Association entre la charge virale SARS-CoV-2 Omicron et les antécédents de vaccination

Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de prétirage, les chercheurs ont analysé l’association entre les charges virales dans le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SARS-CoV-2) variante d’infection à Omicron et les antécédents de vaccination.

Diverses études ont signalé le nombre croissant de cas décisifs d’infection par le SRAS-CoV-2 Omicron. Par conséquent, il est essentiel de comprendre la charge virale présente après les percées d’infection pour déterminer les mesures appropriées pour contrôler la transmission et développer des mesures de santé publique.

À propos de l’étude

La présente étude a évalué la corrélation entre les charges virales détectées dans les infections des sous-lignées SARS-CoV-2 Omicron BA.1 et BA.2 et le statut vaccinal.

L’équipe a effectué des tests de détection du SRAS-CoV-2 sur des échantillons obtenus entre le 10 janvier et le 7 avril 2022. Les plates-formes de diagnostic utilisées dans la présente étude comprenaient la réaction en chaîne de transcription inverse par polymérase (RT-PCR) de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), le test FilmArray panel respiratoire 79 2.1, le test Xpert Xpress SARS-CoV-2 et le test antigène Lumipulse. Ces tests ont été effectués sur des écouvillons nasopharyngés prélevés sur des patients infectés.

Une RT-PCR quantitative en une étape (RT-qPCR) a été réalisée pour détecter la présence de SARS-CoV-2 afin d’amplifier les niveaux du gène de la nucléocapside (N) du SARS-CoV-2. L’équipe a utilisé le gène p30 (RPP30) de la sous-unité de la protéine ribonucléase P humaine comme contrôle positif interne.

Le séquençage du génome entier (WGS) a été réalisé par transcription inverse de l’acide ribonucléique (ARN) génomique du SRAS-CoV-2 en ADN complémentaire (ADNc), qui a ensuite été amplifié. De plus, le test TaqMan a été effectué pour détecter les protéines de pointe du SRAS-CoV-2 dans les échantillons positifs au SRAS-CoV-2.

Résultats

Les résultats de l’étude ont montré que 611 patients ont été testés positifs au SRAS-CoV-2 du 10 janvier au 7 avril 2022. Parmi les participants éligibles, 199 n’étaient pas vaccinés, 370 ont reçu deux doses de vaccin et 42 en ont reçu trois. L’âge médian des groupes non vaccinés à deux doses et à trois doses était de 14, 44 et 48 ans, respectivement. Notamment, le statut vaccinal était cohérent avec l’âge des vaccinés car les personnes plus âgées étaient préférées pour l’administration de la troisième dose.

Le WGS ou le test TaqMan ont montré que parmi le nombre total de participants, 453 étaient infectés par le SARS-CoV-2 Omicron BA.1.1 tandis que 158 avaient BA.2. Parmi ceux qui avaient reçu leur troisième dose, 15,2% avaient BA.2 alors que seulement 4% avaient une infection BA.1.1. Dans l’ensemble, cela indiquait que BA.2 pouvait provoquer des infections percées plus souvent que BA.1.1 chez les individus boostés.

La RT-qPCR a montré que les charges virales moyennes ± écart-type (ET) chez les personnes infectées par BA.1.1 et BA.2 étaient de 5,3 ± 1,4 et 5,4 ± 1,6 chez les personnes non vaccinées, 5,4 ± 1,5 et 5,8 ± 1,5 chez les personnes infectées par le BA.1.1 et le BA.2. et 4,6 ± 1,7 et 5,5 ± 1,7 dans le groupe à trois doses, respectivement. De plus, les seuils de cycle moyens (Ct) ± SD chez les individus infectés par BA.1.1 et BA.2 étaient de 20,5 ± 5,1 et 19,9 ± 5,6 dans le groupe non vacciné, 20,2 ± 5,1 et 18,4 ± 5,0 dans le groupe à deux doses, et 22,5 ± 5,7 et 19,9 ± 6,0 dans le groupe à trois doses, respectivement. Notamment, aucune différence substantielle n’a été trouvée dans la charge virale ou les niveaux de Ct chez les personnes infectées ayant des antécédents de vaccination différents.

De plus, l’équipe a évalué la corrélation entre la charge virale et l’âge. Pour les individus infectés par les variants BA.1.1 et BA.2, les coefficients de corrélation entre la charge virale et l’âge étaient de -0,023 et 0,129 pour les non vaccinés, de -0,055 et -0,084 pour le groupe à deux doses et de -0,189 et 0,189 pour les groupe de trois doses, respectivement.

De plus, les coefficients de corrélation entre la valeur Ct et l’âge pour les individus infectés par BA.1.1 et BA.2 étaient de 0,017 et -0,122 pour les non vaccinés, de 0,058 et 0,095 pour le groupe à deux doses et de 0,195 et -0,159 pour le groupe à trois doses. groupe, respectivement. Cela indiquait qu’il n’y avait pas de corrélation significative entre la charge virale et l’âge, quels que soient les antécédents de vaccination.

Conclusion

Les résultats de l’étude ont montré que les personnes infectées par le SRAS-CoV-2 Omicron pouvaient produire et transmettre le virus infectieux même après avoir reçu la dose de rappel du vaccin. Les chercheurs pensent que l’isolement des patients diagnostiqués avec une infection percée pourrait contribuer de manière significative à freiner la propagation du COVID-19.

*Avis important

medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.