Les scientifiques ont créé la première carte détaillée montrant comment tous les changements génétiques possibles peuvent affecter la santé du gène. DDX3Xconduisant à des informations précieuses sur les mécanismes sous-jacents des troubles neurodéveloppementaux et du cancer.
La nouvelle technique surpasse ses rivales qui s’appuient uniquement sur l’IA, révélant l’importance de 90 % de l’impact de modifications génétiques jusqu’alors inexpliquées sur la santé. Il promet d’accélérer le diagnostic et d’ouvrir de nouvelles voies de traitement.
Exploitant les technologies de pointe d’édition génétique, des chercheurs du Wellcome Sanger Institute et leurs collaborateurs de l’Université de Cambridge ont concentré leur attention sur le DDX3X gène, pour évaluer directement l’impact de plus de 12 000 changements génétiques. Un quart de ces altérations ont été identifiées comme empêchant la protéine DDX3X de fonctionner correctement.
Les résultats, publiés aujourd’hui (6 décembre) dans Communications naturelles, sont mis gratuitement à la disposition des médecins afin qu’ils puissent être immédiatement utilisés pour faciliter le diagnostic des patients. Cela facilitera le diagnostic de DDX3X-troubles du développement neurologique liés et peuvent stimuler le développement de nouveaux traitements.
Les chercheurs appliquent cette technique à grande échelle à de nombreux autres gènes pertinents pour les troubles du développement neurologique et le cancer, en collaboration avec des scientifiques du monde entier pour former l’Atlas of Variant Effect Alliance en vue de découvertes futures.
Depuis 2015, le DDX3X Le gène a été associé à un trouble neurodéveloppemental spécifique, affectant principalement les filles et les femmes. DDX3X-les troubles neurodéveloppementaux liés sont généralement associés à une déficience intellectuelle, à des retards de développement et comprennent souvent des caractéristiques telles que des convulsions. Des modifications génétiques du gène ont également été précédemment associées à certaines formes de cancer, mais il n’était pas clair si cela provoquait trop ou pas assez d’activité de la protéine DDX3X.
Le diagnostic des troubles du développement est très difficile, en particulier chez les jeunes enfants dont les symptômes peuvent encore se développer. Les familles ont souvent de nombreux rendez-vous médicaux et subissent de nombreux tests avant de recevoir un diagnostic spécifique. Leur détection précoce grâce au dépistage génétique peut grandement améliorer l’efficacité du traitement et améliorer la qualité de vie des personnes touchées.3 mais jusqu’à présent, la compréhension des changements génétiques nocifs à surveiller était limitée.
Dans cette nouvelle étude, les scientifiques basés à Cambridge ont entrepris de découvrir l’impact de tous les changements génétiques possibles au sein de l’organisme. DDX3X gène sur la fonction et la santé des protéines, y compris les troubles du développement neurologique et le cancer.
Contrairement aux outils prédictifs informatiques, l’équipe a directement testé des milliers de ces changements génétiques en modifiant artificiellement le code génétique de cellules humaines cultivées dans une boîte, dans le cadre d’un processus connu sous le nom de « modification du génome par saturation ». Pour comprendre les effets de ces altérations génétiques, ils ont comparé les données expérimentales avec les données de santé de la cohorte UK Biobank et des bases de données sur les changements génétiques observés chez les personnes atteintes de troubles du développement neurologique et de cancer.
Ils ont identifié que 3 432 des 12 776 changements génétiques différents empêchaient la protéine de fonctionner correctement. Pour la plupart de ces modifications génétiques, les médecins ne pouvaient auparavant pas prédire si elles affectaient la santé. Grâce à cette technique, l’équipe a pu découvrir l’importance de jusqu’à 93 pour cent des changements génétiques dont l’impact sur la santé était auparavant inconnu. Ils ont pu atteindre une précision de 99 pour cent en localisant le DDX3X changements génétiques liés aux troubles neurodéveloppementaux.
Les changements génétiques dans DDX3X On sait également que cela se produit dans le cancer. Cependant, on ne savait pas si ces changements génétiques provoquaient trop ou pas assez d’activité de la protéine DDX3X. L’étude actuelle a pu démontrer que les modifications génétiques observées dans le cancer empêchent la protéine DDX3X de fonctionner correctement, une information importante qui facilitera le développement de nouveaux traitements contre le cancer ciblant ce gène.
Le Dr Sebastian Gerety, auteur de l’étude au Wellcome Sanger Institute et à l’Université de Cambridge, a déclaré : « Nous pouvons actuellement lire les lettres du code génétique – A, C, T et G – mais souvent nous ne comprenons pas ce qu’elles signifient. Même des changements apparemment mineurs peuvent avoir un impact profond sur le développement d’un enfant atteint de maladies génétiques. Notre approche, qui va au-delà du calcul pour évaluer l’effet des mutations, nous permet de différencier de manière fiable les modifications génétiques rares inoffensives et nocives. Dans le cadre de l’Atlas of Variant Effects Alliance, nous continuerons à découvrir des informations essentielles cachées dans notre code génétique.
DDX3X est altérée dans de nombreux cancers et en particulier dans les cancers du cerveau infantiles. Comprendre exactement quelles mutations sont à l’origine de la maladie facilite le diagnostic et peut aider à garantir que les patients reçoivent le traitement le plus adapté à leur maladie.
Dr David Adams, auteur de l’étude et chef de groupe principal, Wellcome Sanger Institute
Le Dr Elizabeth Radford, auteur de l’étude au Wellcome Sanger Institute et maître de conférences en neurologie pédiatrique à l’Université de Cambridge, a déclaré : « Les tests génétiques sont de plus en plus intégrés aux soins des patients, mais notre capacité à décoder l’information génétique n’a pas suivi le rythme. , empêchant les familles de recevoir tout le soutien dont elles ont besoin. Ces informations disponibles gratuitement permettront aux médecins d’interpréter les tests génétiques et de diagnostiquer les enfants plus tôt, permettant ainsi une intervention rapide et une meilleure qualité de vie pour les personnes touchées par la maladie. DDX3X-troubles du développement neurologique liés.
Clare Millington, mère de trois enfants, a découvert que ses plus jeunes jumeaux, Pip et Alix, avaient reçu un diagnostic de DDX3X-à l’âge de 15 ans en 2015. Inspirée par le besoin de soutien, Clare a rejoint d’autres parents d’enfants atteints de DDX3X– trouble lié au Royaume-Uni pour créer un groupe de soutien, DDX3X Support UK, fournissant une ressource vitale pour les patients et les familles touchés par le DDX3X mutations.
Clare a déclaré : « « Pour beaucoup de nos familles, il a fallu plusieurs années avant de recevoir un diagnostic, ce qui a provoqué beaucoup d’incertitude. Nous sommes enthousiasmés par cette étude qui, nous l’espérons, accélérera le diagnostic de DDX3X-troubles neurodéveloppementaux liés, et stimuler la poursuite des recherches pour améliorer les soins prodigués aux personnes atteintes de cette maladie.
