Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de prétirage, les chercheurs ont comparé la transmissibilité des variantes nouvelles et émergentes du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2).
Sommaire
Arrière plan
Actuellement, la majorité des rapports sur les taux d’attaque secondaire (SAR) dans la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) ont défini l’infection secondaire comme une positivité récente de la réaction en chaîne par polymérase (PCR) chez un contact qui présente des symptômes. En n’incluant que ceux qui sont symptomatiques tout en ayant de l’acide ribonucléique viral (ARN) détectable lors de l’échantillonnage, cette méthode sous-estime le nombre total d’individus infectés.
Les tests sérologiques peuvent détecter des infections antérieures, qu’elles soient symptomatiques ou non, et des événements de transmission potentiellement manqués lorsque le contact a déjà été testé PCR négatif. Les réponses sérologiques doivent donc être incluses dans les comparaisons SAR entre environnements ou variations virales pour connaître la véritable transmissibilité.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont déterminé les fréquences des attaques secondaires domestiques à l’aide de la sérologie pour évaluer la transmissibilité relative de la variante SARS-CoV-2 Alpha of concern (VOC) au SARS-CoV-2 non-VOC.
Entre le 9 novembre 2020 et le 31 janvier 2021, l’équipe a mené une enquête transversale sur la séroprévalence des contacts familiaux (HHC) d’individus positifs pour le SRAS-CoV-2 et dont le virus avait subi avec succès le séquençage du génome entier (WGS). Cette période a été choisie car il y a eu une propagation simultanée du SRAS-CoV-2 Alpha et non COV au sein de la communauté.
Les patients présentant des diagnostics d’index symptomatiques de deux hôpitaux du nord de Londres ont été invités à se joindre à tous leurs HHC. Les participants potentiels étaient ceux qui ont envoyé des échantillons du service des urgences, des services de santé au travail, des services de médecins généralistes (GP) en dehors des heures d’ouverture et des patients hospitalisés à l’un ou l’autre des laboratoires où la PCR a identifié le SRAS-CoV-2.
Pour les premiers cas index de l’hôpital, l’équipe a commencé à embaucher le 26 mars 2021, et pour le deuxième hôpital, l’embauche a commencé le 11 mai 2021. Le processus d’embauche s’est terminé le 11 juillet 2021. Le questionnaire comprenait des informations sur l’âge du cas index, le sexe, l’origine ethnique et la gravité de la maladie COVID-19, ainsi que des informations sur la durée de vie de chaque contact avec le patient index pendant qu’il présentait des symptômes, l’intensité de son contact, toute exposition supplémentaire au SRAS-CoV-2, son statut vaccinal, et tout diagnostic antérieur de détection de COVID-19 ou de SRAS-CoV-2. À l’aide d’un immunodosage par chimioluminescence multiplex, des échantillons ont été examinés pour détecter la présence d’immunoglobuline (Ig)-G dans la protéine de pointe (S) du SRAS-CoV-2 et la protéine de nucléocapside (N) pour les COV non-COV et SRAS-CoV-2 alpha. .
Résultats
Les résultats de l’étude ont montré que 1 366 personnes au total, sur les deux sites de l’étude, ont été testées positives au SRAS-CoV-2 et disposaient d’informations sur le génotypage viral. Parmi ceux-ci, 354 personnes index ont accepté de participer, et au final, 238 participants index, dont 188 patients infectés par le SRAS-CoV-2 alpha et 50 patients non infectés par les COV. Environ 454 contacts familiaux ont fourni un échantillon de sang et ont rempli les questionnaires fournis. Des échantillons de sang ont été obtenus à partir de 102 HHC qui ont été exposés à un index infecté par un non-COV et de 352 HHC qui ont été exposés à un index infecté par le SARS-CoV-2 alpha COV.
L’affectation alpha/non-COV du cas index a révélé les caractéristiques du cas index. Près de 76 % des cas index ont déclaré avoir des symptômes respiratoires, 95 % des cas étant symptomatiques, tandis que 67 % ont dû être hospitalisés pendant neuf jours en moyenne. L’infection par le SRAS-CoV-2 alpha et les cas index non COV ne différaient pas statistiquement. HHC des patients index Alpha ont signalé une durée moyenne d’exposition à leur cas index infecté plus longue que les contacts des foyers index non COV. Ils ont également déclaré avoir reçu un diagnostic de COVID-19 symptomatique lorsque leur cas index a été diagnostiqué.
Un diagnostic de SRAS-CoV-2 simultané aux cas index a été signalé par 47 % des contacts exposés à un index non infecté par des COV et 67 % de ceux exposés à des cas index infectés par Alpha. Tous les contacts diagnostiqués avec le COVID-19 ne présentaient pas de symptômes à ce moment-là. Néanmoins, les contacts d’un cas index Alpha ont signalé plus fréquemment des symptômes de COVID-19 ou un diagnostic de SRAS-CoV-2 et avaient des titres d’IgG anti-nucléocapside plus élevés.
Par rapport à 82,1 % des HHC exposés au SARS-CoV-2 Alpha, 61,8 % des HHC non exposés au SARS-CoV-2 COV ont signalé une séropositivité. Lorsque le regroupement des ménages a été pris en compte, les contacts familiaux exposés à un indice infecté par la variante Alpha avaient 3,5 fois plus de chances d’avoir une séropositivité nucléocapside. Dans les maisons non-COV et Alpha-affectées, 6% et 0,5% des ménages sans contact avaient respectivement des anticorps anti-nucléocapside SARS-CoV-2 détectables, indiquant une absence totale de transmission domestique.
Conclusion
Les résultats de l’étude ont montré que 61,8 % des contacts exposés à des non-COV et 82,1 % des contacts exposés à la variante Alpha du SRAS-CoV-2 étaient séropositifs. Avec l’exposition à un index avec un diagnostic Alpha, la probabilité d’infection a doublé. Dans pratiquement tous les foyers, il y avait des preuves d’événements liés à la transmission. La présente étude établit fermement la nécessité d’inclure des données sérologiques dans les estimations du DAS pour accroître la précision et la compréhension.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
Comment l’acide acétylsalicylique et la warfarine interagissent-ils avec divers nutriments ?