Une nouvelle variante préoccupante du coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère (COV), Omicron (B.1.1.529), a été identifiée en Afrique du Sud le 24 novembre 2021, qui était responsable de la quatrième vague de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). La variante Omicron présentait le plus grand nombre de mutations de la protéine de pointe que les variantes préoccupantes précédentes (COV), ce qui rend la transmissibilité et la capacité d’échapper aux vaccins considérablement élevées.
Étude : Caractéristiques et résultats des patients hospitalisés en Afrique du Sud pendant la vague COVID-19 Omicron par rapport aux vagues précédentes. Crédit d’image : 3dartistav/Shutterstock
L’Afrique du Sud avait déjà connu trois vagues COVID-19, de juin à août 2020 causées par la variante originale du SRAS-CoV-2, de novembre 2020 à janvier 2021 causées par la variante bêta et de mai à septembre 2021 causées par la variante Delta. Cependant, les cas ont commencé à augmenter à partir du 15 novembre 2021, en raison de l’émergence de la variante Omicron entraînant la quatrième vague.
Une nouvelle lettre de recherche publiée dans Réseau JAMA ont évalué les patients hospitalisés avec un test SARS-CoV-2 positif au cours de la quatrième vague par rapport aux vagues précédentes.
À propos de l’étude
L’étude impliquait l’évaluation d’un groupe de soins de santé privé connu sous le nom de Netcare qui comprenait 49 hôpitaux de soins actifs à travers l’Afrique du Sud. La politique de Netcare était de tester tous les patients admis avec COVID-19 avec une amplification en chaîne par transcriptase inverse-polymérase ou un test rapide d’antigène à l’aide d’un écouvillon nasopharyngé.
Tous les patients hospitalisés pour COVID-19 ont été inclus dans l’étude. Les données sur les caractéristiques des besoins en oxygène du patient, la ventilation mécanique, la durée du séjour à l’hôpital, l’admission aux soins intensifs, les taux de mortalité ont été obtenues. Le suivi a été effectué jusqu’au 20 décembre 2021.
Résultats de l’étude
Les résultats ont indiqué que le pourcentage de participants admis à l’hôpital au cours de la quatrième vague était de 41,3 % par rapport à 68 à 69 % au cours des trois vagues précédentes. De plus, une proportion plus élevée de patients plus jeunes et de femmes ont été hospitalisés et une proportion plus faible de problèmes respiratoires aigus au cours de la quatrième vague.
Sur l’ensemble des patients admis lors de la quatrième vague, 66,4 % n’étaient pas vaccinés, 24,2 % étaient vaccinés et le statut vaccinal était inconnu pour 9,4 %. Une proportion plus faible de patients a nécessité une oxygénothérapie et une ventilation mécanique au cours de la quatrième vague par rapport aux vagues précédentes. L’admission aux soins intensifs était de 18,5% lors de la quatrième vague contre 29,9% lors de la troisième vague.
De plus, la durée d’hospitalisation a diminué à 3 jours lors de la quatrième vague contre 7 à 8 jours lors des vagues précédentes. Le taux de mortalité se situait entre 19,7% et 29,1% au cours des première et troisième vagues, alors qu’il est tombé à 2,7% au cours de la quatrième vague.
La présente étude a démontré un modèle différent de caractéristiques chez les patients infectés par COVID-19 au cours des premiers stades de la quatrième vague en Afrique du Sud par rapport aux vagues précédentes. Cependant, des recherches supplémentaires doivent être menées pour déterminer si les différences entre les vagues étaient dues à une infection naturelle et/ou à une immunité acquise préexistante ou si Omicron était moins pathogène que les variantes précédentes.
Limites
L’étude comportait certaines limites. Premièrement, le génotypage du virus pour les patients n’était pas disponible. Deuxièmement, sept pour cent des patients étaient encore hospitalisés pendant la période de suivi. Troisièmement, des facteurs tels que les restrictions nationales et le verrouillage pourraient affecter le profil d’admission et le comportement des patients au cours des différentes vagues. Enfin, les patients admis avec COVID-19 n’ont pas pu être différenciés des patients asymptomatiques admis pour d’autres diagnostics.
