Environ 5,2 % de la population mondiale est porteuse de gènes d’hémoglobine anormaux. Chaque année, 300 000 à 500 000 enfants naissent avec des hémoglobinopathies graves dans le monde, dont environ 80 % dans les pays en développement. La thalassémie est l’hémoglobinopathie héréditaire la plus courante et survient dans 4,4 naissances vivantes sur 10 000. Elle est répandue dans les zones côtières méditerranéennes, en Afrique, au Moyen-Orient, en Asie du Sud-Est et dans le sud de la Chine.
Une étude précédente indiquait que Ganzhou, la ville la plus méridionale de la province du Jiangxi, avait une prévalence de thalassémie pouvant atteindre 9,49 %. Elle présentait néanmoins des limites en termes de petite taille d’échantillon, de population non représentative et de spectre de mutation limité. Une nouvelle étude réalisée par Tong Yang, Xuemei Luo, Yanqiu Liu, Wenqian Zhang (BGI Genomics, Senior Manager Clinical Research) et al. publié le 18 août 2023 dans Génomique humaine examine la prévalence et le spectre de mutation de la thalassémie à Ganzhou, sur la base d’un projet de dépistage de la thalassémie à grande échelle impliquant 136 312 personnes.
Méthode:
Dans cette étude, les chercheurs ont analysé rétrospectivement 136 312 personnes ayant participé au « Plan de mise en œuvre pour la détection génétique gratuite de la thalassémie dans la ville de Ganzhou (2019-2022) ».
Principales conclusions:
1. Nous avons trouvé un total de 19 827 (14,545 %) porteurs de thalassémie, dont 14 298 (10,489 %) porteurs d’α-thalassémie, 4 921 (3,610 %) porteurs de β-thalassémie et 608 (0,446 %) porteurs combinés d’α- et β-thalassémie.
2. Au total, 156 génotypes distincts de thalassémie ont été identifiés, comprenant 40 génotypes d’α-thalassémie, 42 génotypes de β-thalassémie et 74 génotypes combinés d’α-/β-thalassémie. 48 mutations rares de la thalassémie ont été identifiées, telles que 5’UTR +43 à +40 (-AAAC), chinois Gγ+(Aγδβ)0, –THAI, αfusion, -50 G > A et Hb Phnom Penh.
3. La prévalence de la thalassémie était plus élevée dans la province du sud-est du Jiangxi, à la jonction des provinces du Fujian, du Guangdong et du Jiangxi. En particulier, Dingnan et Xunwu avaient une prévalence élevée de 18,3 % et 17,7 %, respectivement.
4. Les techniques de séquençage de nouvelle génération (NGS) sont plus efficaces que les méthodes conventionnelles de dépistage génétique de la thalassémie, en particulier pour identifier les mutations nouvelles ou rares de la thalassémie. Limité par la faible sensibilité de l’analyse hématologique et les inconvénients de la réaction en chaîne par polymérase (PCR), un grand nombre de variations nouvelles ou rares de la thalassémie seraient manquées ou mal diagnostiquées à l’aide des méthodes de dépistage traditionnelles. NGS est également un outil rentable pour le dépistage prénatal.
Cette étude a utilisé le dépistage de la thalassémie à grande échelle via NGS pour découvrir la prévalence et le spectre de mutation de la thalassémie à Ganzhou, démontrant que la thalassémie est un problème de santé publique grave dans cette région. Les résultats seront très importants pour la prévention et le contrôle de la thalassémie à Ganzhou et dans d’autres zones à forte prévalence. Plus important encore, l’identification de variations rares et nouvelles a mis en évidence la nécessité et l’importance du choix du NGS pour le dépistage de la thalassémie dans de grandes populations.
Cette étude a été approuvée par le comité d’éthique du premier hôpital affilié de l’université médicale de Gannan.
