Dans une récente revue publiée dans le Pathogènes PLOS Journal, les chercheurs ont examiné les données existantes sur les voies potentielles par lesquelles Candida auris peut être introduit dans l’environnement et évalué les caractéristiques environnementales qui peuvent influencer sa persistance et sa transmission dans la nature.
Étude: Réservoirs environnementaux de la levure pathogène résistante aux médicaments Candida auris. Crédit d’image : Kateryna Kon/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
C. auris est un agent pathogène humain émergent ; cependant, malgré les caractéristiques phénotypiques et les preuves génétiques indiquant son émergence probable à partir de réservoirs naturels, les données sur la phase environnementale du cycle de vie de l’organisme et les voies de transmission associées sont limitées.
Identifier les réservoirs environnementaux probables et les niches de Candida auriset l’amélioration de la compréhension de son émergence dans le scénario de pollution de l’environnement et de changement climatique, est essentielle pour développer des options de gestion et des réponses épidémiologiques efficaces.
La capacité à résister aux agents antifongiques et à persister dans des conditions nosocomiales (associée à un mauvais pronostic) a facilité la forte augmentation de Candida auris infections dans le monde à partir de 2014.
Les Centers for Disease Prevention and Control (CDC) et le CDC européen (ECDC) ont annoncé C. auris comme une menace pour la santé publique, nécessitant une action urgente. De même, l’Organisation mondiale de la santé (OMS) a déclaré C. auris être un champignon pathogène extrêmement préoccupant.
À propos de l’examen
Dans la présente revue, les chercheurs ont déterminé les interactions environnementales probables de Candida auris et exploré les voies et les caractéristiques environnementales facilitant l’exposition des humains à l’organisme.
Voies possibles d’introduction de Candida auris dans l’environnement
Les environnements naturels pourraient contribuer de manière significative à l’épidémiologie des maladies infectieuses puisque les organismes pathogènes persistent et évoluent dans des niches environnementales naturelles, puis se transfèrent vers de nouveaux hôtes. Par conséquent, l’étude des interactions des microbes pathogènes avec des réservoirs environnementaux potentiels est essentielle pour contrôler les maladies infectieuses.
C. auris les souches peuvent s’adapter à l’augmentation des températures (≤ 42,0 ˚C) et se transférer via des oiseaux colonisés ou une excrétion naturelle dans l’environnement via des individus infectés et des travailleurs de la santé.
De plus, compte tenu de la résistance intrinsèque du microbe aux antifongiques comme le fluconazole, C. aurisainsi que les médicaments antimycosiques, peuvent pénétrer dans les systèmes d’égouts par le rejet de déchets cliniques, et les effluents d’eaux usées contaminés peuvent ensuite être rejetés dans l’environnement naturel.
C. auris peut acquérir des attributs de virulence via la survie dans des environnements avec un pH compris entre 4,0 et 13,0, des sols hautement minéralisés, résistant aux stress cationiques et s’adaptant aux fongicides dans le sol. Par conséquent, les sources d’enrichissement comprennent les effluents pharmaceutiques et agricoles de faible niveau dans le ruissellement, les fongicides agricoles, les médicaments antifongiques et les conditions à forte teneur en sel (≤ 10,0 % de NaCl).
Plus loin, Candida auris la détection dans les piscines de type intérieur indique que les individus colonisés peuvent excréter l’agent pathogène dans des environnements non cliniques.
Candida auris persiste sur la peau, les narines et les cavités tympaniques des humains colonisés et a été identifié dans des échantillons de matières fécales et d’urine humaines et des prélèvements rectaux. Par conséquent, la défécation ouvertement pratiquée, observée dans les zones rurales des pays en développement, pourrait contribuer de manière significative à C. auris chargement dans l’environnement.
Les propriétés halophiles de Candida auris peut faciliter sa persistance dans les écosystèmes marins, soutenue par la détection d’espèces étroitement apparentées dans les zones humides côtières des îles Andaman et des estuaires en Colombie. C. auris peut également se maintenir sur des biofilms de surfaces sèches et inanimées telles que des plastiques et des fruits stockés pendant des périodes prolongées.
Orientations futures de la recherche sur Candida auris
L’écologie d’espèces étroitement apparentées et les différences génomiques interclades élevées parmi les clades de C. auris, originaires des régions du sud de l’Amérique, de l’Afrique, du sud-est de l’Asie, de l’Asie de l’Est et de l’Iran, soutiennent l’épidémiologie de C. auris.
Cependant, la persistance et la propagation dans l’environnement du microbe résistant aux médicaments thermotolérants, halotolérants et antifongiques ne sont pas complètement comprises et nécessitent des recherches supplémentaires.
Les études futures doivent viser à comprendre la prévalence environnementale et la diffusion des Candida auris et la quantification de la persistance environnementale et de la survie du champignon.
Des outils de surveillance environnementale doivent être développés pour une détection et une quantification rapides de l’agent pathogène en conjonction avec des outils de surveillance au niveau communautaire.
Il est important de noter qu’avant d’appliquer les méthodes de surveillance, il est nécessaire d’optimiser la spécificité des méthodes qui dépendent ou non de la culture pour Candida auris détection dans des échantillons avec une forte abondance d’autres espèces de Candida.
Candida auris la tolérance aux stress environnementaux, tels que la salinité, le rayonnement solaire, les températures élevées, la prédation et la concurrence, doit être étudiée en utilisant les conditions environnementales. L’influence des interactions microbiennes étroites dans un biofilm comprenant plusieurs espèces sur C. auris la pathogénicité et la persistance dans l’environnement nécessitent également une évaluation plus approfondie.
conclusion
Sur la base des résultats de l’examen, les propriétés thermotolérantes de Candida auris permettre l’adaptation aux environnements à haute température et faciliter la colonisation chez l’homme en endurant la barrière thermique, considérée comme protégeant l’homme contre la colonisation par des microbes pathogènes. Ainsi, C. auris est un agent pathogène humain unique en son genre, susceptible d’émerger en raison du changement climatique.
De plus, la libération de médicaments antimycosiques, à partir de sources agricoles et pharmaceutiques, dans l’environnement naturel est probablement responsable de l’enrichissement environnemental des bactéries résistantes. Candida auris souches.
À ce jour, aucun des animaux n’a été identifié comme Candida auris réservoirs; cependant, l’agent pathogène peut coloniser les animaux à sang chaud, les oiseaux, les animaux aquatiques et les insectes.
