Dans une récente étude publiée sur bioRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont évalué la sensibilité de la variante Omicron BA.2.75 du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SARS-CoV-2) aux anticorps neutralisants (nAbs).
Sommaire
Arrière plan
L’émergence de la variante hautement mutante du SRAS-CoV-2 Omicron fin 2021 a considérablement affecté l’efficacité des vaccins contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Plusieurs sous-lignées Omicron, c’est-à-dire BA.4, BA.5 et BA.2.12.1, ont entraîné de nouvelles vagues d’infections dans le monde. BA.2.75 est une sous-lignée émergente de la variante Omicron et a été signalée dans plusieurs pays.
BA.2.75 abrite neuf mutations supplémentaires par rapport à BA.2. Une substitution d’acide aminé, G446S, a été impliquée en tant que site potentiel d’échappement des nAb induits par le vaccin et de l’anticorps monoclonal (mAb), bebtelovimab (LY-CoV1404). Ceci est préoccupant étant donné que le bebtélovimab est l’un des rares anticorps de première génération à avoir une activité de neutralisation croisée contre les variants BA.2 et BA.4/5.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué la sensibilité de la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 Omicron BA.2.75 à la neutralisation par le sérum et les mAb cliniques et précliniques. Des échantillons de sérum ont été obtenus auprès de donneurs anonymes de la semaine 45 de 2021 et de la semaine 15 de 2022, représentant les vagues pré- et post-Omicron BA.1/2. Vingt échantillons ont été sélectionnés au hasard à chaque moment après le dépistage de l’activité neutralisante détectable contre le variant B.1 (D614G).
Deux mAb, le tixagevimab et le cilgavimab, ont été évalués sous leurs formulations cliniques. Alors que pour d’autres mAb, les séquences d’anticorps ont été récupérées, générées sous forme de fragments de gène, exprimées et purifiées. Ils ont effectué un essai de neutralisation de pseudovirus. Les particules lentivirales pseudo-typées ont été générées à l’aide de cellules HEK293T. Les (neuf) mutations de BA.2.75 ont été introduites dans la protéine de pointe BA.2 par mutagenèse dirigée multisite et confirmées par séquençage.
Les essais de neutralisation ont été effectués dans des cellules HEK293T-ACE2 qui expriment l’enzyme de conversion de l’angiotensine humaine 2 (ACE2). Les particules pseudovirales ont été incubées avec des échantillons de sérum dilués en série trois fois pendant une heure. Par la suite, des cellules HEK293T-ACE2 ont été ajoutées à ce mélange (sérum + pseudovirus) et incubées pendant deux jours. Ils ont mesuré la luminescence et calculé la neutralisation par rapport à la moyenne de huit témoins.
Résultats
Les auteurs ont observé une puissance de neutralisation 13 fois plus faible pour le cilgavimab contre le SRAS-CoV-2 BA.2.75 par rapport à B.1, conformément à son activité rapportée contre BA.5. Bien que faiblement neutralisant contre BA.2, le tixagevimab a restauré la neutralisation contre BA.2.75, peut-être en raison de la réversion en résidu de type sauvage à la position 493 du pic.
Le bebtélovimab a montré une neutralisation puissante contre BA.2.75, bien qu’il ait eu une puissance six fois inférieure par rapport à son activité contre B.1. L’imdevimab (REGN10987), le casivirmab (REGN10933), l’étésevimab (LY-CoV0616) et le bamlanivimab (LY-CoV555) n’ont pas neutralisé BA.2.75. Les chercheurs ont observé que la neutralisation de BA.2.75 par des échantillons de sérum pré-Omicron BA.1/2 wave se produisait avec les titres moyens géométriques (GMT) les plus bas.
Les titres neutralisants contre BA.2.75 étaient huit fois réduits par rapport à B.1 et significativement inférieurs à ceux contre BA.2. Les sérums après la vague BA.1/2 ont montré un pouvoir neutralisant amélioré contre B.1 et une activité de neutralisation croisée accrue contre les sous-lignées Omicron. Les MGT étaient plus de six fois plus élevées pour les échantillons de sérum post-vague que pour les échantillons pré-vague, vraisemblablement en raison de la contribution combinée d’une dose de rappel de vaccin et des infections BA.1/2.
conclusion
En résumé, l’étude a observé que le SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75 était moins immuno-évasif que la variante BA.5 actuellement prédominante dans les échantillons de sérum testés. Le variant était modérément sensible au cilgavimab et au tixagevimab, qui constituent le cocktail Evusheld, un cocktail mAb largement utilisé.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
