Dans une étude récente publiée dans Maladies infectieuses émergentesdes chercheurs ont signalé la détection d’une nouvelle variante du virus Hendra de génotype 2 (HeV-g2) dans l’urine de renards volants à tête grise et noire en Australie.
Sommaire
Arrière-plan
Le virus Hendra (HeV ; appartenant au genre Hénipavirus et Paramyxoviridae famille) est un organisme pathogène zoonotique bien établi endémique à la Pteropus genre de renards volants australiens. Le débordement du HeV-g2 a été détecté chez les chevaux à l’aide d’analyses actualisées de la réaction quantitative en chaîne de la polymérase à transcription inverse (qRT-PCR) pan-paramyxovirus. Bien que les tests PCR aient une spécificité élevée, leur plage de détection est étroite ; ainsi, des variantes génomiquement diverses telles que le nouveau HeV-g2 peuvent ne pas avoir été détectées. Ainsi, de nouvelles méthodes de diagnostic sont nécessaires pour détecter les variantes qui provoquent des retombées sur d’autres animaux.
L’excrétion du virus HeV-g1 est connue chez les renards volants à lunettes australiens (P. conspicilatus) et renards volants noirs (P. alecto), indiquant que ces deux espèces sont des sources potentielles de propagation du HeV-g2 aux chevaux.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont rapporté la détection de la nouvelle variante HeV-g2 dans l’urine de renards volants noirs et à tête grise australiens à l’aide d’une nouvelle technique qRT-PCR.
Un total de 4 539 échantillons d’urine regroupés ont été obtenus directement ou indirectement à l’aide d’un sac de collecte d’urine de renards volants anesthésiés des régions du sud-est du Queensland et des régions côtières du centre au nord de la Nouvelle-Galles du Sud (NSW) entre décembre 2016 et septembre 2020 sur 129 séances d’échantillonnage sous le perchoir. Les feuilles de plastique ont été placées dans des zones où les renards volants, en particulier P. alecto les espèces se perchaient. L’espèce, le nombre, le sexe et l’âge des renards volants présents au-dessus des feuilles de plastique ont été enregistrés. De plus, 1 674 échantillons d’urine ont été obtenus à partir de renards volants individuels capturés dans des nids de brume au cours de 39 sessions de capture entre juillet 2017 et septembre 2020.
Les échantillons d’urine ont été placés dans des milieux de transport, des tampons de lyse virale ou des cryotubes et ensuite stockés à des températures de -80°C. L’acide ribonucléique (ARN) a été extrait de ces échantillons à l’aide d’une analyse qRT-PCR ciblée sur le gène P pour dépister HeV-g1, suivie d’un stockage à -80 ° C et d’un dépistage HeV-g2 à l’aide d’une nouvelle analyse qRT-PCR , qui ciblait le gène M à l’aide d’amorces spécifiques au HeV-g1 et au HeV-g2.
Le gène du cytochrome b a été amplifié à partir de tous les échantillons positifs pour obtenir l’espèce hôte en fonction de leur teneur en acide désoxyribonucléique (ADN) et de l’identification de la séquence génomique à l’aide de séquences de 402 paires de bases (pb). Les nombres de copies/mL de copies génomiques ont été déterminés.
Résultats
Un total de 10 échantillons, huit échantillons regroupés et deux échantillons obtenus à partir de renards volants individuels étaient positifs pour le HeV-g2, dont la plupart (8/10) avaient un faible nombre de copies génomiques, sauf ARLIS002_55_1 et ARSUN015_15_1 avaient des copies génomiques sensiblement plus élevées. Les échantillons positifs au HeV-g2 identifiés appartenaient aux régions de Sunnybank, Lismore, Clunes, Maclean, Nambucca Heads et Dorroughby.
Le HeV-g2 a été détecté dans les échantillons positifs obtenus au cours de toutes les saisons, bien que la plupart (5/8) aient été détectés entre mai et août. La prévalence des identifications positives dans les séances de capture variait entre 2,5 % et 6,5 %. Dans les échantillons d’urine regroupés, la variante HeV-g2 a été détectée uniquement dans les séances où HeV-g1 a également été détecté. La prévalence du HeV-g1 variait entre 2,5 % et 50 %. Cependant, la prévalence du HeV-g1 n’était pas significativement corrélée avec celle du HeV-g2.
HeV-g2 a été détecté chez les renards volants de deux espèces, à savoir. P. poliocéphalie et P. alecto ont été identifiés dans deux échantillons et six échantillons, respectivement, à partir des échantillons de renards volants sous le perchoir à l’aide du séquençage du cytochrome b. Parmi les deux échantillons obtenus à partir de renards volants capturés individuellement, l’un était une femelle juvénile de la P. poliocéphalie espèce, et l’autre était un mâle adulte de la P. alecto espèces.
Conclusion
Les résultats de l’étude ont montré que P. poliocéphalie et P alecto excrétent le nouveau variant HeV-g2 dans l’urine et sont des réservoirs hôtes compétents. La détection du HeV-g2 dans les échantillons d’urine de renards volants a permis d’identifier son aire de répartition géographique, les espèces hôtes, le risque de propagation et la dynamique de transmission.
Cependant, l’urine des deux autres espèces de renards volants – P. scapulatus et P. conspicilatus – réservoirs connus de HeV-g1, n’a pas été examiné. Par conséquent, d’autres études doivent évaluer la transmission potentielle du HeV-g2 à partir de ces deux espèces.
Le HeV-g2 a déjà été détecté dans des tissus de renards volants des régions du sud et de l’ouest de l’Australie et de Victoria. Les résultats de la présente étude sont une extension de la couverture géographique connue du HeV-g2 aux régions du sud-est du Queensland et des régions côtières du milieu au nord de la Nouvelle-Galles du Sud, régions proches des zones de propagation connues du HeV-g2 chez les chevaux.
La poursuite du développement de diagnostics compétents pour détecter des gammes virales plus complètes capables de débordements pourrait améliorer considérablement la prédiction des risques de débordement, la gestion de la biosécurité, guider les propriétaires de chevaux et les vétérinaires pour améliorer les soins aux animaux.
