Une étude récente publiée dans La Revue respiratoire clinique passé en revue les défis de la vaccination contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) et de l’immunité collective.
À l’échelle mondiale, plus de 6,5 millions de décès sont survenus en raison du COVID-19. De multiples éclosions de COVID-19 ont été observées, principalement en raison des variantes mutantes du virus causal, le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2). Limiter la transmission continue des variantes du SRAS-CoV-2 a été difficile. L’étude actuelle a examiné les variantes du SRAS-CoV-2 et les défis de la vaccination et de l’immunité collective.
Sommaire
Variantes du SRAS-CoV-2
Le SRAS-CoV-2 s’adapte continuellement aux hôtes et acquiert des mutations au fil du temps, ce qui donne des mutants qui (peuvent) présenter des caractéristiques supérieures à la souche ancestrale. La plupart des mutations n’ont pas ou peu d’impact sur les traits viraux, mais certaines peuvent affecter la pathogénicité, la transmissibilité et la gravité de la maladie.
Les mutations dans la protéine de pointe, par exemple, dans les variantes Alpha et Delta, améliorent l’affinité entre le domaine de liaison au récepteur (RBD) de la pointe et l’enzyme de conversion de l’angiotensine cellulaire hôte 2 (ACE2). L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a désigné les mutants émergents comme variants préoccupants (VOC) ou variants d’intérêt (VOI) en fonction de leur prévalence et de leurs caractéristiques.
Cinq COV, Alpha, Beta, Gamma, Delta et Omicron, ont été identifiés à ce jour. SARS-CoV-2 Alpha a 17 mutations dans son génome, dont huit dans la protéine de pointe. La variante bêta avait un taux d’infection 50 % plus élevé que la souche de type sauvage et était associée à un risque accru d’hospitalisation, de maladie grave et de décès. La variante Gamma était deux fois plus transmissible que la souche ancestrale.
Le SRAS-CoV-2 Delta a causé plus d’infections que ses prédécesseurs, avec une maladie grave dans les populations non vaccinées. Notamment, le risque d’hospitalisation avec la variante Delta était le double de celui avec le SARS-CoV-2 Alpha. La variante Omicron a le plus grand nombre de mutations. De plus, plusieurs sous-variantes du SARS-CoV-2 Omicron ont été identifiées. Une étude a rapporté qu’une infection antérieure par le SRAS-CoV-2 offrait moins de protection contre Omicron BA.4/5.
Médicaments antiviraux, vaccination et immunité collective
Divers médicaments antiviraux ont été testés dans des études cliniques. Paxlovid est un médicament antiviral qui inhibe l’activité de la 3 protéase de type chymotrypsine (3CL), également connue comme la principale protéase du SRAS-CoV-2. Les résultats intermédiaires suggèrent que Paxlovid réduit le risque d’hospitalisation de 89 % chez les patients par rapport aux sujets placebo lorsqu’il est administré dans les trois jours suivant l’apparition des symptômes, mieux que le Molnupiravir, qui réduit le risque d’hospitalisation de 50 %.
Les vaccins contre le SARS-CoV-2 ont été significativement efficaces pour réduire le risque de maladie symptomatique ou asymptomatique. Outre une transmissibilité/pathogénicité accrue, les variants du SRAS-CoV-2 ont acquis des traits d’évasion immunitaire, qui diminuent la protection conférée par la vaccination. Néanmoins, certains vaccins ont été efficaces dans une certaine mesure contre les variantes du SRAS-CoV-2.
Par exemple, le vaccin ChAdOx1 était efficace contre le SARS-CoV-2 Alpha. Le vaccin BNT162b2 de Pfizer était efficace à 91 % contre la variante bêta au Qatar. Les vaccins ChAdOx1 et BNT162b2 ont été efficaces contre le SARS-CoV-2 Delta, ce dernier étant plus efficace que le premier.
L’immunité collective est essentielle pour le contrôle des épidémies. Une proportion importante de la population devrait être immunisée pour prévenir de grandes épidémies. Des études suggèrent que l’immunité contre une infection passée par des variantes pré-Omicron est de 15% à 28% protectrice contre la réinfection par les sous-variantes SARS-CoV-2 Omicron BA.4 ou BA.5.
En revanche, l’immunité induite par l’infection Omicron BA.1 ou BA.2 offrait une protection de 76 % à 79 % contre la réinfection par BA.4 ou BA.5. Certains modèles basés sur les données suggèrent que pour un vaccin avec une efficacité de 74 %, la couverture vaccinale devrait dépasser 93 % pour obtenir une immunité collective. La couverture vaccinale actuelle est faible et doit augmenter pour atteindre l’immunité collective.
Incidence de la COVID-19 chez les enfants
Notamment, l’incidence du COVID-19 a été plus faible chez les enfants que chez les adultes, avec une mortalité beaucoup plus faible au début de la pandémie. Cependant, les données de la Malaisie suggèrent que la mortalité associée au COVID-19 chez les enfants était plus élevée pendant la vague Delta. De plus, une autre étude a rapporté que les taux d’hospitalisation étaient près de cinq fois plus élevés chez les enfants et les adolescents que chez les adultes. En conséquence, plusieurs pays ont autorisé la vaccination des enfants âgés de 5 à 11 ans.
Priorité vaccinale et scepticisme vis-à-vis des vaccins
Les programmes de vaccination contre la COVID-19 ont mis en place des stratégies de hiérarchisation telles que les groupes les plus vulnérables, tels que les travailleurs de la santé (TS), ceux des services essentiels, les sujets immunodéprimés et comorbides, ont la priorité sur les autres.
Certaines personnes refusent de se faire vacciner, supposant un faible risque d’infection, tandis que d’autres sont sceptiques quant à la vaccination en raison de problèmes de sécurité ou d’un manque de confiance. Les interactions avec les gens influencent les décisions de vaccination. La pression sociale et les encouragements de pairs de confiance et influents augmenteront l’adoption du vaccin.
Remarques finales
Dans l’ensemble, des efforts supplémentaires sont nécessaires pour améliorer la couverture vaccinale, en particulier parmi les groupes prioritaires qui n’ont pas encore été vaccinés. De plus, des interventions non pharmaceutiques telles que l’éloignement physique, les masques faciaux et une ventilation adéquate dans les environnements intérieurs, entre autres mesures, doivent être mises en œuvre de manière appropriée pour contenir la pandémie de COVID-19.