Un nouvel effort majeur à Weill Cornell Medicine cherche à cataloguer le virome humain normal, l'immense écosystème de virus qui vit et sur nous. Le travail, qui fait partie d'une collaboration multi-institution appelée viromes à travers l'espace et le temps (vaste), soutenue par l'Institut national sur le vieillissement, qui fait partie des National Institutes of Health, pionnier de nouvelles techniques, éclairera un aspect crucial de la biologie humaine qui était impossible à étudier auparavant et à établir un ensemble de données de base qui pourrait aider à prévenir, diagnostiquer et traiter les maladies.
La plupart des virus ne rendent pas les humains malades. En effet, les virologues soupçonnent longtemps que le monde est inondé de virus qui ne provoquent aucune maladie et que les tests de laboratoire traditionnels ne peuvent pas détecter, mais les progrès récents du séquençage de l'ADN et de l'ARN et de la bioinformatique leur ont finalement permis de sonder cette matière sombre biologique. Naturellement, une grande partie de ce travail s'est concentrée sur la façon dont les changements dans le virome peuvent contribuer à la maladie. Le nouveau projet aborde une question tout aussi importante: à quoi ressemble un Virome sain?
« Nous voulons avoir une meilleure compréhension de la variation virale, de l'abondance et de la variété dans le monde, en particulier chez les personnes qui ne vivent que des vies normales », a déclaré le Dr Christopher Mason, professeur mondial de génomique et de biomédecine informatique à Weill Cornell Medicine et chercheur principal sur le projet. Le Dr Alexander Lucaci, un boursier postdoctoral dans le laboratoire du Dr Mason, a ajouté que « la plupart de ce que nous savons sur les virus provient des agents pathogènes, mais nous essayons maintenant de comprendre ceux qui existent en nous, et nous n'avons vraiment aucune idée de ce qu'ils font. »
VAST s'appuiera sur une grande bibliothèque d'échantillons que le Dr Mason Lab a déjà collecté et suivra également des cohortes de participants supplémentaires au cours de la course de cinq ans du projet et au-delà. Les participants vont des enfants et des adolescents aux personnes âgées, de différentes parties du monde et avec un large éventail d'histoires de vie.
« Nous aurons des dizaines de milliers d'échantillons et des cohortes longitudinales que nous suivons pendant des années et des métadonnées supplémentaires sur leurs expositions », a déclaré le Dr Lucaci, qui dirige l'analyse bioinformatique du projet.
Les équipes de Weill Cornell Medicine et Stanford Medicine diviseront le travail. Chez Weill Cornell Medicine, le groupe du Dr Mason se concentrera sur la biologie moléculaire et la biologie informatique et le Dr Inmaculada de Melo-Martin, professeur d'éthique médicale en médecine, analysera l'éthique d'une telle collecte de données à grande échelle. Au total, VAST jettera les bases d'une approche plus complète de la virologie.
Cette couche fondamentale d'informations nous aidera à voir comment le virome normal se déplace basé sur différentes maladies ou les antécédents d'une personne, et il peut également y avoir des virus qui sont généralement asymptomatiques qui deviennent des agents pathogènes opportunistes. «
Dr Christopher Mason, professeur de physiologie et de biophysique, Weill Cornell Medicine
