Les chercheurs de l’Université HSE sont devenus les premiers au monde à découvrir une prédisposition génétique au COVID-19 sévère. Les résultats de l’étude ont été publiés dans la revue Frontières en immunologie.
L’immunité des lymphocytes T est l’un des principaux mécanismes utilisés par le corps humain pour lutter contre les infections virales. Le stade du développement de l’immunité cellulaire est la présentation de peptides viraux à la surface des cellules infectées. Ceci est suivi par l’activation des lymphocytes T, qui commencent à tuer les cellules infectées. La capacité à présenter avec succès des peptides viraux est largement déterminée par la génétique.
Dans les cellules humaines, les molécules d’antigène leucocytaire humain de classe I (HLA-I) sont responsables de cette présentation. L’ensemble de six de ces molécules est unique chez chaque être humain et est hérité des parents d’un individu. En termes simples, si l’ensemble d’allèles détecte bien le virus, les cellules immunitaires détecteront et détruiront rapidement les cellules infectées; si une personne a un ensemble qui est mauvais pour une telle détection, un cas plus grave de maladie est plus susceptible d’être observé.
Des chercheurs de la Faculté de biologie et de biotechnologie HSE – Maxim Shkurnikov, Stepan Nersisyan, Alexei Galatenko et Alexander Tonevitsky – avec des collègues de l’Université nationale russe de recherche médicale de Pirogov et de l’hôpital clinique de la ville de Filatov (Tatjana Jankevic, Ivan Gordeev, Valery Vechorko) ont étudié l’interconnexion entre le génotype HLA-I et la gravité du COVID-19.
En utilisant l’apprentissage automatique, ils ont construit un modèle qui fournit une évaluation intégrale de la puissance possible de la réponse immunitaire des lymphocytes T au COVID-19: si l’ensemble des allèles HLA-I permet une présentation efficace des peptides du virus SARS-CoV-2, ces personnes ont reçu un score de risque faible, tandis que les personnes ayant une capacité de présentation plus faible ont reçu des scores de risque plus élevés (de 0 à 100). Pour valider le modèle, les génotypes de plus de 100 patients qui avaient souffert de COVID-19 et de plus de 400 personnes en bonne santé (le groupe témoin) ont été analysés. Il s’est avéré que le score de risque modélisé est très efficace pour prédire la gravité du COVID-19.
En plus d’analyser la population de Moscou, les chercheurs ont utilisé leur modèle sur un échantillon de patients de Madrid, en Espagne. La haute précision de la prédiction a également été confirmée sur cet échantillon indépendant: le score de risque des patients souffrant de COVID-19 sévère était significativement plus élevé que chez les patients présentant des cas modérés et légers de la maladie.
En plus des corrélations découvertes entre le génotype et la gravité du COVID-19, l’approche suggérée permet également d’évaluer comment une certaine mutation du COVID-19 peut affecter le développement de l’immunité des lymphocytes T contre le virus. Par exemple, nous pourrons détecter des groupes de patients pour lesquels l’infection par de nouvelles souches de SRAS-CoV-2 peut conduire à des formes plus graves de la maladie. «
Alexander Tonevitsky, Faculté de biologie et biotechnologie HSE
La source:
École supérieure d’économie de l’Université nationale de recherche
