Dans une récente étude publiée sur medRxiv*, les chercheurs ont évalué l’infectiosité des infections et des réinfections de percée vaccinale pendant l’onde Omicron du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2).
Sommaire
Arrière plan
La dynamique de transmission du SRAS-CoV-2 a changé tout au long de la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) en raison de la couverture vaccinale et de l’apparition de nouveaux mutants. Dans la phase initiale de la pandémie, des infections ont été enregistrées dans la population sensible ; cependant, les réinfections et les infections par percée vaccinale sont désormais de plus en plus fréquentes. Les données sur la contagiosité des réinfections/infections percées par le variant Omicron du SRAS-CoV-2 sont limitées.
Il est essentiel d’évaluer la dynamique de la variante Omicron et l’impact d’une infection ou d’une vaccination antérieure, en particulier dans les populations à haut risque et vulnérables, y compris les personnes incarcérées. La population carcérale a été touchée de manière disproportionnée par la pandémie de COVID-19, car la transmission du SRAS-CoV-2 reste élevée dans les prisons, en partie à cause du surpeuplement, d’une mauvaise ventilation et des introductions d’autres sources.
L’étude et les conclusions
Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué l’infectiosité des infections par le SRAS-CoV-2 chez des individus vaccinés ou précédemment infectés (convalescents) par rapport à des sujets non vaccinés ou naïfs d’infection incarcérés dans les prisons d’État des États-Unis (États-Unis). Les auteurs ont recueilli des enregistrements de données sur le logement et d’infections par le SRAS-CoV-2 dans 35 établissements pour adultes du système pénitentiaire d’État de Californie. Les données ont été analysées pendant cinq mois (décembre 2021 – mai 2022).
Un cas index était un résident avec un test SARS-CoV-2 positif. Un cas décisif a été défini comme une infection par le SRAS-CoV-2 survenant au moins 14 jours après la première vaccination, en plus de ne pas avoir été testé positif au SRAS-CoV-2 au cours des 90 derniers jours. La réinfection a été définie comme un test SARS-CoV-2 positif chez les personnes ayant déjà été infectées, à condition que le temps entre deux tests positifs soit supérieur à 90 jours.
Les contacts étroits étaient ceux qui partageaient la cellule avec le cas index pendant au moins une nuit alors que le cas était encore contagieux. Les cas secondaires étaient des contacts étroits dont le test était positif dans les trois jours suivant la première exposition ou les 14 jours suivant la dernière exposition au cas index.
Au cours de cette période, en moyenne, les tests de dépistage du SRAS-CoV-2 ont été effectués 8,1 fois par résident, avec 11,7 jours moyens entre les tests. Il y avait 1261 cas index inclus dans l’étude sur la base des critères suivants : test de diagnostic positif et incarcération continue à partir d’avril 2020 ou avant, avec un contact valide dans une cellule partagée à huis clos.
Les contacts étroits ont été testés dans les deux jours suivant la première exposition et les 14 jours suivant la dernière exposition. La durée moyenne d’exposition des contacts étroits avec les cas index était de 2,3 jours. Les cas index non vaccinés et vaccinés ont été appariés par établissement et par période. En moyenne, 3,6 cas index vaccinés ont été appariés à chaque cas index non vacciné.
Le risque de transmission moyen non ajusté à tous les contacts étroits était de 29 %, sur la base d’une exposition moyenne de 2,3 jours. Les cas vaccinés avaient un risque de transmission à des contacts étroits de 27 %, tandis que les cas non vaccinés avaient un risque de 36 %. Les cas avec une infection antérieure avaient un risque plus faible (22 %) de transmission aux contacts proches que les individus naïfs (30 %).
Après avoir ajusté les antécédents de vaccination et d’infection des contacts étroits, les auteurs ont constaté que les cas index vaccinés avec au moins une dose de vaccin présentaient un risque de transmission aux contacts étroits de 24 % inférieur à celui des cas non vaccinés. De plus, chaque vaccination supplémentaire (chez les cas index) était associée à une diminution de 12 % du risque de transmission aux contacts étroits.
De même, une infection antérieure avait une diminution de 22% du risque de transmission des cas index. Notamment, la vaccination et une infection antérieure chez un cas index étaient toutes deux associées à un risque de transmission réduit de 41 %. De plus, ils ont noté que le temps écoulé depuis la dernière vaccination était inversement lié à l’infectiosité.
Cependant, la relation entre le risque de transmission et le temps écoulé depuis la vaccination était statistiquement non significative. Les auteurs ont constaté que les infections primaires, les percées d’infections, les réinfections et les percées d’infections chez les convalescents contribuaient respectivement à 20 %, 50 %, 7 % et 22 % de la transmission aux cas secondaires.
conclusion
En résumé, l’infection et la vaccination antérieures ont diminué l’infectiosité des infections par le SRAS-CoV-2 dans les prisons pendant la vague Omicron. Une infection et une vaccination antérieures étaient individuellement associées à une diminution comparable de l’infectiosité, et des doses de vaccin supplémentaires (rappels) ou une vaccination plus récente ont entraîné une réduction plus significative de l’infectiosité.
Notamment, la vaccination et l’infection ont eu un effet additif. Néanmoins, malgré une infection ou une vaccination antérieure, les réinfections par le SRAS-CoV-2 et les percées infectieuses représentaient 80 % de la transmission. La vaccination ou l’immunité induite par l’infection à elles seules pourraient ne pas empêcher le COVID-19 dans les milieux à haut risque comme les prisons.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
