Dans une récente étude publiée sur Place de la recherche* serveur de pré-impression, une équipe de chercheurs d’Italie et des États-Unis (États-Unis) a examiné et comparé rétrospectivement la charge virale dans le syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Omicron et la précédente induite par la souche SARS-CoV-2 infection.
Rapport succinct : L’infection par le SARS-CoV-2 Omicron est associée à une charge virale nasopharyngée élevée. Crédit d’image : zstock / Shutterstock
L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a déclaré en décembre 2021 cinq variantes préoccupantes (VOC) du SRAS-CoV-2 – Alpha, Beta, Gamma, Delta et Omicron. La variante SARS-CoV-2 Omicron a été détectée pour la première fois le 24 novembre 2021 en Afrique du Sud. En raison de sa transmissibilité plus élevée, cette variante s’est propagée à un rythme rapide et est devenue la variante la plus dominante dans le monde en janvier 2022.
Des études antérieures ont suggéré qu’une transmission plus élevée de la variante SARS-CoV-2 Omicron est due au taux respiratoire d’émission plus élevé de particules virales chez les patients infectés par cette variante. Cependant, cette inférence est curieusement spéculative car il n’y a pas de comparaison directe de la charge virale entre les différentes variantes du SRAS-CoV-2.
Cette étude est menée pour fournir une différenciation directe de la charge virale dans l’échantillon nasopharyngé des patients infectés par le SRAS-CoV-2 Omicron et les anciennes variantes du SRAS-CoV-2 en Italie.
Sommaire
Étudier le design
Les sujets de la présente étude ont été testés chez des patients positifs au COVID-19 qui ont subi un test de dépistage du SRAS-CoV-2 à l’hôpital Pederzoli de Peschiera del Garda, en Italie, du 3 au 9 janvier 2021 et du 3 au 9 janvier 2022, caractérisant la forte prévalence de Variantes Alpha (> 95 %) et Omicron (> 90 %), respectivement.
La charge virale du SARS-CoV-2 a été estimée en utilisant la même procédure et la même instrumentation (SARS-CoV-2 Seegene Allplex Assay) pendant ladite durée des deux années. À l’aide de ce test de réaction en chaîne par polymérase en temps réel (RT-PCR), la charge virale cumulée de l’écouvillon nasopharyngé a été mesurée et exprimée sous la forme de la valeur du seuil de cycle (Ct) de différents gènes du SRAS-CoV-2.
Résultats
Les chercheurs ont observé un total de 47 et 118 patients positifs au SRAS-CoV-2 en janvier 2021 et janvier 2022, respectivement. En 2021, la majorité des sujets positifs au SRAS-CoV-2 étaient plus âgés (63 ans, âge médian) par rapport aux sujets en 2022 (âge médian de 42 ans). Dans le même temps, la répartition par sexe au cours des deux périodes était similaire, avec 68 % de femmes en 2021 et 58 % en 2022.
Au moment de la forte prévalence de la variante Omicron en janvier 2022, les valeurs Ct étaient significativement inférieures (valeur Ct médiane – 27,5) par rapport à la valeur Ct en janvier 2021 (valeur Ct médiane – 31,8) lorsque la variante Alpha était prédominante.
Surtout, l’équipe a noté qu’en janvier 2022, il y avait un taux deux fois plus élevé de sujets (45 sur 118) avec une charge virale nasopharyngée accrue (< 25 valeurs Ct) par rapport aux sujets de janvier 2021 (10 sur 47 ; rapport de cotes 2,28).
Conclusion
Les résultats de cette recherche ont démontré que les patients infectés par la variante SARS-CoV-2 Omicron ont libéré des aérosols qui contiennent une charge virale plus élevée par rapport aux patients infectés par d’anciennes souches SARS-CoV-2.
Cette étude fournit une raison biologique valable pour soutenir les rapports précédents sur le taux de transmission élevé de la variante SARS-CoV-2 Omicron et la prévalence accrue des symptômes liés aux infections des voies respiratoires supérieures dues à cette variante.
*Avis important
Place de la recherche publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
