Dans une étude récente publiée dans le Maladie infectieuse émergente journal, les chercheurs ont comparé la neutralisation associée à la sous-lignée Omicron BA.5 du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) aux sous-lignées Omicron BA.1/BA.2 chez les patients vaccinés et convalescents.
Lettre de recherche : Neutralisation d’Omicron BA.5 chez les personnes vaccinées ayant déjà contracté des infections à Omicron BA.1/BA.2. Crédit d’image : Jo Panuwat D/Shutterstock
Arrière plan
Depuis fin 2021, la variante SARS-CoV-2 Omicron a constamment causé la majorité des infections, avec plus de trois nouvelles sous-variantes qui pourraient efficacement échapper à l’immunité. Au printemps 2022, une première vague d’infections due à la sous-variante Omicron BA.1 a été rapidement remplacée par une vague de la sous-variante BA.2, qui a ensuite été remplacée par la sous-variante BA.5. Le BA.5 était significativement plus contagieux et représentait 75% à 95% des cas de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) en août 2022.
Étant donné qu’une proportion importante de la population mondiale a été infectée par Omicron au début de 2022, la recherche se concentre sur la question de savoir si les personnes convalescentes ont acquis une immunité naturelle qui pourrait les protéger des sous-variantes BA.4/BA.5. Des études de neutralisation du sérum ont montré que ni l’immunisation ni l’infection antérieure diagnostiquée lors des premières vagues d’infections à Omicron n’offraient une protection suffisante contre BA.5. Des études récentes ont révélé qu’un nombre relativement moindre de patients infectés par BA.5 avaient déjà reçu un diagnostic d’infection par Omicron, ce qui suggère qu’une infection antérieure par Omicron pourrait protéger contre une infection par BA.5
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont examiné la capacité de neutralisation virale authentique entre ceux qui ont reçu des régimes de vaccination BNT162b2 à trois doses et ceux qui ont été immunisés et infectés plus tard par les sous-variants SARS-CoV-2 Omicron BA.1/BA.2.
À Odense, au Danemark, l’équipe a recruté des personnes en bonne santé parmi le personnel de l’hôpital universitaire d’Odense et le grand public. Quatre semaines après avoir reçu leur troisième vaccination BNT162b2, des échantillons de sérum ont été prélevés sur les 24 membres de la cohorte vaccinée entre le 18 novembre 2021 et le 4 février 2022. De plus, des échantillons de sérum ont été prélevés sur 12 personnes de la cohorte convalescente entre le 26 janvier et le 19 avril 2022 , quatre semaines après que les participants ont signalé des percées d’infections Omicron BA.1/BA.2.
Des tests de neutralisation par réduction de plaque (PRNT) ont été effectués sur des isolats cliniques SARS-CoV-2 Delta et Omicron authentiques BA.1, BA.2 et Ba.5. L’équipe a mesuré les titres de PRNT90, la dilution sérique la plus élevée entraînant une réduction de plaque de plus de 90 %. Les lignées ont été identifiées par séquençage du génome entier nanopore (WGS). Tous les échantillons de sérum ont été testés pour les anticorps spécifiques à la pointe. De plus, à l’aide du test d’immunoglobuline (Ig)-G Alinity SARS-CoV-2, des échantillons de sérum ont été évalués pour les anticorps spécifiques de la nucléocapside afin de déterminer le statut de SARS-CoV-2–naïf au sein du groupe vacciné.
Résultats
Des échantillons de sérum de la cohorte vaccinée ont montré une neutralisation du sous-variant Omicron BA.5 à un titre PRNT90 médian de 20. En revanche, des échantillons de sérum de la cohorte convalescente ont montré une neutralisation de BA.5 à un titre PRNT90 médian de 160. En outre, Wilcoxon rank-sum test a indiqué que cette multiplication par huit de la neutralisation suite à une infection par Omicron avait une signification statistique. De plus, la cohorte convalescente a affiché une neutralisation des sous-variants SARS-CoV-2 Delta et Omicron BA.1/BA.2 à des niveaux considérablement plus élevés que la cohorte vaccinée. Dans les groupes convalescents et vaccinés, la neutralisation de BA.5 a été notée à des titres médians deux à huit fois inférieurs à ceux des autres souches virales.
Neutralisation des variantes du SRAS-CoV-2 chez les personnes vaccinées avec et sans infections antérieures par Omicron BA.1/BA.2, Danemark. A) PRNT90 titres contre la variante SARS-CoV-2 Delta et les variantes Omicron BA.1, BA.2 et BA.5. B) Corrélation entre les niveaux d’anticorps de pointe et PRNT90 titres. Les participants ont reçu 3 doses de BNT162b2 (Pfizer-BioNTech), 2 vaccins initiaux et une dose de rappel. Nous avons analysé les titres de 24 participants vaccinés (points bleus) qui ont reçu 3 doses de BNT162b2 uniquement et de 12 participants convalescents (points rouges) qui ont reçu 3 doses de vaccin et ont été infectés par Omicron BA.1/BA.2. Pour l’analyse statistique, un test de Kruskal-Wallis a été appliqué initialement pour tenir compte du problème des comparaisons multiples. Par la suite, PRNT non apparié90 les titres ont été comparés avec le test de somme des rangs de Wilcoxon, tandis que le PRNT apparié90 les titres ont été comparés avec le test de classement des signes de Wilcoxon. Les lignes horizontales rouges indiquent le seuil de neutralisation ; les barres horizontales indiquent le titre médian de neutralisation pour chaque contrainte SARS-CoV-2. BAU, unités d’anticorps de liaison; C, participant convalescent ; PRNT90, tests de neutralisation de réduction de plaque avec réduction de plaque > 90 % ; V, participant vacciné.
Les concentrations médianes d’anticorps spécifiques à la pointe du SRAS-CoV-2 variaient entre les cohortes, les cohortes vaccinées et convalescentes ayant respectivement 5 535 et 5 675 unités d’anticorps de liaison/mL. Cependant, le test de somme des rangs de Wilcoxon a révélé que cette variation n’était pas statistiquement importante. De plus, une association a été observée entre les concentrations d’anticorps viraux de pointe et les titres de PRNT90 au sein de la cohorte vaccinée, alors qu’une relation similaire n’a pas été trouvée dans le groupe convalescent.
Selon des études de neutralisation in vitro, une infection passée par BA.1/BA.2 ne confère aucune immunité perceptible contre BA.5. L’équipe a évalué deux cohortes petites mais étroitement appariées avec des données démographiques, des intervalles de prélèvement sanguin et des niveaux d’anticorps comparables. Les infections diagnostiquées dans la vague Omicron BA.1/BA.2 ont considérablement amélioré la capacité de neutralisation de BA.5 chez les personnes recevant des régimes de vaccination à trois doses.
Dans l’ensemble, l’étude a montré que l’infection par Omicron BA.1/BA.2 semblait réduire la sensibilité aux sous-variantes émergentes d’Omicron comme BA.5 chez les personnes ayant reçu trois doses du vaccin BNT162b2. En conjonction avec le déclin plus lent récemment signalé de l’immunité induite par l’infection par Omicron, les résultats de l’étude suggèrent qu’une infection antérieure par Omicron augmente considérablement la protection humorale.
