Dans une récente étude pré-imprimée publiée sur Place de la recherche* en cours d’examen pour publication dans Rapports de biologie moléculaire, les chercheurs ont évalué l’association entre les allèles des antigènes leucocytaires humains (Hla) et la gravité de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).
Le COVID-19 a profondément impacté de nombreuses vies à travers le monde. Alors que l’infection par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) a entraîné une maladie grave avec de nombreuses hospitalisations et décès, les patients diagnostiqués avec une infection bénigne se sont rétablis à domicile avec un traitement conservateur. La présentation clinique diversifiée de l’infection virale justifie une compréhension de la constitution génétique des patients. Cela permettrait de prédire la réponse du patient à l’infection et aiderait à concevoir des mesures de traitement en conséquence.
Le système Hla contribue essentiellement à la réponse immunitaire de l’hôte par la régulation des médiateurs inflammatoires tels que les cytokines et les chimiokines qui sont responsables de la manifestation clinique du COVID-19. Ce système comprend trois classes de gènes (classes I, III et II), parmi lesquelles les haplotypes Hla-C, A et B des gènes de classe I et les haplotypes Hla-DQ, DP et DR des gènes de classe II offrent une résistance à la hôte contre la dissémination virale. Les polymorphismes dans les allèles pourraient augmenter la sensibilité et affecter le résultat clinique des infections par le SRAS-CoV-2.
Bien que des études antérieures aient étudié le rôle du système Hla dans la gravité du COVID-19, les résultats ont été variés, probablement en raison de l’effet des différences géographiques sur les polymorphismes génétiques.
Sommaire
À propos de l’étude
Dans la présente étude prospective, les chercheurs ont étudié l’association entre les haplotypes HLA des gènes de classe II et I et la gravité du COVID-19. Ils ont évalué si les allèles pouvaient prédire le risque d’infection grave par le SRAS-CoV-2.
Un total de 59 patients turcs COVID-19 diagnostiqués par réaction en chaîne par polymérase de transcriptase inverse (RT-PCR) d’août 2020 à août 2021 ont été inclus dans cette étude. Sur les 59 patients, 30 ont dû être admis en unité de soins intensifs (USI) et ont été classés dans le groupe sévère (SG). Ces patients présentaient une dyspnée, une saturation en oxygène égale ou inférieure à 93 %, une fréquence respiratoire égale ou supérieure à 30 respirations/minute, des rapports de 50 % des pressions partielles dans les artères et de la fraction d’oxygène inspirée en un à deux jours, un choc septique, une insuffisance respiratoire , ou une défaillance ou un dysfonctionnement multiviscéral. Le groupe non sévère (NSG) comprenait 29 participants qui ont nécessité un examen de suivi dans les cliniques. Les deux groupes d’étude ont été comparés à un groupe de 30 témoins sains (HC).
Les données démographiques, les comorbidités, les résultats de laboratoire et cliniques des participants ont été obtenus. Du sang a été prélevé sur tous les participants, après quoi leur acide désoxyribonucléique (ADN) a été isolé et utilisé pour le typage Hla dans un laboratoire hospitalier turc. La technique d’oligonucléotide spécifique de séquence (SSOP) a été utilisée pour le typage tissulaire HLA. Les haplotypes Hla du complexe majeur d’histocompatibilité (CMH) B, A, C des gènes de classe I et les haplotypes HLA DQB1, DRB1 et DQA1 des gènes de classe II de chaque parent d’un individu sont appariés pour le typage Hla et les trois groupes ont été évalués de manière comparative.
Résultats et discussion
Des différences d’âge significatives ont été observées entre les groupes SG et HC avec un âge moyen de 41 ans en SG. La mortalité, ainsi que les comorbidités telles que les maladies cardiovasculaires et l’hypertension, étaient nettement plus élevées chez les participants au SG. Ces résultats indiquent que l’âge avancé et les comorbidités augmentent le risque de COVID-19 sévère.
Dans le groupe parent-1 Hla, les allèles A*32, A*26, B*41, DRB1*14, DRB1*8, C*14 et C*16 étaient présents dans SG alors que la présence de B*52, C Les allèles *5, B*27 et aDQB1*4 ont été notés dans les deux groupes d’étude, mais pas dans HC.
De plus, les groupes NSG et SG ont démontré les allèles B * 37, A * 68, B * 58, DQB1 * 4, C * 14 et DRB1 * 16 des groupes parent-2 Hla. Ces allèles sont connus pour améliorer la sensibilité au COVID-19. Les groupes Parent-2 HLA B*15, A*1, B*54 et DQB1*4 étaient exclusivement présents dans HC, indiquant leur activité protectrice contre le COVID-19.
Conclusion
Les découvertes d’étude ont prouvé que l’allèle d’A*32 Hla a été associé à COVID-19 sévère puisque cet allèle était le seul recensé dans les parents 1 et 2 dans SG. Cette découverte indique que l’allèle Hla-A*32 a une valeur pronostique dans la sévérité du COVID-19. Cependant, de futures études avec de grandes bases de données de gènes et des échantillons de plus grande taille doivent être menées pour déchiffrer la diversité génétique dans le système Hla en fonction des différences régionales. Cela améliorerait les connaissances sur la distribution et les fréquences variables des allèles et permettrait une meilleure prédiction de l’infection grave par le SRAS-CoV-2.
Les stratégies de traitement pourraient être adaptées en fonction de l’évaluation du risque Hla pour l’administration des schémas thérapeutiques les plus appropriés aux patients. Cela conduirait à une réduction de la morbidité et de la mortalité du COVID-19.
*Avis important
Research Square publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
