Un nouveau test génétique développé à la Mayo Clinic consiste à redéfinir la façon dont les cliniciens diagnostiquent et géraient la pancréatite héréditaire. La pancréatite, l'inflammation du pancréas, est une condition complexe qui peut entraîner des douleurs chroniques, des hospitalisations répétées et de graves complications, notamment le diabète, l'insuffisance rénale et le cancer du pancréas.
Le nouveau panel de gènes de pancréatite héréditaire disponible dans les laboratoires de la Mayo Clinic (Mayo ID: Pangp) résulte de la collaboration entre les scientifiques, les cliniciens et les conseillers génétiques des laboratoires de Mayo Clinic, servant de premier exemple de l'innovation par les besoins des patients.
La pancréatite peut être difficile à diagnostiquer et à gérer. Il peut être aigu, récurrent ou chronique. Dans de nombreux cas, la cause sous-jacente reste insaisissable. Les symptômes peuvent inclure des douleurs au ventre, de la fièvre, un maux d'estomac, un pouls rapide et une perte de poids involontaire. La pancréatite peut provoquer de graves complications, notamment les problèmes respiratoires, les infections, le diabète, l'insuffisance rénale et le cancer du pancréas.
Sur le plan international, environ 2,75 millions de nouveaux cas de pancréatite ont été diagnostiqués en 2021, et lorsque des cas existants ont été ajoutés, 5,9 millions de personnes avaient la maladie, selon la plus récente feuille statistique de l'Institut pour les métriques de la santé et l'évaluation.
La pancréatite est une maladie complexe avec de nombreuses causes potentielles – alcool, tabagisme, auto-immune, toxines et oui, génétique. Lorsque nous ne trouvons pas de cause claire, les tests génétiques deviennent essentiels. »
Motaz Ashkar, MBBS, gastro-entérologue à la clinique pancréatique à la clinique Mayo
Le nouveau panel étend le test précédent de Mayo de quatre gènes à neuf, incorporant les dernières recherches et perspicacité clinique. Contrairement à de nombreux panneaux commerciaux qui comprennent des dizaines, voire des centaines de gènes, le test de Mayo est intentionnellement axé.
« Il y a un état d'esprit dans les tests génétiques que plus grand est meilleur », explique Linda Hasadsri, MD, Ph.D., un généticien moléculaire clinique à Mayo Clinic. « Mais si vous incluez des gènes avec des associations faibles ou non prouvées, vous risquez de donner aux patients des résultats déroutants ou dénués de sens. »
Le résultat de cette orientation est un panel qui comprend des gènes bien établis tels que PRSS1, Spink1, CFTR et CTRC et des ajouts plus récents tels que CPA1, CASR et CLDN2 qui sont de plus en plus reconnus pour leur rôle dans la pancréatite et le risque de cancer du pancréatique.
Le test est construit sur le séquençage de l'exome entier, qui examine tous les gènes provoquant la maladie dans le plan ADN d'un individu, permettant une analyse complète des régions de codage à travers le génome. Cette approche s'accompagne de défis, surtout en ce qui concerne les gènes délicats comme PRSS1.
« PRSS1 est la cause la plus courante de la pancréatite héréditaire dans le monde, en particulier chez les enfants », explique le Dr Hasadsri. « Mais il est notoirement difficile de tester avec précision. Nous avons vu beaucoup de faux positifs et de faux négatifs d'autres laboratoires au fil des ans. »
Pour y remédier, Mayo a développé un test personnalisé avec plusieurs méthodes supplémentaires pour aider à confirmer les résultats et à éviter un diagnostic erroné. Le laboratoire a également intégré des capacités de test réflexe – ce qui signifie que si un fournisseur commande le panneau et le résultat n'est pas concluant, le laboratoire peut automatiquement effectuer des tests supplémentaires sans nécessiter un nouvel échantillon ou facturer à nouveau le patient.
L'impact clinique du test est significatif. Un résultat positif peut aider à expliquer les symptômes d'un patient, à guider les décisions de traitement et même à éclairer les stratégies de surveillance du cancer.
« Si quelqu'un a une mutation pathogène de PRSS1, son risque de cancer du pancréas est plus élevé », explique le Dr Ashkar. « Nous pouvons commencer à les surveiller plus tôt et plus fréquemment. »
Il ouvre également la porte aux tests familiaux.
« Si un patient est testé positif, nous pouvons filtrer leurs proches – même ceux qui sont asymptomatiques », explique le Dr Hasadsri. « Cela permet une intervention précoce et des changements de style de vie qui pourraient empêcher la progression de la maladie. »
Même un résultat négatif peut être significatif, aidant à exclure les causes héréditaires et à réduire les tests ou l'anxiété inutiles « , ajoute-t-elle.
Bien que le panel actuel se concentre sur les variantes d'un seul gène, l'équipe réfléchit déjà à la possibilité de créer un test de score de risque polygénique pour la pancréatite – un test qui évaluerait plusieurs facteurs de risque pour calculer le risque d'une personne pour la maladie.
