Une étude explique pourquoi les personnes d’origine africaine sont moins susceptibles de trouver des donneurs de moelle osseuse

Un article rédigé par une équipe multidisciplinaire de scientifiques affiliés à diverses institutions brésiliennes, notamment l’Université de São Paulo (USP) et l’Institut national du cancer (INCA), montre que les personnes d’ascendance africaine sont moins susceptibles de trouver un donneur dans le Registre national des Donneurs volontaires de moelle osseuse (REDOME) que les personnes d’ascendance principalement européenne. L’article est publié dans Frontières en immunologie.

REDOME est la troisième plus grande banque de moelle osseuse au monde, avec plus de 5 millions de donneurs volontaires enregistrés.

Selon l’étude, avoir une ascendance génétique principalement africaine peut réduire les chances d’une personne de trouver un donneur jusqu’à 60%, et avoir des copies africaines de gènes HLA, qui doivent être compatibles avec le donneur pour rendre une greffe possible, peut les réduire de 75%.

À mesure que le degré d’ascendance africaine augmente, la probabilité de trouver une correspondance sur REDOME diminue, selon l’étude, qui discute également de ce que les auteurs affirment être une faible corrélation entre l’auto-identification conformément aux catégories utilisées par l’IBGE, le recensement national. bureau et l’ascendance génétique réelle. La classification de l’IBGE « n’explique qu’une petite partie » de l’ascendance des gens, écrivent-ils.

La classification est grossière en termes de prédiction des gènes importants pour les greffes, qui sont les gènes de la fonction immunitaire, mais elle est utilisée par REDOME. Les donateurs doivent choisir l’une de ces catégories lorsqu’ils remplissent le formulaire d’inscription. Une personne peut être d’origine africaine ou européenne en termes de gènes de la fonction immunitaire, mais les identifiants «noir», «brun» et «blanc» ne correspondent pas vraiment à ces catégories. « 

Diogo Meyer, étude PEnquêteur principal et Professeur, USP.

Meyer est spécialisé dans la génétique des populations.

L’étude conclut que les personnes qui s’identifient comme « Preto« (noir) ou »pardo« (marron, c’est-à-dire mixtes) sont jusqu’à 57% moins susceptibles de trouver des donneurs que ceux qui s’identifient comme »Branco » (blanc).

Les gènes de la fonction immunitaire HLA (antigène leucocytaire humain) se lient à des antigènes, y compris des résidus potentiellement toxiques du métabolisme cellulaire ou des fragments d’un pathogène envahissant. Les cellules T, une partie importante du système immunitaire, peuvent faire la distinction entre les antigènes produits par l’organisme et les envahisseurs.

Lorsque les molécules HLA se lient à des antigènes non reconnus, des réponses immunitaires sont déclenchées. Une correspondance parfaite entre le receveur et le donneur est donc essentielle pour éviter le rejet et assurer le succès d’une greffe de cellules souches.

Il y a plusieurs raisons à la difficulté de trouver un match pour les Brésiliens d’origine africaine, a expliqué Meyer. Ils ne sont pas représentés proportionnellement dans REDOME, qui utilise de toute façon des catégories ethniques imprécises.

Ils sont génétiquement plus diversifiés et hétérogènes que le reste de la population, et il est peu probable que deux Africains non apparentés aient des HLA identiques parce que la migration humaine a commencé en Afrique. Les personnes qui ont fait le voyage n’ont porté qu’une partie de la variabilité existante.

L’article, dont le premier auteur est la biologiste Kelly Nunes, stagiaire postdoctorale à l’USP, associe la réduction de 75% des chances de trouver un donneur avec une région du CMH d’ascendance exclusivement africaine. MHC signifie complexe majeur d’histocompatibilité, un groupe de gènes qui aident le système immunitaire à reconnaître les substances étrangères. Il comprend les HLA.

« Auto-identification comme »Preto‘est un prédicteur que la personne a une ascendance génétique africaine dans son génome. Cela inclut les gènes de la fonction immunitaire, qui sont ceux qui comptent dans le cas d’une greffe « , a déclaré Meyer. » C’est une règle de base, cependant, et il y a des exceptions, en particulier dans une population hautement mélangée comme celle du Brésil, où ce n’est pas inhabituel pour une personne qui s’identifie comme ‘Preto«avoir des gènes HLA européens. En effet, les donneurs de patients africains dans REDOME peuvent s’identifier comme ‘Branco». Cependant, plus nous avons trouvé d’individus génétiquement africains dans un échantillon de population, plus la proportion de donneurs noirs est grande. « 

Les résultats ne signifient pas que les Noirs n’ont aucune chance de trouver un donneur à REDOME, a souligné Meyer. « Nous avons comparé les probabilités d’appariement pour différentes ancêtres. Dans un cas réel de transplantation, le typage HLA doit être fait avec un haut degré de précision, et le donneur doit être en bonne santé et avoir un génotype soigneusement analysé pour s’assurer qu’il véritablement compatible. Chaque étape réduit les chances de transplantation », a-t-il déclaré.

L’étude a été soutenue par la FAPESP via une bourse de recherche régulière et une bourse postdoctorale au Brésil.

Combinaisons de chromosomes

De nombreuses questions restent sans réponse, selon Meyer. « Une chose que nous n’avons pas encore abordée est de savoir si ce qui rend difficile pour les Brésiliens d’origine africaine de trouver des donneurs, c’est d’avoir des chromosomes africains ou d’avoir un mélange de gènes africains et européens », a-t-il déclaré. « Les parties européenne et africaine sont vraisemblablement représentées dans REDOME, mais les deux combinées peuvent être rares, et des milliers de ces combinaisons peuvent être possibles. »

Selon Meyer, l’équipe ne peut pas encore répondre à la question concernant la mesure dans laquelle le mélange et le pourcentage d’ascendance africaine entravent un match. « Ces deux choses sont un peu différentes. Ce que nous savons, c’est qu’en moyenne, les personnes ayant des gènes HLA africains ont tendance à avoir plus de difficultés que les personnes d’ascendance européenne », a-t-il déclaré. « Il reste à voir s’il existe des combinaisons de chromosomes européens et africains qui peuvent également réduire la probabilité d’une correspondance. »

Au Brésil, en outre, le terme «Africain» peut désigner des personnes de différentes parties ou régions d’Afrique. « Nous avons peut-être affaire à des génotypes qui n’existent qu’au Brésil – un mélange d’ancêtres associés à différentes parties du continent africain », a déclaré Meyer. « Tout cela dépend de ce qui est représenté dans REDOME puisque nous n’avons pas caractérisé le référentiel du point de vue génétique. Nous avions juste les étiquettes ‘Preto‘,’Branco‘ et ‘pardo‘. « 

Méthodologie et échantillonnage

Le groupe, qui comprenait des scientifiques dans les domaines de la santé humaine, de la biologie, des statistiques et du calcul, a utilisé deux cohortes brésiliennes comme échantillons: l’épidémiologie des receveurs et l’évaluation des donneurs – drépanocytose au Brésil (REDS-III Brésil SCD); et EPIGEN-Brésil, qui fait partie d’une initiative de génomique des populations et d’épidémiologie génétique à l’échelle de l’Amérique latine.

Parmi les premiers, ils ont sélectionné 2 703 personnes drépanocytaires recrutées dans quatre établissements: trois banques de sang (Fundação Hemominas à Belo Horizonte, Juiz de Fora et Montes Claros; Fundação Hemope à Recife; et Fundação Hemorio à Rio de Janeiro); et l’Institut des enfants de l’hôpital das Clínicas, l’hôpital d’enseignement et général géré par la faculté de médecine de l’Université de São Paulo (FM-USP).

Dans le cas de la cohorte EPIGEN-Brésil, 5 334 individus de Salvador (État de Bahia), Bambuí (État de Minas Gerais) et Pelotas (État de Rio Grande do Sul) ont été inclus dans l’échantillon de l’étude.

« L’échantillon n’était pas composé de personnes sur la liste d’attente pour une greffe de moelle osseuse », a déclaré Meyer. « C’était un échantillon de convenance comprenant des individus avec une ascendance connue. » En ce qui concerne les drépanocytaires, cependant, les résultats peuvent anticiper des situations futures. « La plupart des personnes atteintes de la maladie sont d’origine africaine et il y a une perspective de traitement par greffe de moelle osseuse, donc ce sont des personnes qui pourraient bénéficier de ce type d’intervention à l’avenir. »

L’analyse en laboratoire des génotypes de plus de 8 000 individus aurait été trop coûteuse, c’est pourquoi les chercheurs ont utilisé une technique appelée imputation HLA basée sur le SNP.

« La structure de notre génome nous permet de faire des prédictions. Une mutation dans une position du génome peut en prédire une autre puisque nous transmettons notre matériel génétique sous la forme de morceaux de chromosomes. Ces bits sont recombinés, mais pas fusionnés comme dans un mélangeur. : il y a une certaine logique, permettant aux statisticiens et aux généticiens de développer un algorithme pour prédire les HLA d’une personne à partir des mutations dans son voisinage physique », a expliqué Meyer.

Le logiciel utilisé pour déduire l’ascendance génétique a été alimenté avec des données sur la fréquence à laquelle les variantes génétiques se produisent dans les groupes ethniques compris dans la population brésilienne.

Prochaines étapes

Selon les chercheurs, les résultats soutiennent l’idée que si REDOME souhaitait être représentatif et assurer un accès équitable aux personnes d’ascendance africaine, il devrait avoir plus de donateurs d’ascendance africaine.

« Cependant, pour que les personnes d’ascendance africaine aient autant de matches que les personnes d’ascendance européenne, il serait probablement nécessaire que la proportion des premiers dans REDOME soit plus grande que la proportion dans la population totale, car ils sont plus exigeants. ‘en termes d’échantillonnage. « 

Les chercheurs envisagent maintenant de savoir s’il est difficile pour les Brésiliens d’origine africaine de trouver un donneur parce que les chromosomes africains sont rares dans REDOME ou parce que le mélange avec des chromosomes européens crée des combinaisons difficiles à localiser.

« Nous voulons également mener une étude quantitative évolutive pour étudier la parenté en termes de CMH dans différentes parties du monde – en d’autres termes, pour découvrir à quel point deux Européens sont en moyenne plus étroitement liés que deux Africains », a déclaré Meyer.