Une équipe de scientifiques allemands a récemment mené un dépistage sérologique sur des animaux sauvages pour évaluer la séroprévalence contre le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) et d’autres virus pathogènes liés aux ruminants domestiques. Les résultats révèlent que les animaux sauvages ne sont pas sensibles à l’infection par le SRAS-CoV-2. Une séropositivité élevée n’a été observée que contre le virus de Schmallenberg. L’étude est actuellement disponible sur le bioRxiv* serveur de préimpression en attendant l’examen par les pairs.
Étude : Dépistage sérologique chez les ruminants sauvages en Allemagne, 2021/22 : Aucune preuve de propagation du SRAS-CoV-2, du virus de la fièvre catarrhale du mouton ou du pestivirus, mais des séroprévalences élevées contre le virus de Schmallenberg. Crédit d’image : WildMedia/Shutterstock
De nombreux agents pathogènes infectieux pertinents pour la santé publique peuvent infecter les animaux sauvages, les transformant en réservoirs d’une pléthore de virus et de bactéries. En conséquence, ces animaux présentent un risque constant de transmission zoonotique d’agents pathogènes à l’homme.
En Europe centrale, la majorité des ruminants sauvages sont sensibles à deux virus transmis par des insectes, à savoir le virus de la fièvre catarrhale du mouton et le virus de Schmallenberg. Alors que l’infection par le virus de Schmallenberg est connue pour provoquer de la fièvre, de la diarrhée, une réduction de la production de lait et des anomalies de la reproduction chez les ruminants domestiques, le virus de la fièvre catarrhale du mouton provoque principalement des infections subcliniques. Cependant, les lésions vasculaires dues à l’infection par le virus de la fièvre catarrhale du mouton peuvent induire une fièvre hémorragique systémique, qui a un taux de mortalité élevé.
Outre les virus transmis par les insectes, de nombreux agents pathogènes peuvent infecter les animaux sauvages et domestiques par contact direct. Ces agents pathogènes comprennent le virus de la diarrhée virale bovine et le virus de la maladie des frontières.
Dans la pandémie actuelle de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), de nombreux cas d’infection naturelle par le SRAS-CoV-2 chez le vison d’Amérique, les furets, les félins, les canidés et les primates provenant d’une exposition humaine ont été identifiés. L’infection par le SRAS-CoV-2 chez le cerf de Virginie a également été détectée en Amérique du Nord. Cela fait craindre que ces animaux puissent potentiellement agir comme des réservoirs capables de réintroduire le virus chez l’homme.
Dans l’étude actuelle, les scientifiques ont étudié la séroprévalence contre l’infection par le SRAS-CoV-2 chez les ruminants sauvages européens. En outre, ils ont évalué la séropositivité contre quatre virus d’intérêt vétérinaire, notamment le virus de la fièvre catarrhale du mouton, le virus de Schmallenberg, le virus de la diarrhée virale bovine et le virus de la maladie des frontières.
Sommaire
Étudier le design
Un total de 493 échantillons prélevés sur des ruminants sauvages en 2021-2022 en Allemagne ont été inclus pour l’analyse sérologique. Les animaux de l’étude comprenaient des daims, des cerfs rouges, des chevreuils, des mouflons et des bisons (bisons d’Europe). Pour l’analyse de la séropositivité du SARS-CoV-2, 307 échantillons supplémentaires collectés entre 2017 et 2020 ont été inclus.
Proportion d’échantillons de ruminants sauvages testés positifs (rouge) pour les anticorps dirigés contre les virus transmis par les culicoïdes, le virus de Schmallenberg (à gauche) et le virus de la fièvre catarrhale du mouton (à droite). BY – Bavière, HE – Hesse, MV – Mecklembourg-Poméranie occidentale, NW – Rhénanie du Nord-Westphalie, RP – Rhénanie-Palatinat
Sérologie des virus vétérinaires
Environ 13% des échantillons collectés entre septembre 2021 et janvier 2022 ont montré une séropositivité contre le virus de Schmallenberg. À l’exception du wisent, des animaux individuels de toutes les espèces étudiées ont été affectés par le virus de Schmallenberg.
En revanche, tous les échantillons sauf un ont montré une séronégativité contre le virus de la fièvre catarrhale du mouton. Le seul échantillon testé positif au virus de la fièvre catarrhale du mouton a été prélevé sur un daim d’âge inconnu. En ce qui concerne le virus de la diarrhée virale bovine et le virus de la maladie des frontières, tous les échantillons ont montré une séronégativité.
Sérologie des coronavirus
Environ 5 % des échantillons prélevés en 2021-2022 ont été testés positifs pour les anticorps anti-SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (RBD). Pour confirmer davantage la séropositivité des échantillons, un test de neutralisation du virus a été effectué en utilisant la réplication du SARS-CoV-2. Dans ce test de confirmation, aucun des échantillons n’a montré de séropositivité contre le SARS-CoV-2.
L’analyse des échantillons prélevés avant et pendant la pandémie de COVID-19 a révélé qu’environ 6,5 % des échantillons contenaient des anticorps contre le SARS-CoV-2 spike RBD. Cependant, la séropositivité de ces échantillons n’a pas pu être confirmée par un test de neutralisation du virus.
Une analyse plus approfondie des échantillons séropositifs pour le SRAS-CoV-2 prélevés avant et pendant la pandémie a révélé qu’environ 90 % des échantillons avaient des anticorps contre le pic RBD du SRAS-CoV-1, l’agent pathogène responsable de l’épidémie de SRAS de 2002-2004. Le SARS-CoV-1 et le SARS-CoV-2 appartiennent tous deux au sous-genre Sarbecovirus des bêta-coronavirus.
Dans l’ensemble, ces résultats mettent en évidence la présence d’au moins un coronavirus jusque-là inconnu dans la population d’animaux sauvages qui est étroitement lié aux virus du sous-genre Sarbecovirus. Les anticorps développés contre ce coronavirus inconnu ont montré une réactivité croisée contre le SARS-CoV-1 et le SARS-CoV-2.
Importance de l’étude
Le dépistage sérologique effectué dans le cadre de l’étude révèle que les ruminants sauvages en Allemagne ne sont pas sensibles à l’infection par le SRAS-CoV-2. Cependant, ces animaux ont montré une séroprévalence élevée contre le virus de Schmallenberg.
La séropositivité contre le SRAS-CoV-2 observée chez certains animaux pourrait être due à un autre coronavirus jusqu’alors inconnu appartenant au sous-genre Sarbecovirus des bêta-coronavirus.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.[if–>