Annoncer une nouvelle publication pour Acta Materia Medica journal. Les données de séquençage d'ARN unique (SCRNA-SEQ) provenant d'ensembles de données publiés ont été obtenus pour étudier l'expression et la dérégulation des protéines de liaison à l'ARN (RBP), qui sont essentielles pour l'épissage alternatif d'ARNm et le contrôle translationnel dans l'arthrite rhumatoïde (RA). La façon dont la régulation de la RBP diffère entre la RA et l'arthrose (OA) a été examinée en utilisant la RBP pour le sous-clustering monomores.
Des réactions en chaîne de polymérases quantitatives (PCR) ont été effectuées pour confirmer les RBPs exprimées différentiellement dans des synoviocytes de type fibroblaste RA (FLSS) et OA-FLSS, ainsi que chez les souris avec une arthrite induite par le collagène (CIA) et des souris témoins. De plus, des données ARN-SEQ en vrac ont été collectées et des analyses de co-expression d'épissage alternative RBP (ASE) ont été effectuées pour révéler le rôle régulateur potentiel des PRA liés à la RA sur ASE. Des variations significatives dans les proportions relatives de sous-types cellulaires étaient des démonstrations entre RA et OA avec des RBP régulées à la baisse dépassant les RBP régulées à la hausse dans chaque type de cellule et montrant une spécificité élevée pour des sous-ensembles particuliers. Cent cinq régulés à la hausse et 133 RBP régulés à la baisse ont été identifiés dans les fibroblastes. La protéine de liaison à la boîte Y (YBX3) et la sous-unité 6 (SF3B6) du facteur d'épissage 3b (SF3B6) ont été confirmées comme étant régulées à la hausse chez les souris RA-FLS et CIA, tandis que le facteur d'initiation de la traduction eucaryote 4A1 (EIF4A1) et U2 Small Nuclear ARN Auxiliary Facteur 1 (U2AF1 ) ont été régulés à la baisse dans RA-FLS. Le groupe RA a affiché des interactions de type cellulaire plus fortes par rapport au groupe OA avec des voies de signalisation améliorées, telles que la fibronectine 1-cluster de différenciation 44 (FN1-CD44) et le récepteur de chimiokine 4-CXC de chimiokine du motif CXC (CXCL12-CXCR4).
De plus, trois gènes régulés à la hausse (répétition de la spectrine contenant une protéine d'enveloppe nucléaire 2 (SYNE2), la protéine de liaison au calcium S100 (S100A9) et une protéine induite par l'interféron avec des répétitions tétratricopeptidiques 3 (IFIT3)) et quatre gènes régulés à la baisse (ribonucléase 1 (Rnase1), granuline (GRN), FN1 et la sorbine et le domaine SH3 contenant 2 (SORBS2)) ont été co-exprimés dans des RBP et AS associés à RA.
Ces résultats suggèrent que la dérégulation des RBP peut contribuer au développement de la PR et fournir des cibles potentielles pour des interventions thérapeutiques.
