Les antibiotiques sont des outils cliniques importants pour traiter les infections bactériennes, mais nous reconnaissons qu'un effet secondaire important de l'utilisation d'antibiotiques est la perturbation de la communauté microbienne vivant dans l'intestin humain. Les antibiotiques ciblés contre les agents pathogènes bactériens ont généralement pour effets secondaires de diminuer certains groupes de bactéries et de diminuer la diversité du microbiote intestinal. Les antibiotiques sont également associés à des méfaits tels que la diarrhée associée aux antibiotiques et C. difficile colite. Il a été démontré que les probiotiques atténuent ces scénarios cliniques, mais les probiotiques peuvent-ils aider à restaurer le microbiote ?
Dans un nouvel article de synthèse publié dans Nature Reviews Gastroentérologie et Hépatologiehuit scientifiques ont examiné de manière approfondie les preuves de l'utilisation de probiotiques pour restaurer la communauté bactérienne intestinale pendant et après un traitement antibiotique. Les auteurs, couvrant l’expertise en médecine clinique, en biostatistique, en science fondamentale du microbiome et en microbiologie probiotique, décrivent les preuves actuelles et explorent à la fois le potentiel et les limites des probiotiques pour atténuer la perturbation du microbiote intestinal par les antibiotiques.
Les scientifiques ont constaté un manque d’études abordant directement cette question de recherche. Les preuves actuelles ne permettent pas de déterminer si les probiotiques en général rétablissent le microbiote intestinal à son état pré-antibiotique. Certaines études ont montré que certains probiotiques peuvent atténuer les modifications de la fonction du microbiome dues à l'utilisation d'antibiotiques, mais les données sur la restauration de la composition microbienne sont relativement rares et souffrent de faiblesses méthodologiques qui limitent leur caractère concluant. D'autres études ont montré que les probiotiques administrés avec des antibiotiques peuvent entraîner des modifications du microbiote – pas nécessairement une restauration – qui ont tendance à être interprétées par certains comme bénéfiques, mais le manque de clarté existant autour d'une composition saine du microbiote et de la manière dont le microbiote s'adapte au changement donne lieu à de telles interprétations. sujet à contestation.
L’absence de preuves concluantes sur la restauration du microbiote n’enlève rien aux preuves existantes selon lesquelles des probiotiques spécifiques peuvent réduire les symptômes cliniques chez les personnes prenant des antibiotiques. À savoir, certains probiotiques ont été démontrés dans des méta-analyses comme réduisant le risque de diarrhée associée aux antibiotiques et C. difficile-les diarrhées associées, dans la mesure où elles sont recommandées dans un certain nombre de directives cliniques internationales. Les mécanismes responsables de ces bénéfices restent flous, mais certains effets peuvent survenir via le microbiote intestinal ou via des interactions directes avec la physiologie intestinale.
Les auteurs de la revue affirment que les recherches futures devraient tenir compte des effets uniques de chaque type d’antibiotique sur le microbiote intestinal et examiner l’impact différent d’espèces et de souches probiotiques spécifiques sur la restauration du microbiote intestinal. Il est probable qu’aucune solution probiotique universelle n’existe.
Selon les scientifiques, une complication fondamentale dans l'interprétation des preuves dans ce domaine est la difficulté de définir quoi, quand et comment mesurer la perturbation et la récupération du microbiote. Une variété de techniques différentes sont utilisées d’une étude à l’autre, ce qui rend les preuves difficiles à synthétiser et les conclusions difficiles à tirer. Les scientifiques suggèrent qu’une évaluation appropriée du microbiote devrait inclure plusieurs mesures, telles que la diversité, l’abondance relative et absolue, ainsi que les paramètres liés à l’hôte. Cependant, même les mesures couramment utilisées, telles que celles de la diversité taxonomique ou fonctionnelle, présentent des limites inhérentes à la caractérisation de la restauration. Il est important de noter que ces mesures sont multidimensionnelles, mais qu’elles sont exprimées comme un résultat unique, qui peut être partagé par deux microbiotes très différents. Plus fondamentalement, nous ne savons pas quelles mesures de diversité sont les plus pertinentes pour la santé.
L'auteur principal, le professeur Hania Szajewska MD PhD, déclare : « La restauration du microbiote intestinal avec des probiotiques pendant l'utilisation d'antibiotiques est un sujet important. Bien que de nombreuses études incluent des critères d'évaluation liés au microbiome, des recherches solides ciblant spécifiquement la restauration du microbiote intestinal comme résultat principal restent limitées. j'espère que les études futures combleront cette lacune pour améliorer notre compréhension du microbiome et des avantages cliniques des probiotiques.
Notre examen approfondi a trouvé très peu de données nous permettant de savoir si les probiotiques peuvent aider à restaurer un microbiote intestinal perturbé. Même si certains probiotiques sont clairement bénéfiques lorsqu’ils sont pris avec des antibiotiques pour prévenir les effets négatifs tels que la diarrhée associée aux antibiotiques, nous ne savons toujours pas exactement comment ils y parviennent. »
Professeur Karen Scott PhD, co-auteur principal
Les effets du traitement antibiotique sur le microbiote intestinal et sur les symptômes cliniques continuent d’être étudiés. Les probiotiques peuvent être prometteurs en tant que stratégie de récupération du microbiote intestinal, mais des recherches supplémentaires sont nécessaires pour affiner notre capacité à mesurer l’adaptation et la récupération du microbiote, à établir des objectifs de protection ou de restauration du microbiote et à définir les souches et les doses efficaces à cet effet.
