Dans une récente étude publiée sur bioRxiv* serveur de préimpression, des chercheurs de l’Université de Columbia ont caractérisé les réponses réciproques et non réciproques des lymphocytes T contre le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2).
L’immunité des lymphocytes T est essentielle pour des résultats cliniques positifs de l’infection par le SRAS-CoV-2. Par conséquent, l’immunothérapie ou la vaccination cellulaire axée sur les lymphocytes T pourrait s’avérer essentielle pour améliorer la protection contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) chez les patients immunodéprimés (IP). Une mémoire préexistante des lymphocytes T identifiant les antigènes du SRAS-CoV-2 précédant la vaccination ou l’infection au COVID-19 peut être développée en raison d’infections antérieures par des CoV humains endémiques non SRAS (hCoV). Ainsi, les cellules T amorcées par le SARS-CoV-2 peuvent détecter des variantes émergentes du SARS-CoV-2 ou d’autres virus hCoV et modifier le cours des infections hCoV suivantes. Cependant, l’immunité croisée entre le SRAS-CoV-2 et les hCoV nécessite une enquête approfondie.
Étude : La perspective d’une immunité universelle contre les coronavirus : une caractérisation des réponses réciproques et non réciproques des lymphocytes T contre le SRAS-CoV2 et les coronavirus humains courants. Crédit d’image : kittipong053 / Shutterstock
Sommaire
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont exploré les réponses des lymphocytes T observées contre les protéines immunodominantes de la membrane SARS-CoV-2 et hCoV (M), de la nucléocapside (N) et de la pointe (S).
L’équipe a évalué des échantillons en série de cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC) obtenus auprès de volontaires sains et d’individus immunodéprimés qui ont signalé ou non une exposition au SRAS-CoV-2 pour estimer les réponses des lymphocytes T contre les hCoV comme NL63, OC43, HKU1 et 229E, et SRAS-CoV-2. La réactivité aux antigènes immunodominants associés a été testée parmi les Alpha- et bêta-hCoV communs apparentés chez le même donneur d’échantillon.
En outre, les chercheurs ont déterminé si l’immunité des lymphocytes T induite par la vaccination ou naturelle acquise précédemment réagissait de manière croisée contre les variants du SRAS-CoV-2. Ceci a été réalisé en obtenant des PBMC d’individus positifs au COVID-19 et non exposés vaccinés avec au moins un vaccin contre le SRAS-CoV-2. Les cellules T résultantes ont ensuite été évaluées pour leur réactivité contre huit variantes préoccupantes du SRAS-CoV-2 (COV). L’équipe a caractérisé la gamme de réponses des lymphocytes T contre le hCoV en testant la réactivité ex vivo à l’aide de pepmix dérivés d’antigènes N, M, S1 et S2 associés à des hCoV endémiques. De plus, l’étendue des réponses contre les hCoV chez les donneurs COVID-19 positifs et négatifs a été évaluée.
Résultats
Les résultats de l’étude ont montré que l’un des sujets, un travailleur de la santé, a développé le COVID-19 près de trois mois après le prélèvement de l’échantillon initial. Les réponses des lymphocytes T enregistrées au départ contre les antigènes SARS-CoV-2 N, M, S1 et S2 étaient légèrement détectables par rapport au fond, confirmant le statut naïf/non exposé. Les échantillons post-COVID-19 ont révélé une augmentation remarquable de la réactivité contre les quatre antigènes du SRAS-CoV-2 répandus dans le compartiment des lymphocytes T CD4+. L’équipe a noté une réactivité maximale contre l’antigène de la protéine N, suivie de M, S2 et S1. Le schéma et l’ampleur de la réactivité contre les cibles hCoV autres que le SRAS avant et après le COVID-19 sont restés faibles et ont été influencés de manière négligeable par le COVID-19. Par conséquent, ce donneur d’échantillon particulier avait une mémoire des lymphocytes T spécifique à l’antigène hautement ciblée et robuste contre le SRAS-CoV-2 après l’infection.
L’équipe a noté que les donneurs exposés au COVID-19 ont largement maintenu la réponse globale des lymphocytes T CD4+ spécifiques au SRAS-CoV-2 contre les huit COV évalués. Des réductions moyennes de près de 27,8 % contre le SARS-CoV-2 Beta, de 16,2 % contre Gamma et de 22,5 % contre les COV Epsilon ont été observées. De plus, une réduction de 8,5 % a été notée par rapport à Alpha, 5,2 % par rapport à Delta et 0,83 % par rapport aux COV Kappa. Cependant, la réduction la plus élevée de près de 47 % a été notée par rapport au COV Omicron.
Au niveau individuel, la réduction la plus élevée de 33 fois a été signalée chez un patient IP positif au COVID-19 contre la variante Omicron, et deux autres donneurs ont révélé une réduction de deux fois. Notamment, aucun des donneurs n’a présenté une réduction de plus de 10 fois de l’étendue de la réponse des lymphocytes T CD4+ contre d’autres variantes. Alors que trois donneurs ont signalé une réduction de deux fois de la réactivité contre la variante bêta, certains ont signalé une réduction de plus de deux fois contre les variantes Delta, Kappa et Eta par rapport au pool ancestral. Au total, tous les survivants du COVID-19 testés qui ont montré une réactivité contre le pool de peptides WT ont également montré la reconnaissance croisée d’autres variantes contre Delta.
L’équipe a noté que les donneurs COVID-19-positifs et négatifs affichaient des réponses CD8+ spécifiques à l’antigène robustes mais très incohérentes. Dans l’ensemble, une réactivité à au moins un antigène associé à chaque hCoV a été observée chez tous les sujets testés. Cependant, la réponse robuste simultanée contre les quatre antigènes liés à chaque hCoV était remarquablement plus prédominante parmi les échantillons COVID-19 positifs que dans les négatifs.
En outre, une réactivité considérablement plus élevée a été observée contre l’antigène S1 des hCoV NL63 et OC43 chez les survivants du COVID-19 par rapport aux individus SARS-CoV-2-négatifs. Une réactivité plus élevée a également été notée contre les antigènes S2 de NL63 et HKU1, qui ont encore augmenté contre les antigènes S2 de 229E et OC43. L’équipe a également trouvé une association significative entre les réponses COVID-19 et les réponses correspondantes ciblées contre S2 et M d’OC43 ainsi que les antigènes N de HKU1 et OC43. Dans l’ensemble, cela indique une association potentielle entre l’immunité des lymphocytes T déclenchée après une infection par le SRAS-CoV-2 et la réactivité dirigée contre d’autres hCoV. Cela suggérait en outre une réactivité croisée possible et une protection croisée potentielle.
Conclusion
Les résultats de l’étude ont mis en évidence une large immunité des lymphocytes T contre les antigènes du SRAS-CoV-2 observés chez les survivants du COVID-19. Chez les personnes vaccinées et convalescentes, les lymphocytes T spécifiques du SARS-CoV-2 ont détecté efficacement la majorité des variants du SARS-CoV-2. Cependant, la réactivité croisée contre le variant SARS-CoV-2 Omicron a été diminuée de près de 50 %. Les réponses contre les antigènes N, S et M des hCoV endémiques ont été trouvées dans des proportions plus élevées chez les survivants du COVID-19 que chez les individus non exposés. Les chercheurs pensent que la présente étude a soutenu l’hypothèse selon laquelle les vaccins contenant des lymphocytes T anti-CoV largement spécifiques pourraient fournir des immunothérapies efficaces.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.