Les chercheurs ont découvert que certains cancers de l'enfance ont un nombre sensiblement plus élevé de changements d'ADN qu'on ne le pensait précédemment, modifiant la façon dont nous considérons les tumeurs des enfants et ouvrant éventuellement des options de traitement nouvelles ou réutilisées.
Se concentrant sur un type de cancer du rein de l'enfant, connu sous le nom de Wilms Tumor, une équipe internationale génétiquement séquencée plusieurs tumeurs à une résolution qui n'était pas possible auparavant. Cette collaboration comprenait des chercheurs du Wellcome Sanger Institute, de l'Université de Cambridge, du Princess Máxima Center for Pediatric Oncology, de l'Oncode Institute aux Pays-Bas, du Great Ormond Street Hospital et de Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust.
Ils ont découvert beaucoup plus de changements génétiques par cellule cancéreuse que prévu, ajoutant à des millions de changements par tumeur. Cela suggère que certaines tumeurs infantiles pourraient être éligibles à des traitements tels que l'immunothérapie.
Dans l'étude, publiée aujourd'hui (29 mai) Communications de la naturel'équipe décrit également un seul changement génétique spontané qui provoque un type rare de tumeur de Wilms, dont les enfants naissent, et que ce changement se produit tôt pendant le développement dans l'utérus. Ils ont constaté que ces tumeurs ont une apparence particulière sous le microscope et le profil génétique, ce qui implique qu'il pourrait être possible, à l'avenir, de développer une thérapeutique personnalisée et des plans cliniques d'aide à ceux qui ont ce changement génétique.
Cette recherche remet en question l'idée largement répandue que les cancers de l'enfance ont un très faible nombre de changements génétiques et suggère plutôt qu'il pourrait y avoir des traitements adultes efficaces qui pourraient être adaptés aux tumeurs infantiles à l'avenir.
La tumeur de Wilms est un type de cancer du rein qui affecte largement les enfants de moins de cinq ans. Au Royaume-Uni, environ 85 enfants reçoivent un diagnostic de tumeur Wilms chaque année.
Auparavant, on pensait que les tumeurs cancéreuses infantiles, comme celles de la tumeur de Wilms, avaient un faible nombre de changements génétiques, également appelés variantes génétiques.
Pour étudier comment et pourquoi ces tumeurs se présentent si tôt dans la vie, l'équipe du Sanger Institute et de leurs collaborateurs a appliqué les dernières techniques de séquençage génomique pour mieux comprendre comment et quand ces changements génétiques se sont produits.
Les méthodes de séquençage du génome entier entièrement permettent aux chercheurs de trouver des changements génétiques partagés par toutes les cellules de la tumeur. Bien que cela puisse bien fonctionner pour les tumeurs adultes, car les cellules ont eu plus de temps pour se développer, les tumeurs infantiles ont moins de changements génétiques partagés, ce qui signifie que le grand nombre de mutations qui ne sont pas partagées par toutes les cellules sont manquées.
Pour surmonter cela, l'équipe a utilisé deux techniques de pointe: le séquençage du nanorate, autrement connu sous le nom de nanoseq, et le séquençage du génome entier d'organeïdes dérivés d'une cellule pour étudier les tumeurs rénales à une résolution beaucoup plus élevée. Ces méthodes permettent aux scientifiques de trouver des changements génétiques qui pourraient être présents dans une seule cellule d'un cancer.
L'équipe a utilisé ces méthodes pour séquencer génétiquement les échantillons de tumeurs Wilms de quatre enfants, âgés de six mois. Ils ont constaté qu'une seule cellule cancéreuse avait 72 à 111 changements génétiques supplémentaires en plus de ceux déjà identifiés via des méthodes de séquençage du génome entier en vrac. Cela signifie que lorsque le nombre global de cellules dans la tumeur est pris en considération, il y a très probablement des millions de changements génétiques par tumeur dans l'ensemble, pas les faibles nombres qui étaient précédemment pensés.
Parallèlement à la modification de notre compréhension des tumeurs infantiles, cette nouvelle constatation pourrait également avoir des implications pour le traitement. Les chercheurs suggèrent qu'avec ce nombre de changements génétiques possibles, il est probable que les tumeurs pourraient devenir résistantes aux traitements plus rapidement, ou que certains médicaments pourraient ne pas fonctionner du tout.
Cependant, cette découverte pourrait également signifier que les tumeurs infantiles sont de meilleures candidats pour les traitements existants qui sont actuellement utilisés pour les tumeurs adultes, comme les immunothérapies.
L'équipe a également tracé l'évolution des tumeurs chez trois enfants et a découvert une nouvelle mutation qui provoque la tumeur de Wilms. Ce seul changement dans le Foxr2 Le gène s'est avéré se produire pendant que le rein se développait dans l'utérus et est associé à une apparence particulière de la tumeur au microscope et à un ensemble spécifique de changements d'ARN. Les chercheurs suggèrent que cela pourrait être utilisé pour identifier ces tumeurs et qu'un jour, il peut être possible de développer un traitement personnalisé spécifique pour certains profils génétiques dans la tumeur de Wilms.
Les méthodes de séquençage répandues sont incroyablement utiles pour un grand nombre de tumeurs cancéreuses, en particulier chez les adultes. Cependant, ils ne parviennent pas à capturer la véritable complexité génétique des cancers, en particulier ceux qui se produisent chez les plus jeunes. Avec ces dernières techniques de séquençage génomique, nous pouvons maintenant voir une image beaucoup plus détaillée de la tumeur Wilms, qui peut se produire chez les nouveau-nés. Cela pourrait nous aider à comprendre cette condition plus en détail et peut changer notre façon de voir et de traiter les tumeurs infantiles dans son ensemble. «
Dr Henry Lee-Six, co-prime auteur, Wellcome Sanger Institute
Le Dr Jarno Drost, auteur co-ennior au Princess Máxima Center for Pediatric Oncology and the Oncode Institute aux Pays-Bas, a déclaré: « Être en mesure de retracer l'évolution d'une tumeur peut découvrir des informations cruciales sur comment et pourquoi elle se développe. Abaisser le risque de récidive, tout en minimisant l'impact que cela peut avoir sur la qualité de vie d'un jeune enfant et sa famille.
Le professeur Sam Behjati, auteur co-ennior du Wellcome Sanger Institute et de Cambridge University Hospitals Foundation Trust, a déclaré: « Il a été une croyance largement détenue que les tumeurs infantiles avaient un nombre beaucoup plus faible de changements génétiques que les tumeurs adultes. Cependant, grâce au développement de nouveaux outils de séquençage génomique, nous avons pu montrer que, au moins dans ces cas, ce qui n'est pas vrai. Cellule que prévu, ce qui ajoute des millions de changements par tumeur, soulignant que ce que nous pouvions voir auparavant était juste la pointe de l'iceberg.
