Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) a provoqué une pandémie mondiale sans précédent mettant en péril la santé publique et entraînant une perte dramatique de vies humaines dans le monde entier. Par conséquent, il est crucial de comprendre quels épitopes spécifiques au SRAS-CoV-2 peuvent induire une réponse des lymphocytes T et offrir une protection à une large population pour concevoir un vaccin contre le nouveau coronavirus.
Sommaire
Protéines immunogènes non structurelles comme cibles potentielles pour un vaccin contre le SRAS-CoV-2
Dans une étude récente, des chercheurs américains ont identifié deux protéines immunogènes non structurelles – PLpro et RdRp – des régions génétiques immunodominantes ORF1ab, ORF3a et ORF9b comme cibles potentielles pour un vaccin contre le SRAS-CoV-2.
« La protéine ORF3a, connue pour la suppression de la réponse immunitaire innée, devrait également avoir un nombre élevé d’épitopes de cellules T pour une conception de vaccin efficace. »
Les chercheurs ont utilisé plusieurs propriétés cliniques différentes, notamment l’allergénicité, l’antigénicité, la sécrétion d’IFN-y et la toxicité afin de sélectionner les meilleurs épitopes pour la conception de vaccins. Cette étude est actuellement disponible sur le bioRxiv* serveur de préimpression en attendant l’examen par les pairs.
Plusieurs constructions potentielles de vaccins qui pourraient couvrir un pourcentage élevé de la population mondiale
Leur analyse des épitopes des cellules T CD8 et CD4 a montré la présence de plusieurs constructions vaccinales potentielles qui couvrent une proportion élevée de la population mondiale. Ils ont identifié huit protéines CD8 immunogènes, non allergènes, antigéniques, stables, non toxiques et induisant l’IFN-y pour nsp3, 11 pour ORF3a, 4 pour nsp12 et 3 pour ORF9b. Ces protéines sont communes à quatre variantes préoccupantes, à savoir B.1.1.7, P.1, B.1.351 et B.1.617.2, et protègent 98,12 %, 87,08 %, 96,07 % et 63,8 % de la population mondiale, respectivement.
« Nous avons identifié 5 épitopes nsp3 CD8 immunogènes, antigéniques, non allergènes, non toxiques, stables et induisant l’IFN-y avec au moins une faible affinité pour un ou plusieurs allèles du CMH de souris, 4 pour la protéine nsp12 et 6 pour la protéine ORF3a, tous courants au COV étudié.
Ils ont également identifié des épitopes de lymphocytes T spécifiques à une variante qui pourraient aider à cibler séparément chaque souche variante. Les résultats ont prédit l’affinité du CMH de souris envers les épitopes CD8 supérieurs. Ils ont révélé trois épitopes CD8 immunogènes, antigéniques, non toxiques, non allergènes, stables et induisant l’IFN-y qui se chevauchent avec 6 épitopes CD4 antigéniques, non allergènes, stables, non toxiques et induisant l’IFN-y dans les 4 variantes. de préoccupation, qui peut être utilisé dans des études précliniques.
Une étude révèle des peptides SARS-CoV-2 issus de protéines ORF et de multiples épitopes de cellules T qui peuvent aider au développement d’un vaccin SARS-CoV-2 à base de peptides
Compte tenu du manque de traitements antiviraux efficaces, il existe un besoin urgent d’un vaccin efficace contre diverses souches de SRAS-CoV-2 et parmi différents groupes ethniques à travers le monde. Cette étude met en lumière des peptides SARS-CoV-2 HLA-I et HLA-II auparavant peu clairs des protéines ORF dans le génome viral. De plus, il révèle plusieurs épitopes de cellules T qui peuvent aider au développement de vaccins à base de peptides contre le SRAS-CoV-2.
« Nous avons prédit les épitopes des cellules T CD4 et CD8 pour deux protéines non structurelles, nsp3 et nsp12, ainsi que des protéines ORF3a et ORF9b. »
Afin d’assurer l’efficacité de la construction vaccinale contre les mutations du SRAS-CoV-2 les plus courantes circulant actuellement dans le monde, les mutations de 4 lignées de variantes du SRAS-CoV-2 préoccupantes B.1.1.7, P.1, B .1.617.2 et B.1.351 ont été rassemblés et analysés par les chercheurs.
Le génome complet du SARS-CoV-2. L’extrémité 5′ est constituée d’une grande région génique ORF1ab et de ses protéines non structurelles (nsp1-16). L’extrémité 3′ compromet les protéines structurelles (nucléocapside, membrane, enveloppe, pointe) et d’autres protéines à cadre de lecture ouvert (ORF). La figurine a été créée avec BioRender.com.
Ils ont révélé 3 épitopes CD8 immunogènes, non allergènes, antigéniques, non toxiques, stables et induisant l’IFN-y qui ont une affinité pour les allèles du CMH de souris et étaient présents dans au moins un antigène non allergène, stable, non toxique et Epitope CD4 induisant l’IFN-y. Au total, ils ont la capacité d’induire une réponse immunitaire robuste et d’offrir une protection à 99,99 % de la population mondiale, ce qui suggère son efficacité en tant que construction potentielle de vaccin multi-épitopes.
Le paysage des épitopes des cellules T du SRAS-CoV-2 identifiés dans cette étude peut aider au développement du vaccin contre le SRAS-CoV-2 et aux futures recherches sur les vaccins peptidiques à base d’épitopes.
« Ces résultats suggèrent qu’un seul candidat vaccin multi-épitope devrait être efficace contre les lignées actuellement en circulation. »
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
