Dans une perspective récente publiée dans PLoS Biologieles chercheurs ont proposé une nouvelle classification non discriminatoire du virus du monkeypox (MPX) (MPXV).
Sommaire
Arrière plan
Plusieurs épidémies de MPXV se sont produites à travers le monde. Alors que les épidémies précédentes se produisaient principalement par transmission zoonotique du MPXV dans des régions endémiques telles que l’ouest et le centre de l’Afrique, l’épidémie actuelle de MPXV de 2022 a eu un impact sur les pays non endémiques via la transmission interhumaine du MPXV.
À propos du point de vue
Dans la présente perspective, les chercheurs ont proposé une classification nouvelle, non discriminatoire, non stigmatisante et neutre du MPXV, conformément aux meilleures pratiques de nomenclature des maladies infectieuses, afin de minimiser les impacts géographiques et économiques négatifs, compte tenu de la transmission et de l’évolution du MPXV.
Besoin d’un nouveau système de classification MPXV
Le MPXV a été perçu dans la littérature scientifique et les médias mondiaux comme endémique à l’Afrique. Presque tous les cas de MPX en Afrique avant l’épidémie de MPX de 2022 sont survenus principalement en raison d’une transmission zoonotique et rarement par transmission interhumaine. En ce qui concerne l’épidémie de 2022 en cours, la nomenclature MPXV en tant que virus africain est inexacte, stigmatisante et discriminatoire.
Le renvoi du MPXV en tant que virus endémique à l’Afrique a été principalement basé sur des images d’individus africains représentant des lésions de type variole dans les médias internationaux. Récemment, l’association de la presse étrangère d’Afrique a exhorté les médias internationaux à s’abstenir d’utiliser des photos de patients africains pour mettre en évidence l’épidémie de MPX dans les pays européens.
L’origine du MPXV à l’origine de l’épidémie de 2022 est inconnue; cependant, les preuves indiquent une transmission interhumaine cryptique et intercontinentale au lieu de la transmission zoonotique observée lors des précédentes épidémies de MPX au Nigeria et en Afrique de l’Ouest. Par conséquent, l’adoption d’un système de classification qui ne discrimine ni ne stigmatise géographiquement le MPXV en tant qu’Africain semble approprié pour les communautés du monde entier.
La classification existante catégorise la diversité génomique du MPXV dans le clade d’Afrique centrale (ou bassin du Congo) et d’Afrique de l’Ouest. Cependant, une telle classification va à l’encontre des meilleures pratiques qui évitent les sites géographiques dans la dénomination des maladies, en particulier en tenant compte de l’épidémie actuelle de 2022 chez l’homme, qui a été considérée comme ayant été causée par le clade ouest-africain.
Classification MPXV proposée
La classification MPXV proposée est conforme à la nomenclature de la base de données normalisée GISAID (initiative mondiale sur le partage de toutes les données sur la grippe) et, par conséquent, devrait être préférée à la base de données GenBank du NCBI (centre national d’information sur la biotechnologie). La pratique de nomenclature existante basée sur la géographie empêche de comprendre la gamme complète de MPXV en raison de tests de diagnostic limités et d’une surveillance limitée, comme le montre l’épidémie de mai 2022 impliquant plus de 44 pays sans détection de MPXV.
En collaboration avec l’Organisation mondiale de la santé (OMS), l’équipe a nommé trois clades (I, IIa et IIb). Dans IIb, l’agent causal de l’épidémie MPX actuelle de 2022, plusieurs lignées telles que A.1, A.2, A.1.1 et B.1 ont été identifiées pour soutenir la surveillance génomique en temps réel. Les clades comprennent des génomes MPXV d’Afrique de l’Ouest et d’Afrique centrale et des retombées locales d’hôtes humains et animaux dans d’autres pays.
Le clade I correspond au clade d’Afrique centrale, tandis que les clades IIa et IIb correspondent au clade d’Afrique de l’Ouest, et davantage de clades peuvent être identifiés par des efforts accrus de séquençage génomique. De plus, le clade IIb pourrait être renommé car il contient des échantillons de génome MPXV du Nigéria, du Royaume-Uni (Royaume-Uni), de Singapour et d’Israël obtenus entre 2017 et 2019, en plus du génome actuel de l’épidémie de MPXV. Une nomenclature distincte doit être attribuée aux génomes du MPXV provoquant la transmission interhumaine pour le distinguer du MPXV à transmission zoonotique.
L’équipe a qualifié le MPXV à l’origine de l’épidémie de 2022 de «hMPXV» pour représenter le génome de transmission interhumaine du MPXV, similaire au système de nomenclature Pango pour le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) englobant distinct noms de lignages encodant des associations généalogiques. La nomenclature proposée pourrait améliorer la communication dépourvue de connotations négatives et doit donc être adoptée rapidement.
De plus, des alias pourraient être introduits après la deuxième subdivision (au lieu de la troisième subdivision dans le système Pango) pour garder les étiquettes génomiques courtes, de sorte que la base hMPXV pourrait être désignée par la lignée «A». Les clades génétiques suivants pourraient être désignés par A.1, A.2, A.1.1, et le clade de l’épidémie de 2022 serait nommé B.1 en tant que descendant initial de la lignée A.1.1.
Les auteurs estiment que la classification MPXV non discriminatoire, non stigmatisante et neutre proposée serait facilement adoptée et est soutenue par l’OMS et l’Africa CDC (Centres africains de contrôle et de prévention des maladies). L’équipe a également créé un groupe de conservateurs dans la base de données Nextstrain pour identifier et caractériser de nouvelles lignées et partager les résultats en temps réel avec les scientifiques, le public mondial et les agences de santé.
Pour résumer, l’adoption d’un nouveau système de classification neutre du MPXV indépendant de la géographie historique du MPXV et similaire à la nomenclature Pango pour le SRAS-CoV-2 et à la nomenclature normalisée GISAID en collaboration avec le CDC Afrique et l’OMS pourrait améliorer la communication et fournir un système de nommage non stigmatisant et non discriminatoire pour MPXV.
