Optibrium, l'un des principaux développeurs de logiciels et de solutions d'IA pour la conception moléculaire, a annoncé aujourd'hui l'introduction d'une nouvelle interface utilisateur graphique PyMol (GUI) pour Surflex-Dock, sa méthode de conception basée sur la structure de pointe, qui fait partie du Biopharmics 3D de l'entreprise 3D de la société 3D Suite de modélisation moléculaire. L'interface graphique intuitive et hautement visuelle rend le surflex-dock plus facilement accessible aux interactions de modélisation des chimistes computationnelles et médicinales.
Surflex-Dock est une méthode d'amarrage moléculaire hautement automatisée qui fournit un enrichissement d'amarrage de haut niveau en repères indépendants rigoureux. Il a été démontré que sa prédiction de pose précise surpasse d'autres méthodes d'amarrage, donnant une image plus réaliste de la liaison de ligands inconnus (non apparentés) pour les petites molécules et les grandes macrocycles, améliorant ainsi la conception 3D de ligands puissants.
Initialement, Surflex-Dock a été développé en tant qu'outil de ligne de commande, apportant un amarrage moléculaire avancé aux utilisateurs experts. Le plugin Surflex-Dock a été développé comme un plugin sans code pour PyMol, un outil de visualisation moléculaire open source utilisé de manière approfondie par les chimistes informatiques et médicinaux. L'ajout du plugin Surflex-Dock pour Pymol rendra le surflex-dock plus largement accessible à la communauté de la modélisation moléculaire. L'interface de ligne de commande de Surflex-Dock continuera d'être prise en charge pour une utilisation au niveau des experts et un traitement par lots à grande échelle.
Pour vraiment transformer la découverte de médicaments, les méthodes avancées doivent être accessibles par tous ceux de la communauté qui en bénéficieraient le plus. Je suis ravi de voir cette prochaine étape de notre programme de développement pour la plate-forme biopharmale, dans laquelle nous fabriquons des méthodes de pointe pour la conception moléculaire 3D plus accessible aux chimistes informatiques et médicinaux. »
Ann Cleves, vice-présidente de la science des applications, division biopharmale, optibrium
Le plugin Surflex-Dock pour Pymol est disponible pour les utilisateurs avec une licence biopharmaire sans frais supplémentaires.
