Modèles spatiotemporels de la progression du variant Delta et de ses interventions de santé associées

La maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) a posé de nombreux défis sans précédent à tous les pays du monde.

Cette pandémie a été causée par l’épidémie rapide du virus respiratoire aigu sévère du coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Les pays d’Asie du Sud-Est (SEA) ont été en mesure de gérer et d’atténuer la première vague en 2020, mais ont été pris dans la crise après l’émergence de la variante Delta en 2021. Ceci malgré le fait que beaucoup de ces pays ont introduit des interventions non pharmaceutiques ( NPI) en plus des programmes de vaccination.

Le lien entre les interventions de santé publique et la dynamique épidémique est relativement peu étudié.

Dans une étude en cours, publiée sur le medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont adopté une méthode prospective d’analyse spatio-temporelle pour effectuer une analyse spatio-temporelle au niveau du district dans les sept pays sélectionnés en ASE de juin 2021 à octobre 2021.

Fond

À l’instar de nombreux pays, les pays de l’ESE ont été gravement touchés par l’épidémie de COVID-19, en termes de commerce, de tourisme et de systèmes de santé. Ces pays ont fait de gros efforts pour ressusciter leurs économies en 2021, mais ont encore une fois été gravement touchés par la vague de la variante Delta.

La variante Delta a été estimée 2 à 4 fois plus transmissible que la souche d’origine et, depuis avril 2021, est responsable d’une augmentation exponentielle du nombre de cas en SEA. En raison de l’impact économique massif du COVID-19, de nombreux pays de la SEA ont réfléchi à ajuster leurs politiques d’intervention en matière de santé publique et à « vivre avec le virus ». Par conséquent, la surveillance des épidémies et l’identification des grappes spatio-temporelles d’infection sont devenues cruciales pour les gouvernements de ces pays.

L’analyse spatio-temporelle a été largement utilisée dans la recherche sur la propagation du COVID-19 pour fournir aux autorités de santé publique des informations importantes pour aider à atténuer la crise. Au sein de la suite de méthodes, le balayage spatio-temporel est l’une des méthodes les plus populaires utilisées pour identifier les clusters spatio-temporels dans une région particulière. Au cours de la première vague, cette méthode a été appliquée à des pays individuels de l’ASE, ignorant ainsi les schémas de propagation et les caractéristiques de progression avec des interventions coordonnées au niveau régional.

Une nouvelle étude

Les chercheurs se sont concentrés sur sept pays de l’ASE, à savoir l’Indonésie, la Malaisie, les Philippines, Singapour, la Thaïlande, le Vietnam et Brunei. Ils ont utilisé les cas confirmés quotidiens à l’échelle du district de ces pays de juin 2021 à octobre 2021 pour identifier les grappes actives et émergentes des épidémies. Au cours de l’épidémie de variante Delta, la dynamique des interventions mises en œuvre par différents pays pourrait provoquer des fluctuations de la transmission. Les scientifiques ont déclaré que des politiques aussi diverses pourraient aider à expliquer la progression et la transmission de la variante Delta du SRAS-CoV-2.

Résultats

Il a été observé qu’au cours de la première phase de la période d’étude (juin à août 2021), la plupart des districts de Malaisie et des Philippines, la capitale et ses environs en Thaïlande, au Vietnam et en Indonésie présentaient un risque élevé de transmission du COVID-19. Les grappes spatio-temporelles de districts ont changé avec la dynamique des politiques introduites par chaque pays après août. L’Indonésie a mis en place des restrictions continues et a pu réduire le risque d’épidémie. Cependant, d’autres régions, telles que la Malaisie, Singapour, la Thaïlande et les Philippines sont restées à haut risque de transmission, en raison de différents degrés de relaxation.

Les scientifiques ont déclaré que des restrictions strictes et continues étaient cruciales pour le contrôle de l’épidémie. Cela est particulièrement vrai pour les régions dotées de systèmes de santé publique faibles et de taux de vaccination relativement faibles. L’étude actuelle est la première à explorer la progression spatio-temporelle de l’épidémie de variante Delta en SEA. Il est également le premier à résumer le lien potentiel entre la dynamique épidémique et diverses interventions de santé publique. Les chercheurs ont souligné que l’analyse spatio-temporelle pourrait être utilisée en continu pour surveiller la dynamique de la pandémie et ajuster en temps opportun les lacunes potentielles des politiques nationales de santé publique. Cela pourrait aider à prévenir une nouvelle détérioration de la situation pandémique.

Limites

L’étude actuelle fournit de nouvelles informations, mais il existe également certaines limites, principalement dans les données COVID-19. Il y a douze pays dans la région SEA, mais seulement sept ont fourni des données au niveau du district administratif primaire. Cela a empêché les auteurs d’étudier la propagation complète en SEA. En outre, des données plus granulaires, telles que celles au niveau de la ville, du comté ou du bloc, pourraient aider à révéler des modèles plus spécifiques et détaillés.

En fait, le manque de meilleures données a également agi comme une contrainte pour les études antérieures. Les chercheurs ont fortement préconisé que les autorités de santé publique divulguent des données plus représentatives et fiables, car une connaissance insuffisante de la dynamique de la maladie pourrait conduire à des réponses erronées à la pandémie. Les études futures devraient explorer la corrélation potentielle entre les inégalités environnementales et COVID-19, ce qui pourrait fournir de nouvelles informations concernant l’allocation des ressources et la prévention régionale.

*Avis important

medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.