La capacité du pays à tester le COVID-19 s'est élargie, grâce aux travaux du Pacific Northwest National Laboratory du département américain de l'énergie, en collaboration avec l'Université de Washington.
À la demande du groupe de travail sur la chaîne d'approvisionnement COVID-19 de l'Agence fédérale de gestion des urgences, une équipe du DOE dirigée par le scientifique du PNNL Kristin Omberg a analysé des kits qui pourraient être utilisés dans le cadre d'un test de laboratoire utilisé pour détecter le virus dans un échantillon d'un personne infectée.
Dans le cadre d'un effort de recherche collaboratif entre les laboratoires PNNL et UW, l'équipe PNNL a établi les performances des kits de fabricants supplémentaires à utiliser avec le panneau de diagnostic RT-PCR en temps réel des Centers for Disease Control and Prevention 2019-nCoV pour détecter et inactiver le virus.
La Food and Drug Administration des États-Unis a répertorié deux kits supplémentaires comme options que les laboratoires peuvent envisager d'utiliser dans la lutte contre le COVID-19, augmentant ainsi l'approvisionnement en produits chimiques et en fournitures liés à une étape critique du processus de test.
Le Bureau de la science du DOE a soutenu cette recherche par le biais du National Virtual Biotechnology Laboratory, un consortium de tous les 17 laboratoires nationaux du DOE axé sur la réponse au COVID-19, avec un financement fourni par le Coronavirus CARES Act.
Cette équipe tire parti des capacités de base du DOE et des installations des utilisateurs pour relever les défis clés de la réponse à la menace COVID-19 dans des domaines tels que la modélisation et la réponse à la pandémie, la fabrication avancée pour faire face aux perturbations de la chaîne d'approvisionnement, la conception informatique de la thérapeutique médicale et la recherche sur les tests diagnostiques et développement.
«Nous sommes ravis que les laboratoires du DOE, leurs installations d'utilisateurs et leurs talents scientifiques s'associent à l'ensemble de la réponse du gouvernement au COVID-19», a déclaré Chris Fall, directeur du bureau des sciences du DOE et responsable de la réponse de l'agence au COVID-19. .
« La réponse rapide du consortium NVBL, et de PNNL en particulier, à cette demande de la FEMA fera une différence importante dans la capacité de test du COVID-19 du pays. »
Focus sur les réactifs d'extraction
Le travail de l'équipe répond à de graves pénuries de réactifs d'extraction, qui ont un impact sur le travail de nombreux laboratoires d'essai à travers le pays. Les scientifiques ont étudié la capacité des kits à extraire l'ARN du virus, un processus qui rend le virus plus facile à mesurer, et ont confirmé que les kits inactivent le virus, ce qui le rend sûr pour des tests et des analyses à grande échelle.
Une extraction correcte du virus d'un échantillon est une étape critique du processus de test, et les laboratoires ne peuvent pas tester les patients sans ces kits. En montrant que des kits supplémentaires peuvent être utilisés pour les tests COVID-19, les scientifiques ont contribué à améliorer l'accès et la disponibilité des tests de diagnostic.
L'équipe PNNL a constaté que les deux produits fonctionnent de la même manière que les kits déjà disponibles.
Une équipe de huit scientifiques du PNNL a effectué le travail dans les laboratoires du PNNL à Richland et de l'UW à Seattle. Les travaux au PNNL ont eu lieu dans un laboratoire de recherche spécialement agréé par l'État de Washington pour analyser les échantillons de COVID-19.
Les tests effectués au PNNL n'ont pas impliqué de coronavirus vivant. Au lieu de cela, les scientifiques ont testé des échantillons viraux simulés, un mélange d'ARN et de cellules humaines – une méthode utilisée par les CDC pour évaluer les performances.
Dans notre laboratoire d'essais, nous avons dû développer et suivre des procédures pour maintenir la distanciation sociale. Nous avons en fait utilisé trois laboratoires séparés, avec du ruban adhésif sur le sol pour indiquer l'espace de travail de chaque personne. «
Kristin Omberg, scientifique, Pacific Northwest National Laboratory
« Ce fut un énorme effort d'équipe pour fournir ces résultats en temps opportun. Mais nous avons parlé à de nombreux laboratoires à Washington et ailleurs qui ont du mal à répondre à la demande de tests car ils ne peuvent pas obtenir de fournitures, et nous voulions vraiment les aider. C'est incroyablement gratifiant pour notre équipe de voir ce travail avoir un impact au niveau national », a ajouté Omberg.
L'expertise des tests s'étend à d'autres biothreats
Le travail s'appuie sur la longue histoire de PNNL dans la lutte contre les biothreats, qui comprend des recherches analysant l'efficacité des tests de dépistage des virus Ebola et Zika.
Dans sa réponse au COVID-19, les scientifiques du PNNL travaillent avec des homologues du DOE, du CDC, des National Institutes of Health, du ministère de la Défense et d'autres.
PNNL et UW ont une longue histoire de collaboration, qui a abouti à un travail conjoint sur de nombreux projets de recherche et à la nomination de scientifiques avec des désignations spéciales dans les rangs de chaque institution.
PNNL et l'UW School of Medicine ont également conclu un accord de collaboration distinct pour l'utilisation des installations de l'UW et l'exploration de nouvelles opportunités créées par le partage de l'espace.
La source:
Laboratoire national DOE / Pacific Northwest
