Dans une étude récente publiée dans La scienceles chercheurs ont analysé des données provenant de plusieurs sources pour déterminer l’épicentre de la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).
Sommaire
Arrière plan
Au début de la pandémie de COVID-19, les scientifiques ont émis l’hypothèse que les animaux vendus sur le marché de Huanan étaient à l’origine des cas inexplicables de pneumonie à Wuhan, en Chine, qui ont conduit à sa fermeture le 1er janvier 2020. Une revue systématique de tous les cas notifiés au système national chinois de notification des maladies à déclaration obligatoire a montré que 55 des 168 premiers cas connus de COVID-19 étaient associés au marché de Huanan.
Comme le marché de Huanan, il existe trois autres marchés à Wuhan où des ventes soutenues de mammifères vivants ont eu lieu en 2019. Cependant, en raison d’un manque de données concernant les événements en amont du marché et de l’obscurité des circonstances exactes sur le marché, impliquant les premiers cas dans le Huanan marché n’établit pas de manière concluante que la pandémie y est née.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont d’abord examiné attentivement le rapport de mission de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) de 2021, qui a identifié 174 cas de coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) dans la province du Hubei en décembre 2019. Ils ont pu extraire de manière fiable la latitude et les coordonnées de longitude de 155 cas à partir des cartes. Ensuite, les chercheurs ont reconstruit les contours de la densité de probabilité par une estimation de la densité du noyau (KDE) en utilisant les 155 géolocalisations de cas de COVID-19 de décembre 2019 et les 120 emplacements de cas de COVID-19 de décembre 2019 non liés au marché de Huanan. Ils ont observé que l’emplacement du marché de Huanan se situait dans le contour de densité de 1 % le plus élevé dans les deux scénarios.
Le contour à 50 % de densité la plus élevée est la zone où les cas extraits de la distribution de probabilité sont aussi susceptibles de se trouver à l’intérieur qu’à l’extérieur du marché de Haunan. L’équipe a également identifié les contours les plus denses de 25 %, 10 %, 5 % et 1 %. De même, ils ont identifié les contours de densité de probabilité les plus élevés de 50% à 1% pour 737 emplacements de cas de COVID-19 à partir des données Weibo.
De plus, les chercheurs ont utilisé une distribution nulle empirique de la densité de population de Wuhan pour déterminer si les cas de COVID-19 de décembre étaient plus proches du marché de Huanan. Ils ont considéré trois catégories de cas :
(i) tous les cas,
(ii) les affaires directement liées au marché de Huanan,
(iii) affaires non liées au marché de Huanan
Résultats de l’étude
La plupart des cas de SRAS-CoV-2 de décembre 2019 à Wuhan se sont regroupés dans le centre de Wuhan, près de la rive ouest du fleuve Yangtze. Les chercheurs ont cartographié ces cas de décembre 2019 à l’aide des données de localisation d’individus utilisant une application d’assistance COVID-19 sur Sina Weibo. En janvier et février 2020, les cas de COVID-19 ont augmenté dans les zones très peuplées de Wuhan, en particulier là où résidaient les personnes âgées.
De plus, les chercheurs ont fait deux observations importantes. Premièrement, les cas de COVID-19 non liés au marché de Huanan résidaient en moyenne plus près du marché que ceux liés au marché. Deuxièmement, la distance entre les points centraux des cas et le marché de Huanan était plus courte que prévu pour tous les cas de décembre 2019 par rapport à la distribution empirique nulle de la densité de population de Wuhan.
Le point central pour tous les cas était à 1,02 kilomètre (km). De même, le point central des cas de décembre 2019 liés au marché de Huanan et non liés au marché était respectivement à 2,28 km et 0,91 km. Dans le cadre du test de la «distance du point central au marché de Huanan» et du test de la «distance médiane au marché de Huanan», les chercheurs ont pu supprimer 38 cas résidant dans un rayon de 1,6 km et 98 cas vivant dans un rayon de 5,8 km avant de perdre leur signification à le niveau α = 0,05, respectivement.
Hormis le marché de Huanan, aucune autre région de Wuhan n’a montré une densité de cas élevée dans une analyse spatiale du risque relatif rapportée via Weibo. Les lignées SARS-CoV-A et B ont co-circulé dans le monde depuis le début de la pandémie de COVID-19. Curieusement, ces deux lignées étaient géographiquement associées au marché de Huanan.
Une préimpression récente a également confirmé l’authenticité du rapport du Centre chinois de prévention et de contrôle des maladies (CCDC), qui a documenté la présence précoce de la lignée A du SRAS-CoV-2 dans un échantillon environnemental du marché de Huanan. Ainsi, il est probable que la lignée A du SRAS-CoV-2, comme la lignée B, soit originaire du marché de Huanan, puis transmise de cet épicentre aux quartiers du marché, puis au-delà.
Des analyses spatiales au sein du marché ont également identifié plusieurs échantillons environnementaux positifs pour le SRAS-CoV-2, y compris des cages, des chariots et des congélateurs, concentrés dans le coin sud-ouest du marché, où les vendeurs vendaient des mammifères vivants, y compris des chiens viverrins immédiatement avant le COVID-19. pandémie. Ces résultats suggèrent que des animaux vivants infectés par le SRAS-CoV-2 étaient présents sur le marché de Huanan au début de la pandémie de COVID-19.
conclusion
Malgré des tests limités d’animaux sauvages vivants vendus sur le marché, les résultats de l’étude ont montré que le marché de Huanan était le premier épicentre de la pandémie de COVID-19, et le SRAS-CoV-2 a probablement émergé du commerce d’animaux sauvages vivants en Chine, ce qui implique qu’il avait un origine zoonotique. En effet, les marchés tels que le marché de Huanan vendant des mammifères vivants présentent le risque le plus élevé de propagation du virus. Des efforts concertés sont nécessaires pour élucider les événements en amont qui auraient pu transporter le SRAS-CoV-2 sur le marché de Huanan, se terminant par la pandémie de COVID-19 afin de limiter les voies et les opportunités de propagation du virus à l’avenir. Les futures études devraient continuer à étudier les origines de la pandémie de SRAS-CoV-2 afin de réduire le risque de futures pandémies.
