Dans une récente étude publiée sur Place de la recherche* serveur de préimpression, les chercheurs ont évalué si les perturbations du microbiote intestinal affaiblissent la réponse sérologique au vaccin contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) chez les patients atteints de maladies inflammatoires de l’intestin (MICI).
Étude : Le microbiote intestinal et le métabolome sont associés à une diminution des réponses anticorps induites par le vaccin COVID-19 chez les patients immunodéprimés atteints d’une maladie inflammatoire de l’intestin. Crédit d’image : Kateryna Kon/Shutterstock
Sommaire
Arrière-plan
De nombreux patients immunodéprimés ont une immunogénicité très atténuée du vaccin contre le coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère. Cela peut expliquer pourquoi les patients atteints de MII traités par une thérapie anti-facteur de nécrose tumorale (TNF) présentent des réponses sérologiques variables aux vaccins.
L’âge, le type de vaccin et l’utilisation d’immunomodulateurs influencent l’immunogénicité du vaccin contre le SRAS-CoV-2. Cependant, le rôle d’autres facteurs dans la formation de la réponse au vaccin contre le SRAS-CoV-2 ne peut être nié et justifie une enquête.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont supposé que le microbiote intestinal et le métabolome, c’est-à-dire leur production métabolique fonctionnelle, jouent un rôle crucial dans la formation des réponses immunitaires de l’hôte. Cependant, les patients atteints de MICI sont immunodéprimés et ont un microbiote intestinal et un métabolome perturbés. Vraisemblablement, c’est pourquoi ils présentent une réponse immunitaire humorale variable à la vaccination contre le SRAS-CoV-2.
De plus, la composition du microbiote intestinal a été associée à des réponses thérapeutiques aux thérapies immunosuppressives, telles que la thérapie anti-TNF dans les MII. Par conséquent, les métabolites microbiens intestinaux prédisent de manière fiable la réponse au traitement anti-TNF.
L’équipe a collecté des échantillons de sérum et de matières fécales de patients adultes atteints de MII vaccinés contre le SRAS-CoV-2 par le vaccin BNT162b2 ou ChAdOx1 nCoV-19. De plus, ces patients avaient reçu un traitement par infliximab pendant plus de 12 semaines. Ils ont prélevé des échantillons fécaux entre la première dose de vaccin et quatre semaines après avoir reçu le vaccin. De même, l’équipe a analysé les échantillons de sérum de tous les participants à l’étude à des intervalles de huit semaines, quel que soit le moment de la vaccination.
Les chercheurs ont mesuré les réponses des anticorps après un schéma vaccinal à deux doses de tous les participants à l’étude à l’aide d’un immunodosage par électrochimiluminescence anti-SARS-CoV-2 spike (S). Ils ont observé que seuls 17 patients (39,5 %) avaient des réponses sérologiques inférieures au titre moyen géométrique (MGT) de la cohorte CLARITY-IBD. Tous les participants à l’étude actuelle ont été inscrits à l’étude CLARITY-IBD pour recevoir la vaccination contre le SRAS-CoV-2. En outre, l’équipe a analysé les échantillons fécaux de chaque patient à l’aide du séquençage de l’amplicon du gène de l’acide ribonucléique ribosomal (ARNr) 16S et de la spectroscopie par résonance magnétique nucléaire (RMN). De plus, ils ont utilisé la chromatographie liquide ultra-haute performance-spectrométrie de masse (UHPLC-MS) pour le profilage des acides biliaires des échantillons fécaux.
En outre, l’équipe a effectué des analyses uni-, multi-variables et de corrélation pour déterminer les prédicteurs des microbes intestinaux et du métabolome en relation avec la réponse sérologique à la vaccination.
(a) Schéma expérimental de l’étude ; (b) Concentrations d’anticorps anti-SARS-CoV-2 spike RBD chez les patients recevant ChAdOx1 nCoV-19 (points noirs) ou BNT162b2 (carrés roses). Chaque point représente un seul patient tracé le nombre de jours après la deuxième dose de vaccin lorsque son taux d’anticorps a été mesuré
Résultats de l’étude
La cohorte de l’étude comptait 43 patients atteints de MICI traités par infliximab recrutés entre le 25 janvier et le 15 mars 2021, dont seulement huit patients avaient des antécédents d’infection par le SRAS-CoV-2, évalués à l’aide de la nucléocapside anti-SRAS-CoV-2 (N) immunodosage.
Dans une étude menée par Ng et ses collègues, la majorité des participants étaient en bonne santé et seulement 3 % suivaient un traitement immunosuppresseur. De plus, la plupart des participants à l’étude ont reçu CoronaVac, un vaccin à virus inactivé, et une minorité a reçu le vaccin BNT162b2 à base d’ARNm. Malgré les différences, ces études ont indiqué qu’un Parabacteroides était associé à une réponse sérologique plus faible à la vaccination contre le SARS-CoV-2.
La présente étude a également signalé l’abondance du genre Bilophila en association avec une réponse sérologique plus élevée à la vaccination contre le SRAS-CoV-2. A l’inverse, Streptococcus était prédictif d’une réponse sérologique inférieure à la moyenne. Notamment, la vaccination avec BNT162b2 a conduit à l’induction de groupes de différenciation spécifiques au virus (CD) 4 + réponses des lymphocytes T avec un profil d’auxiliaire T de type 1 (TH1); De même, Bilophila wadsworthensis s’est avéré être associé à une réponse TH1 pro-inflammatoire améliorée. Par conséquent, les chercheurs ont émis l’hypothèse que Bilophila agissait comme adjuvant vaccinal chez certains patients atteints de MII, recrutant des cellules TH1 pour générer des anticorps contre le SRAS-CoV-2. Notamment, les individus présentant une réponse sérologique supérieure à la moyenne et médiocre aux vaccins COVID-19 avaient Bacteroidota et Firmicutes comme flore intestinale dominante.
Le profilage RMN a identifié 36 caractéristiques de métabolites, dont cinq acides gras à chaîne courte, 11 acides aminés et trois composés respiratoires, et l’UHPLC-MS a attribué 50 acides biliaires. L’analyse univariée a montré que les patients présentant une bonne réponse sérologique à la vaccination contre le COVID-19 présentaient des taux élevés de triméthylamine (TMA), d’acide oméga-muricholique et d’acide ursodésoxycholique.
De plus, les auteurs ont noté que les patients qui montaient une réponse vaccinale COVID-19 inférieure à la moyenne avaient des niveaux élevés de succinate, de phénylalanine et de phénylacétate. Par la suite, les auteurs ont observé une PA fécale élevée chez les patients atteints de MII par rapport aux témoins sains. De même, ils ont noté le succinate régulé positivement chez les patients atteints de la maladie de Crohn.
conclusion
Dans l’ensemble, l’étude a démontré une corrélation entre le microbiote intestinal et une réponse sérologique incohérente à la vaccination contre le SRAS-CoV-2 chez les patients atteints de MII. Les thérapeutiques COVID-19 qui pourraient altérer le microbiote intestinal ou compléter les métabolites bénéfiques pourraient restaurer efficacement l’immunogénicité réduite induite par le vaccin. Par la suite, la TMA pourrait aider à réduire l’affaiblissement de la réponse immunitaire induit par les anti-TNF.
*Avis important
Place de la recherche publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
