Des études récentes ont montré que les patients dont le système immunitaire est affaibli – ce qui permet au virus responsable du COVID-19 de rester plus longtemps dans le corps, de se copier et de changer continuellement – peuvent permettre le développement de nouvelles versions légèrement différentes du virus (variantes) . Ces personnes comprennent celles qui sont traitées avec des médicaments qui suppriment le système immunitaire pour l’empêcher de rejeter un organe nouvellement transplanté.
Une nouvelle étude menée par des chercheurs de la NYU Grossman School of Medicine et de la NYU Long Island School of Medicine montre que deux personnes transplantées rénales qui ont été traitées avec des médicaments immunosuppresseurs et qui ont ensuite eu une longue infection au COVID-19 ont développé une version du virus. avec un changement génétique (mutation) qui l’a rendu résistant à la thérapie antivirale remdesivir.
Ce traitement fait partie des premiers médicaments antiviraux approuvés pour une utilisation dans la pandémie et reste une arme importante contre le coronavirus pandémique. Le remdesivir est particulièrement important pour les personnes qui ont reçu une greffe car le Paxlovid, plus récemment développé, une combinaison de nirmatrelvir et de ritonavir, peut interférer avec les immunosuppresseurs parfois utilisés pour ces patients, expliquent les auteurs de l’étude.
Les résultats de l’étude reflètent un problème standard en médecine antivirale, dans lequel le processus de reproduction rapide et sujet aux erreurs des virus crée en permanence des versions génétiques légèrement différentes d’eux-mêmes. Certains développent au hasard les qualités nécessaires pour résister au traitement médicamenteux. Dans le cas du SRAS-CoV-2, le virus pandémique, on pense que le remdesivir agit en interférant avec la capacité du virus à créer des copies de lui-même grâce à l’action d’une polymérase, une enzyme virale.
Selon les résultats, les deux personnes ont été initialement infectées par une version du coronavirus qui ne portait pas la mutation qui confère une résistance au remdesivir. Cependant, après un traitement avec l’agent antiviral, le virus a développé la mutation du gène de la polymérase dépendante de l’ARN V7921 (V7921), qui a déjà été démontrée en laboratoire pour rendre le virus plus résistant au remdesivir.
Nos découvertes peuvent aider à expliquer comment le coronavirus continue de développer une résistance au traitement. Il est possible que le traitement antiviral lui-même, combiné au système immunitaire affaibli des patients, ait entraîné l’évolution de cette mutation inquiétante. »
John I. Hogan, MD, auteur principal, professeur adjoint, département de médecine, NYU Langone Health
Malgré la disponibilité de vaccins et de plusieurs pharmacothérapies pour le COVID-19, les experts affirment que les personnes dont le système immunitaire est affaibli, comme les patients transplantés et les personnes atteintes d’un cancer ou d’un VIH non traité, restent à haut risque de contracter la maladie. La nouvelle étude, publiée en ligne le 26 septembre dans la revue Maladies infectieuses cliniquesest le premier à identifier la mutation V7921 résistante au remdesivir chez les personnes ayant subi une greffe d’organe et traitées avec le médicament antiviral, selon le Dr Hogan.
Pour l’enquête, qui a été financée par NYU Langone, l’équipe de l’étude a prélevé des échantillons des narines des deux personnes, l’une dans la cinquantaine et l’autre dans la soixantaine, qui avaient chacune reçu une greffe de rein et utilisaient des médicaments immunosuppresseurs. Bien qu’ils aient été vaccinés contre le COVID-19 avant l’opération, les deux ont développé des symptômes de la maladie, tels que fatigue, toux et fièvre, qui ont persisté pendant des mois.
L’équipe d’étude a examiné la composition génétique des échantillons viraux au Genome Technology Center de NYU Langone en comparant de petites coupures du code génétique pour identifier les mutations trouvées dans chaque souche. Selon les chercheurs, ces drapeaux génétiques offrent des résultats similaires à ceux des tests utilisés pour retracer l’ascendance des personnes et pour le suivi d’autres épidémies virales, notamment la grippe, le VIH et Ebola.
Selon le rapport, les deux personnes ont été traitées pour COVID-19 avec du remdesivir mais ont été réadmises à l’hôpital plusieurs semaines plus tard alors que leurs symptômes s’aggravaient à nouveau. Ils ont survécu à leurs maladies.
Cependant, lorsque les chercheurs ont réanalysé les virus, ils ont confirmé la présence de la mutation V7921, qui n’était pas présente avant que les greffés ne reçoivent leur traitement au remdesivir.
« Nos résultats soulignent l’importance de continuer à surveiller l’évolution du coronavirus au fil du temps et de rester à l’affût des mutations génétiques qui permettent au virus de surmonter les efforts de la communauté médicale pour le contrecarrer », déclare Adriana Heguy, PhD, auteure principale de l’étude et génomique. « À l’avenir, les médecins pourraient également dépister de telles mutations avant de prendre des décisions de traitement pour leurs patients les plus vulnérables », ajoute le Dr Heguy, professeur au Département de pathologie de NYU Langone.
Le Dr Heguy ajoute que l’émergence de mutations résistantes au traitement peut également nécessiter le développement de thérapies antivirales supplémentaires ou le développement de médicaments combinés pour contrôler l’infection. Des approches similaires du traitement antiviral ont mené au succès dans l’épidémie de VIH.
Le Dr Heguy, également directeur du Genome Technology Center, déclare que les auteurs de l’étude prévoient ensuite d’explorer plus avant les mutations qui permettent au coronavirus d’échapper aux vaccins et aux thérapies. Une piste d’intérêt est la protéine de pointe, une structure utilisée par le virus pour s’accrocher à la surface des cellules humaines comme première étape pour les infecter. Notamment, les traitements par anticorps monoclonaux utilisés pour traiter le COVID-19 se lient à cette même protéine de pointe afin d’empêcher le virus d’attaquer les cellules ou de le rendre plus vulnérable aux défenses de l’organisme.
Le Dr Heguy prévient qu’en tant que petite étude de cas, l’enquête offre une perspective limitée du développement viral.
