Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont exploré les profils de microbiome intestinal et métabolomique post-maladie des cas communautaires de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) et des personnes atteintes de maladies non COVID-19 de durée prolongée.
Sommaire
Arrière plan
Des études ont signalé plusieurs cas d’infections par le coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu léger léger pris en charge dans les communautés ; cependant, des cas graves de COVID-19 ont été signalés chez des personnes sujettes aux maladies cardiovasculaires. On s’inquiète de plus en plus de la longue durée des symptômes de la COVID-19 chez de nombreuses personnes, y compris les cas pris en charge dans les communautés. Cependant, les facteurs de risque et les variables biologiques associés à la durée prolongée des symptômes de la COVID-19 n’ont pas été bien caractérisés.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont étudié si les profils métabolomiques des personnes résidant dans la communauté différaient de ceux dont la durée des symptômes de la COVID-19 était variable.
L’équipe a également enquêté si la composition du microbiome fécal obtenu après la maladie aiguë différait entre les personnes atteintes de maladies de durée variable des symptômes avec ou sans antécédents de COVID-19. De plus, l’équipe a évalué l’association probable entre la composition métagénomique de l’intestin et les profils métabolomiques des participants à l’étude.
Les participants à l’étude CSSB (COVID symptom study biobank) ont été recrutés et classés comme (i) groupe COVID-19 asymptomatique ; (ii) courte durée de la COVID-19 (≤2 semaines) ; (iii) longue durée de COVID-19 (≥28 jours) ; et (iv) longue durée des symptômes (≥28 jours) des maladies autres que la COVID-19. Les groupes COVID longs ont été reclassés en OCS28 (28 à 83 jours) et syndrome post-COVID-19 (PCS84, > 84 jours).
Les mêmes paramètres ont été appliqués pour les maladies non COVID-19, et six groupes ont été formés comprenant quatre groupes COVID-19 comme (i) asymptomatiques ; (ii) COVID-19 aigu (≤1 semaine) ; (iii) PCS84, et (iv) OSC28 ; et deux groupes non-COVID-19 : maladies non-COVID-19 pendant 28 à 83 jours (NC28), maladies non-COVID-19 pendant ≥84 jours (NC84).
Des échantillons de sang capillaire et des échantillons fécaux ont été obtenus entre novembre 2020 et janvier 2021 de tous et de quelques participants, respectivement. Une analyse métabolomique par résonance magnétique nucléaire des métabolites (n = 249, dont 37 ont été cliniquement validés) associés à une hospitalisation associée au COVID-19 a été réalisée en mars/avril 2021.
L’acide désoxyribonucléique génomique (ADNg) a été extrait, après quoi des bibliothèques d’ADN ont été préparées et séquencées, et une analyse métagénomique a été effectuée. Une modélisation linéaire généralisée a été utilisée et les coefficients de corrélation de Spearman ont été calculés après avoir contrôlé les variables de confusion pour déterminer l’association entre les profils de microbiome et les profils de métabolome des participants à l’étude, et les scores de prédiction du risque de maladies infectieuses (ID) ont été évalués.
Résultats
Sur 15 564 personnes qui ont reçu des invitations par e-mail pour l’étude CSSB, 37 % (n = 5 694) ont été recrutées pour la présente étude, dont 84 % (n = 4 787) des participants ont renvoyé leurs échantillons pour analyser leurs profils métabolomiques. L’âge moyen des participants était de 53 ans, la plupart d’entre eux (79 %) étaient des femmes, des données adéquates ont été obtenues pour 78 % (n = 3718) des individus, et 81 % (n = 2561) pouvaient être catégorisés phénotypiquement.
Les niveaux de 36 % (n = 90/246) de métabolites étaient différents entre le groupe OSC28 et le groupe asymptomatique COVID-19, dont 43 % (n = 39) différaient entre le groupe NC28 et le groupe asymptomatique COVID-19. Sur les 37 métabolites cliniquement validés, les niveaux d’acides gras différaient entre les cas asymptomatiques de COVID-19 et les participants symptomatiques COVID-19 et non-COVID-19.
Des niveaux plus élevés d’acides gras polyinsaturés (AGPI) étaient associés à des risques moindres de durée plus longue de COVID-19 (OR = 0,7 pour OSC28 par rapport aux cas asymptomatiques) et de maladies non SARS-CoV-2 (OR = 0,7 pour NC28 par rapport aux cas asymptomatiques). Les niveaux d’acides gras monoinsaturés (MUFA) étaient associés à une COVID-19 prolongée (OR = 1,3 pour OSC28 par rapport à une infection asymptomatique par le SRAS-CoV-2), et des triglycérides élevés (TG) et des lipoprotéines de très basse densité (VLDL) étaient liés à une maladies chez les participants COVID-19 et non COVID-19.
Les ratios TG/phosphoglycérides étaient également directement proportionnels à la durée de la maladie. En revanche, des taux élevés de lipoprotéines de haute densité (HDL) étaient liés à des cas asymptomatiques de COVID-19. Ni les acétyles de glycoprotéine ni les niveaux d’acides aminés n’étaient liés à la durée des symptômes du COVID-19. Seules 2,8 % (n = 7) variables différaient de manière significative entre les groupes COVID longs (PCS84 et OSC28 combinés) par rapport aux groupes de maladies non COVID-19 (NC84 et NC28 combinés).
Des valeurs de HDL plus élevées ont été notées pour les patients COVID-19 aigus (OR 1,2) par rapport aux patients non-COVID-19, avec des niveaux encore plus élevés dans le groupe de la maladie asymptomatique (OR 1,4) par rapport aux maladies non-COVID-19. Des scores ID plus élevés étaient associés à des durées prolongées des symptômes, et l’impact des scores ID était légèrement plus fort après les ajustements hPDI (indice de régime alimentaire sain à base de plantes) avec des OR 1,6 et 1,5 avec et sans hPDI, respectivement (OSC28 vs COVID-19 asymptomatique ).
La richesse microbienne n’était pas significativement différente parmi les personnes du sous-ensemble métabolomique (n = 301), sauf pour les espèces telles que Streptocoque vestibulaire, Bactérie Firmicutes CAG 94 Ruminococcus callidus, et un profil athérogène-dyslipidémique était associé à une durée prolongée des maladies COVID-19 et non COVID-19. Aucune association significative n’a été trouvée entre la durée de la maladie et le microbiome de l’intestin chez les convalescents.
Conclusion
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont mis en évidence le rôle potentiel du dysfonctionnement cardiométabolique dans l’expérience d’une maladie de longue durée, y compris après COVID-19.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
