Cancer colorectal et tests ADN fécaux non invasifs

Dans cette interview, NewsMedical s’entretient avec le Dr Yuying Wang, directeur de la technologie en oncologie de BGI Genomics, sur le cancer colorectal et le développement et l’application de COLOTECT^MT 1.0, un test ADN fécal non invasif pour la détection du cancer colorectal et des lésions précancéreuses.

1. Quels sont les facteurs de risque du cancer colorectal et comment les changements de style de vie ont-ils contribué à l’augmentation des taux d’incidence et de mortalité ?

Le cancer colorectal est un contributeur majeur aux décès liés au cancer dans le monde. Selon GLOBOCAN 2020, il se classe troisième en incidence (1 931 590 cas) et deuxième en mortalité (935 173 cas) suite au cancer du poumon.¹ Les taux d’incidence et de mortalité du cancer colorectal augmentent depuis plusieurs décennies.

La plupart des facteurs de risque associés au cancer colorectal sont liés au mode de vie et à l’âge, tels que la consommation d’alcool et de tabac, le manque d’exercice physique, une alimentation pauvre en fibres et le vieillissement. D’autres facteurs de risque comprennent des antécédents familiaux de cancer du côlon et des antécédents personnels d’affections intestinales inflammatoires.

La croissance économique mondiale a entraîné de profonds changements dans les modes de vie et l’allongement de la durée de vie, ce qui a contribué à l’augmentation des taux d’incidence et de mortalité du cancer colorectal.

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Crédit d’image : Génomique BGI

2. Quelle est la tendance actuelle de l’incidence du cancer colorectal selon l’âge?

L’âge est un facteur important dans l’augmentation de l’incidence du cancer colorectal. Des études et des publications ont démontré une tendance croissante de l’incidence du cancer colorectal avec l’âge. L’incidence du cancer colorectal augmente généralement fortement après 50 ans,² et une tendance à la hausse est observée chez les personnes âgées de 40 à 44 ans, ce qui montre que l’incidence du cancer colorectal précoce augmente à un rythme alarmant.³

Alors que la plupart des directives européennes recommandent que la population à risque moyen commence le dépistage du cancer colorectal à 50 ans, il existe désormais des directives cliniques, telles que l’American Cancer Society Colorectal Cancer Screening Guideline (2018), recommandant le dépistage du cancer colorectal à 45 ans au lieu de 50 ans. vieux, en raison de l’augmentation inquiétante de l’incidence du cancer colorectal chez les jeunes.

3. Pourquoi la détection précoce du cancer colorectal est-elle cruciale pour améliorer le taux de survie ?

La progression du développement du cancer colorectal a tendance à être très lente. Cela peut prendre jusqu’à 10 à 15 ans pour passer d’un épithélium normal à une hyperplasie, à des polypes adénomateux et subir une transformation maligne pour devenir un cancer colorectal.

Cette période fenêtre prolongée offre une opportunité favorable pour une détection et une intervention précoces, permettant de détecter la maladie avant qu’elle ne devienne maligne ou qu’elle ne progresse vers des stades ultérieurs. La détection précoce du cancer colorectal, comme au stade I ou II, permet une plus grande chance de guérir la maladie ou de trouver de meilleures options de traitement pour le patient.

Une étude de cohorte indique que l’élimination des polypes adénomateux du côlon et du rectum peut réduire l’incidence des cas de cancer colorectal de 76 à 90 %.⁴ Les statistiques du programme SEER de l’Institut national du cancer montrent également que le taux de survie à cinq ans du cancer colorectal à un stade précoce (stade I-II) peut atteindre 90,6 %.⁵ En revanche, le taux de survie à cinq ans chute de manière significative à 14,7% lorsqu’il est diagnostiqué au stade IV.⁵

Crédit d’image : Génomique BGI

4. Quelles sont les limites possibles de la coloscopie ? Comment le test ADN fécal peut-il être utilisé comme alternative pour la détection précoce du cancer colorectal ?

Bien que la coloscopie demeure l’outil de référence pour le dépistage du cancer colorectal, il existe plusieurs limites à son utilisation dans la population générale.

La coloscopie peut être assez coûteuse dans certaines régions du monde, et la procédure est invasive, entraînant souvent une adhérence moindre en raison du processus de préparation relativement long et compliqué. De plus, des complications liées à l’anesthésie peuvent survenir.

Le test d’ADN fécal est une stratégie non invasive qui peut être utilisée comme une option alternative pour détecter les lésions précancéreuses du cancer colorectal.

Le principe de ce test est que l’épithélium colique normal et les néoplasmes colorectaux libèrent des cellules dans la lumière intestinale par renouvellement cellulaire normal et apoptose. Ces cellules se déplaceront le long de l’intestin avec les matières fécales et peuvent être collectées avec les selles. L’ADN fécal peut ensuite être extrait pour détecter des signaux génomiques anormaux.

La méthylation de l’ADN est un type idéal de biomarqueur pour la détection du cancer. Il s’agit d’une forme importante de modification épigénétique qui est étroitement associée à la progression du cancer et peut provoquer une expression génique aberrante. La méthylation anormale de l’ADN est un événement précoce qui se produit au cours de la carcinogenèse, ce qui en fait un biomarqueur prometteur pour la détection précoce des tumeurs malignes.

Crédit d’image : Génomique BGI

5. Pouvez-vous expliquer le processus de développement du test ADN fécal de BGI, COLOTECT^MT 1.0 ?

COLOTEC^MT 1.0 est un test d’ADN fécal non invasif qui utilise la technologie PCR spécifique à la méthylation multiplex pour tracer des biomarqueurs anormaux de méthylation de l’ADN dans le cancer colorectal à partir d’échantillons fécaux.

Le développement de COLOTECT^MT 1.0 impliquait le séquençage au bisulfite du génome entier (WGBS) des tissus tumoraux du cancer colorectal et des tissus normaux appariés pour identifier et découvrir des marqueurs génétiques spécifiques à la méthylation associés au cancer colorectal.

Nous avons examiné les marqueurs potentiels en interrogeant des bases de données génomiques publiques, telles que la base de données The Cancer Genome Atlas (TCGA). Après cela, des gènes candidats spécifiques ont été identifiés et des paires d’amorces et de sondes ont été conçues pour formuler des tests de PCR quantitative (qPCR).

Ces marqueurs ont ensuite été validés à l’aide d’échantillons fécaux cliniques prélevés sur des patients et des sujets témoins sains. Un panel de trois biomarqueurs, SDC2, ADHFE1et PPP2R5C, ont finalement été sélectionnés pour formuler le COLOTECT^MT 1.0 dosage.

6. Quelle est la performance de COLOTECT^MT 1.0 pour détecter le cancer colorectal et l’adénome avancé ?

Validation clinique du COLOTEC^MT 1.0 a été effectué pour déterminer ses mesures de performance dans la détection du cancer colorectal ou des lésions précancéreuses.

Globalement, sa sensibilité pour détecter les cancers colorectaux est de 88 % et sa spécificité pour identifier les sujets sans tumeur colorectale avancée est de 92 %.⁶ De plus, COLOTECT^MT 1.0 a un taux de sensibilité de 46% pour détecter les cas d’adénome avancé.⁶

Les performances de COLOTECT^MT 1.0 a également été comparé à un test immunochimique fécal (FIT), qui détecte le sang occulte fécal au lieu de la méthylation de l’ADN. COLOTEC^MT 1.0 présente une meilleure sensibilité pour détecter à la fois le cancer colorectal et l’adénome avancé.

Cela démontre qu’un panel de marqueurs de méthylation multi-gènes peut surpasser le FIT, offrant de meilleures opportunités pour détecter le cancer colorectal précoce et les cas d’adénome avancé.

Crédit d’image : Génomique BGI

7. Pouvez-vous partager l’expérience de BGI avec COLOTECT^MT 1.0 pour mener un programme pilote de dépistage de la population à grande échelle ?

BGI a mené plusieurs études pilotes prospectives à grande échelle à travers la Chine pour tester l’efficacité de l’utilisation de COLOTECT^MT 1,0 pour le dépistage dans la population générale.

Une de ces études pilotes a été menée dans la province du Shandong, dans l’est de la Chine, qui a recruté plus de 18 000 participants de la population moyenne entre les années 2020 et 2021. Les participants, âgés de 40 à 74 ans, ont auto-échantillonné leurs échantillons de selles, et le COLOTECT^MT 1,0 test a été effectué.

Les résultats ont montré que près de 6 % des participants étaient positifs et que près de 500 d’entre eux ont subi une coloscopie, ce qui a entraîné un taux d’adhésion de 47 %, ce qui est remarquable compte tenu du faible taux d’adhésion à la coloscopie dans la population générale. Parmi ceux qui ont subi une coloscopie, plus de 300 cas anormaux ont été détectés.​​​​​

Dr Yuying Wang

Le Dr Yuying Wang est directeur de la technologie en oncologie chez BGI Genomics. Le Dr Wang est titulaire d’un doctorat. en biologie cellulaire de l’Université de l’Illinois à Urbana-Champaign et a effectué des recherches postdoctorales à la faculté de médecine de l’Université du Colorado.

Le Dr Wang est engagé et dévoué à la recherche en biologie cellulaire et en génomique du cancer, et possède une vaste expérience dans les domaines des marqueurs tumoraux, de la technologie de diagnostic et de dépistage du cancer, du séquençage à haut débit et de la biopsie liquide.

À propos de BGI Genomics

BGI Genomics est le premier fournisseur mondial de solutions intégrées de médecine de précision, desservant désormais des clients dans plus de 100 pays.

Ils fournissent aux établissements universitaires, aux sociétés pharmaceutiques, aux prestataires de soins de santé et à d’autres organisations un séquençage génomique intégré, des services protéomiques, des tests cliniques et des solutions dans un large éventail d’applications.

Ils ont plus de 20 ans d’expérience en génomique pour aider les clients et les partenaires à atteindre leurs objectifs en fournissant des résultats rapides et de haute qualité à l’aide d’un large éventail de technologies de pointe rentables, y compris leur propre technologie de séquençage innovante DNBSEQ™.

Les références

1. Centre international de recherche sur le cancer (2020). GLOBOCAN 2020 : nouvelles données mondiales sur le cancer, https://www.uicc.org/news/globocan-2020-new-global-cancer-data#:~:text=What%20is%20GLOBOCAN%3F,for%20all%20cancer %20sites%20combinés, consultés en janvier 2023
2. Thrumurthy SG, Thrumurthy SS, Gilbert CE, Ross P, Haji A. Adénocarcinome colorectal : risques, prévention et diagnostic. BMJ. 2016;354:i3590. Publié le 14 juillet 2016. doi:10.1136/bmj.i3590
3. Patel SG, Karlitz JJ, Yen T, Lieu CH, Boland CR. La marée montante du cancer colorectal d’apparition précoce : un examen complet de l’épidémiologie, des caractéristiques cliniques, de la biologie, des facteurs de risque, de la prévention et de la détection précoce. Lancet Gastroenterol Hepatol. 2022;7(3):262-274. doi:10.1016/S2468-1253(21)00426-X
4. Winawer SJ, Zauber AG, Ho MN, et al. Prévention du cancer colorectal par polypectomie coloscopique. Le groupe de travail national d’étude de polype. N Engl J Méd. 1993;329(27):1977-1981. doi:10.1056/NEJM199312303292701
5. Institut national du cancer (2000). SEER 18 2011-2017, Toutes les races, les deux sexes, https://seer.cancer.gov/statfacts/html/colorect.html, consulté en janvier 2023

6. Fang, Y., Peng, J., Li, Z., Jiang, R., Lin, Y., Shi, Y., . . . Lu, Z. (2022). Identification de biomarqueurs multi-omiques à partir d’ADN fécal pour une meilleure détection du cancer colorectal et des lésions précancéreuses. Manuscrit non publié

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