Une étude récente publiée dans Alzheimer's & Dementia utilise des données transcriptomiques pour examiner les effets protecteurs du régime méditerranéen-DASH pour le retard neurodégénératif (MIND) dans la réduction du risque de démence et le ralentissement du déclin cognitif.
Étude: Le régime MIND, les altérations transcriptomiques cérébrales et la démence. Crédit photo : New Africa / Shuterstock.com
À propos de l'étude
Des données préliminaires issues d’essais cliniques randomisés suggèrent que les régimes DASH (Dietary Approaches to Stop Hypertension) et méditerranéen pourraient protéger contre le déclin cognitif. Le régime MIND a été conçu à l’origine pour mettre l’accent sur les nutriments et les aliments liés à la prévention de la démence. Des scores plus élevés au régime MIND ont été associés à un déclin cognitif plus lent et à un risque de démence plus faible.
Les auteurs de l'étude actuelle ont précédemment analysé les données de séquençage de l'acide ribonucléique (ARN) (RNA-seq) issues de tissus corticaux autopsiés du Rush Memory and Aging Project (MAP) et de la Religious Orders Study (ROS). Cette étude a révélé que l'expression de divers groupes de gènes dans le cortex préfrontal dorsolatéral (DLPFC) était associée au déclin cognitif, à la pathologie de la maladie d'Alzheimer et à la démence.
Dans la présente étude, les données cliniques et les séquences d'ARN ont été obtenues auprès de 1 204 participants des programmes ROS et MAP. L'inscription aux programmes ROS et MAP a débuté respectivement en 1994 et 1997.
Les participants à l'étude ne souffraient pas de démence au moment de leur inscription. Des évaluations cliniques ont été réalisées au début de l'étude, suivies d'évaluations annuelles jusqu'au décès.
La cognition a été mesurée à l'aide de données provenant de 17 tests dans cinq domaines cognitifs. Les résultats bruts des tests ont été standardisés et un score composite global a été généré comme la moyenne des scores standardisés.
Un neurologue a examiné les données cliniques au moment du décès afin de déterminer le diagnostic cognitif probable. Un questionnaire de fréquence alimentaire (FFQ) a été administré à partir de 2004 dans le cadre du MAP. Le score de régime MIND basé sur des mesures répétées du FFQ était très stable ; par conséquent, le score de régime MIND basé sur le premier FFQ représentait la qualité alimentaire à long terme.
Au total, 17 255 gènes annotés et contrôlés en qualité ont été inclus dans les analyses. Un modèle de régression élastique a été utilisé pour régresser le score du régime MIND sur 17 255 gènes chez 482 individus disposant de données FFQ et RNA-seq. Le modèle a sélectionné les gènes dont le profil transcriptomique pondéré était fortement corrélé au score du régime MIND.
Une analyse de régression linéaire a été utilisée pour examiner les associations entre le score du régime MIND et ses composants avec les gènes individuels. Le modèle de réseau élastique a ensuite été appliqué à un ensemble indépendant de 772 personnes avec uniquement des données RNA-seq. Les chercheurs ont également examiné les associations entre le score du profil transcriptomique et les trajectoires cognitives et le diagnostic final de déficience cognitive légère (MCI) ou de démence au décès.
Résultats de l'étude
Sur les 1 204 participants, 68 % étaient des femmes. L'âge moyen au moment de l'inscription et du décès était respectivement de 81 et 90 ans. Au total, 525 et 285 participants souffraient respectivement de démence et de MCI au moment du décès.
Le régime alimentaire a été évalué environ six ans avant le décès, date à laquelle le score moyen du régime MIND était de 7,5.
Le modèle de régression en réseau élastique a identifié 50 gènes avec des associations robustes avec le score du régime MIND, dont 27 et 23 étaient respectivement pondérés négativement et positivement dans le profil transcriptomique.
Myéloperoxydase (MPO) et le régulateur de la transcription et de la réponse immunitaire (Médecine traditionnelle chinoise (MTCI)) présentaient les associations positives les plus fortes, tandis que la protéine inhibitrice de liaison MAP3K12 1 (MBIP), bobine enroulée et domaine C2 contenant 2B (CC2D2B) et le membre 5 de la superfamille des immunoglobulines (IGSF5) présentaient les associations négatives les plus fortes avec le régime MIND. Lorsque ce modèle a été appliqué à 722 personnes ne disposant que de données RNA-seq, un score de profil transcriptomique plus élevé a été associé à un risque réduit de démence et à un déclin cognitif plus lent.
TCIM, MPO, protéine à doigt de zinc 827 (ZNF827), et C14orf132 L'expression était associée à des scores de régime MIND plus élevés, à un risque réduit de démence et à un déclin cognitif plus lent. En comparaison, le domaine de décarboxylase dépendant du pyridoxal contenant 2 (PDXDC2P), IGSF5, MBIP, et décapsulage de l'exoribonucléase ((DXO) les niveaux d'expression étaient associés à des scores de régime MIND inférieurs et à de mauvais résultats cognitifs.
Conclusions
L'étude actuelle a identifié un profil transcriptomique de 50 gènes en corrélation avec le régime MIND, qui était significativement associé à un risque plus faible de démence et à un déclin cognitif plus lent. Certaines limites de l'étude actuelle incluent l'utilisation de données d'ARN-seq en vrac provenant de DLPFC, qui incluent plusieurs types de cellules.
Bien que les proportions des types de cellules aient été estimées, avec des résultats similaires obtenus après ajustement des compositions, le rôle potentiel des facteurs de confusion dans ces résultats n'a pas pu être éliminé.
De plus, la cohorte étudiée était principalement composée d’individus blancs non hispaniques ; par conséquent, des recherches futures sur des populations diverses sont nécessaires pour corroborer ces résultats.
