Dans une étude prospective de validation, des chercheurs du MD Anderson Cancer Center de l'Université du Texas ont démontré qu'un nouveau modèle mathématique, appelé LFSPRO, était efficace pour soutenir la prise de décision des conseillers en génétique et prédire avec plus de précision les individus présentant un risque plus élevé de syndrome de Li-Fraumeni (LFS), une maladie héréditaire qui comporte un risque plus élevé de développer plusieurs cancers.
LFSPRO a fourni des scores de risque qui ont largement surpassé les critères actuels en matière de tests génétiques et ont fourni des informations précieuses et des données quantifiables aux conseillers en génétique qui correspondaient plus étroitement à leur jugement clinique.
L'étude, publiée dans Le Journal américain de génétique humaineétait dirigé par Wenyi Wang, Ph.D., professeur de bioinformatique et de biologie computationnelle, et Banu Arun, MD, professeur d'oncologie médicale du sein.
La plupart des modèles de prédiction des risques sont validés uniquement dans des cohortes basées sur la recherche, mais notre étude démontre les performances du LFSPRO dans un contexte de conseil génétique réel, où des informations limitées sur les antécédents familiaux sont fournies dans les 30 minutes et où la plupart des conseillers sont négatifs. Notre modèle a démontré une précision considérablement supérieure aux directives cliniques actuelles et était en forte concordance avec le jugement des conseillers en génétique. »
Wenyi Wang, Ph.D., professeur de bioinformatique et de biologie computationnelle, MD Anderson Cancer Center de l'Université du Texas
Qu’est-ce que le syndrome de Li-Fraumeni et comment est-il actuellement détecté ?
LFS est une prédisposition héréditaire rare au cancer causée principalement par des mutations du TP53 gène suppresseur de tumeur. Les personnes atteintes de LFS courent un risque beaucoup plus élevé de développer plusieurs cancers à apparition précoce – notamment des sarcomes, du sein, des tumeurs cérébrales et des leucémies – ainsi que des cancers secondaires, ce qui souligne la nécessité d’identifier avec précision les patients atteints de LFS le plus tôt possible.
Les lignes directrices actuelles en matière de tests génétiques approuvées par le National Comprehensive Cancer Network (NCCN), connues sous le nom de critères de Chompret, reposent sur le fait que les individus répondent à certains critères oui ou non pour déterminer qui devrait recevoir TP53 tests génétiques. Cependant, ces lignes directrices peuvent omettre des personnes qui pourraient avoir des antécédents familiaux atypiques ou limités. La plupart des personnes référées finissent également par avoir un test négatif pour TP53 mutations, ce qui signifie que ce processus entraîne souvent des inquiétudes inutiles.
Comment ce nouveau modèle aide-t-il les conseillers en génétique à déterminer qui doit être testé ?
LFSPRO est un modèle statistique complet qui utilise les antécédents familiaux complets pour calculer la probabilité d'avoir un TP53 mutation et prédire le risque ultérieur de développer des cancers liés à l’EPA. Le modèle a été précédemment développé pour aider les conseillers en génétique à déterminer plus précisément les individus à risque.
L'objectif du LFSPRO est de fournir une estimation du risque plus quantitative afin de combler l'écart pour les personnes qui bénéficieraient d'un test mais ne répondraient pas aux critères Chompret établis. Cependant, bien que le LFSPRO ait obtenu d'excellents résultats dans les cohortes de recherche et rétrospectives, il n'a jamais été évalué pour une utilisation prospective par des conseillers en génétique dans la prise de décision clinique.
Les chercheurs ont invité quatre conseillers en génétique à utiliser de manière prospective LFSPRO lors de leurs séances de conseil génétique standard auprès de 178 personnes ayant également reçu des tests de lignée germinale. TP53 essai.
Comment LFSPRO a-t-il amélioré la précision clinique et le risque personnalisé ?
LFSPRO a démontré de solides performances prédictives pour les individus TP53 estimations de probabilité de mutation et ont largement surpassé les critères actuels de Chompret sur chaque mesure, y compris la sensibilité, la spécificité et les valeurs prédictives positives et négatives. Cela a conduit à moins de cas manqués et à moins de cas référés pour des tests inutiles.
En plus de l'exactitude du diagnostic, le LFSPRO s'alignait également bien avec le jugement clinique des conseillers en génétique, la plupart des conseillers déclarant qu'ils étaient à l'aise pour partager les résultats du LFSPRO avec leurs patients et leurs familles. Ils ont trouvé qu'il s'agissait d'un deuxième avis utile, basé sur des chiffres, qui pourrait améliorer leur confiance et leur prise de décision clinique pour déterminer les patients susceptibles de bénéficier d'un test génétique, en particulier lorsque ces patients ne répondaient pas aux critères actuels en raison d'antécédents familiaux atypiques ou limités.
L'identification précise des personnes atteintes de LFS a des implications cliniques majeures pour le dépistage et la prévention des cancers potentiellement mortels. Avec l'expansion des tests cliniques de lignée germinale dans les milieux communautaires, l'accès à un outil convivial qui peut être facilement utilisé par les conseillers en génétique et autres prestataires de soins de santé devrait augmenter l'identification des personnes à risque et faciliter la mise en œuvre en temps opportun de stratégies de surveillance et de prévention appropriées, ont expliqué les chercheurs.
