informations sur les mutations germinales qui déterminent l’éligibilité à certaines thérapies ciblées, et la population de patients étudiée n’était pas diversifiée. En outre, l’analyse était basée sur les approbations de médicaments de la FDA américaine, et différents pays peuvent avoir des statuts réglementaires et des approches différents en matière d’oncologie de précision, ont expliqué les auteurs.
Financement et divulgations : Le financement de cette étude a été assuré par les National Institutes of Health, les droits de licence commerciale d’OncoKB, un Prostate Cancer Foundation Challenge Award et le Centre Marie-Josée et Henry R. Kravis d’oncologie moléculaire.
