Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur, les chercheurs ont estimé l’intervalle de série et la période d’incubation des infections par le virus monkeypox (MPXV) pour l’épidémie de 2022 aux États-Unis (États-Unis).
Sommaire
Arrière plan
Les données des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis ont montré 75 568 cas confirmés de MPXV et 34 décès dans 109 sites endémiques et non endémiques jusqu’au 25 octobre 2022. Lors de l’épidémie de MPXV de 2022, la transmission s’est principalement produite par contact sexuel ou étroit avec le des éruptions cutanées infectieuses, des croûtes ou des liquides organiques.
Par la suite, plusieurs patients dans 12 États américains ont déclaré avoir eu de nombreux partenaires sexuels anonymes ou avoir assisté à des festivals trois semaines avant l’apparition des symptômes. Cela a compliqué les efforts pour identifier les paires de cas primaires et secondaires. En outre, cela a compliqué l’établissement de l’intervalle de série pour l’épidémie actuelle de MPXV, un déterminant essentiel de l’évolution d’une épidémie de maladie, et de l’impact des interventions, telles que les vaccins et les médicaments. Notamment, les symptômes du MPXV se manifestent généralement dans les trois semaines suivant l’exposition et peuvent inclure de la fièvre, des maux de tête, des frissons, des ganglions lymphatiques enflés et de l’épuisement. Une éruption cutanée se développe généralement dans un délai d’un à quatre jours après l’apparition des symptômes.
L’intervalle de série est défini comme le temps écoulé depuis l’apparition des symptômes dans un cas primaire et l’apparition dans le cas secondaire. Il détermine le nombre de reproduction effectif (Rt) et prévoit l’incidence d’un agent pathogène infectieux.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont compilé des données sur les dates d’apparition des symptômes et des éruptions cutanées pour les paires de cas primaires et secondaires et leur type de contact à partir de 12 départements de santé d’État et locaux aux États-Unis. Ils ont utilisé les méthodes bayésiennes pour estimer la distribution de l’intervalle sériel pour les paires de cas primaires et secondaires connus pour l’apparition des symptômes et de l’éruption cutanée. Ils ont sélectionné le modèle avec la valeur du critère d’information d’Akaike (AIC) la plus faible.
Ensuite, l’équipe a estimé l’intervalle de série pour l’apparition des symptômes et l’apparition des éruptions cutanées à l’aide de 50 000 échantillons de Markov Chain Monte Carlo (MCMC) et d’un burn-in de 10 000 échantillons. Ils ont évalué la convergence des échantillons MCMC à l’aide des statistiques de Gelman-Rubin. Les chercheurs ont également inclus neuf et quatre cas du district de Columbia et de Floride, respectivement, dans l’analyse de la période d’incubation MPXV de l’étude actuelle.
Résultats de l’étude
Un total de 57 paires de cas répondaient aux critères d’inclusion de l’étude, dont 40 avaient des dates d’apparition de l’éruption cutanée pour les cas primaires et secondaires. L’intervalle de série pour l’apparition des symptômes variait de deux à 25 jours parmi les cas index de MPXV, en partie en raison de la variabilité de la nature et de l’intensité du contact. L’intervalle sériel moyen global estimé pour l’apparition des symptômes et de l’éruption cutanée était de 8,5 et de sept jours, respectivement.
Les auteurs ont noté que 10/14 nouveaux cas (signalés uniquement aux États-Unis) ont été exposés au MPXV en une seule journée. Le temps moyen d’incubation du MPXV depuis l’exposition jusqu’à l’apparition des symptômes était de 5,6 jours, tandis que depuis l’exposition jusqu’à l’apparition de l’éruption cutanée, il était de 7,5 jours pour 36 et 35 cas, respectivement. Fait intéressant, il y avait une association statistiquement significative entre les intervalles de série et les périodes d’incubation dans les cas secondaires.
conclusion
L’intervalle de série MPXV de 8,5 jours pour l’apparition des symptômes dans l’étude actuelle correspondait à l’estimation de 9,8 jours d’une étude menée au Royaume-Uni après correction de la troncature à droite. Cependant, il était beaucoup plus court que le temps de génération de 12,5 jours rapporté par une étude menée en Italie. Selon les auteurs, aucune étude antérieure n’a documenté l’intervalle de série des éruptions cutanées MPXV. Ils ont signalé un intervalle sériel de sept jours pour l’apparition des éruptions cutanées, ce qui était clairement plus long que la période d’incubation des éruptions cutanées de 5,6 jours. Cela suggérait qu’une certaine transmission pré-éruption s’était également produite pour le MPXV.
Pour résumer, l’étude a estimé l’intervalle de série, qui comprenait des estimations de l’apparition d’éruptions cutanées pour l’épidémie actuelle de MPXV aux États-Unis ; en outre, il a démontré sa fiabilité par rapport aux estimations basées sur les symptômes initiaux de la maladie.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
