Dans une étude récente publiée dans Maladies infectieuses émergentes, les chercheurs ont identifié 10 virus de la grippe aviaire A(H5N6) chez les volailles de quatre provinces chinoises, avec un potentiel d’évasion immunitaire et de recombinaison génétique complexe. Pour cette raison, les virus H5N6 du clade 2.3.4.4b constituent une menace importante de provoquer des infections chez l’homme.
Étude : Nouveau virus réassorti de la grippe aviaire A(H5N6), Chine, 2021. Crédit d’image : pinkeyes/Shutterstock
Arrière plan
Il y a eu 26 cas d’infections humaines par le virus de la grippe A(H5N6) confirmées en laboratoire en Chine entre 2014 et 2020. Cependant, ces infections sporadiques n’ont attiré l’attention qu’en 2021, lorsque le nombre de cas a dépassé le nombre cumulé des sept années précédentes en Chine. à peine huit mois et fait des morts.
Il existe des vaccins hautement efficaces contre le H5N6, qui réduisent la probabilité de maladie clinique grave et d’excrétion de virus chez les volailles ; pourtant, des infections sporadiques au H5N6 surviennent chez la sauvagine. Ces oiseaux sont devenus un maillon faible dans la prévention du virus de la grippe A. En outre, ils ont conduit à la propagation incontrôlée du sous-type H5Nx de l’influenza aviaire hautement pathogène (IAHP) chez les volailles en Chine.
En raison de politiques d’immunisation strictes pour la volaille en Chine, le virus H5N8 a été rapidement éliminé mais a réapparu en 2020, provoquant une grave menace de propagation endémique et zoonotique ultérieure chez l’homme. Depuis une augmentation des cas de grippe A(H5N6) chez l’homme, la prévalence et le mode de réassortiment du H5N8 sont très préoccupants.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont identifié un nouveau virus réassorti de la grippe aviaire A(H5N6) présent dans l’industrie de la volaille en Chine ; qui a également provoqué une augmentation des infections humaines. Ils ont isolé un virus H5N6 d’un canard malade dans une ferme avicole à Chengdu, Sichuan, Chine, en juin 2021, et un autre d’un poulet mort dans la maison d’un patient humain à Chongqing en juillet 2021. De plus, ils ont isolé deux virus H5N6 en août et septembre 2021 dans des élevages de poulets et d’oies de deux provinces chinoises. Enfin, en octobre 2021, ils ont détecté cinq virus H5N6 de la province du Guangdong, trois de canards, un d’oie et un de plus de l’environnement.
Conformément au protocole de l’Organisation mondiale de la santé (OMS), les chercheurs ont séquencé les génomes des 10 virus H5N6, puis ont construit un arbre phylogénétique à probabilité maximale pour les classer en clades épidémiques. Les 10 virus H5N6 appartenaient au clade 2.3.4.4b de l’hémagglutinine (HA), avec 99,1 % à 100 % de gènes HA similaires.
Les chercheurs ont utilisé des souches aviaires de Chongqing comme virus représentatif avec des séquences de virus d’origine humaine. Il partageait de multiples similitudes entre les gènes PB2, polymérase acide et non structuraux du virus de la grippe A(H3N2). Les auteurs ont observé que ce nouveau virus était réassorti avec le virus H3N2, dérivant le gène de la polymérase basique (PB)1 du virus de la grippe A(H1N2). Les gènes HA et matrice, avec une similarité de 99,2 % et 99,9 % avec le H5N8, indiquent une origine du H5N8. Puisqu’il partageait un gène de neuraminidase similaire avec le virus H5N6, il est également possible que le nouveau virus H5N6 soit un réassortiment des virus H5N8 et H5N6. Une autre spéculation est que l’implication d’autres virus de la grippe aviaire à faible pathogénicité dans le réassortiment a rendu les gènes internes de toutes les souches complexes mais incohérents.
En outre, l’analyse bayésienne a révélé que ces virus formaient des clades distincts en fonction des régions géographiques d’origine. Les souches vaccinales actuelles sont inefficaces contre les nouvelles souches virales H5N6 en circulation, ce qui suggère le besoin urgent de mettre à jour les vaccins pour prévenir une nouvelle transmission. En effet, en janvier 2022, le gouvernement chinois a introduit de nouvelles souches vaccinales H5-Re14 et rHN5801 pour lutter contre l’infection des volailles par le virus H5N6.
Plusieurs infections virales H5N6 chez l’homme se sont produites pendant la saison non grippale dans le sud de la Chine en peu de temps, indiquant que sa charge virale a augmenté au fil du temps. En outre, les chercheurs ont collecté un échantillon viral d’un écouvillon de fossé d’égout dans un marché de volailles vivantes à Dongguan, ce qui indique sa présence dans l’environnement. Cela augmente encore la probabilité d’infections par le H5N6 chez l’homme.
conclusion
La présente étude a identifié 10 nouvelles souches de virus H5N6 de réassortiment provenant de volailles et de l’environnement qui ressemblaient à des souches virales H5N6 d’origine humaine. Les souches virales identifiées au début de l’endémie se sont ensuite regroupées en trois sous-clades géographiquement caractérisées. Cependant, ils avaient tous des mutations de susceptibilité mammifères similaires, notamment T33K, L89V et G309D, dans leur gène PB2. Les différences antigéniques entre les antisérums vaccinaux et ces virus pourraient avoir des implications sur le risque de transmission.
