Les chercheurs ont identifié une classe rare de différences génétiques transmises des parents non autistes à leurs enfants atteints d’autisme et ont déterminé qu’elles sont les plus importantes dans les familles « multiplexes » avec plus d’un membre de la famille sur le spectre. Ces résultats sont rapportés dans Des variantes héréditaires ultra-rares récentes impliquent de nouveaux gènes de risque candidats à l’autisme, une nouvelle étude publiée dans Génétique de la nature.
La chasse est sérieusement lancée pour les gènes impliqués dans l’autisme, maintenant que la technologie et les coûts beaucoup plus bas permettent l’agrégation de milliers de génomes de personnes autistes et de membres de leur famille. Le fait de savoir précisément quels gènes sont en jeu permettra de mieux comprendre la maladie connue sous le nom d’autisme et pourra éventuellement conduire à des traitements pour ceux qui le souhaitent.
Cette nouvelle étude est remarquable car la majorité des gènes de l’autisme découverts à ce jour ont été identifiés grâce à des études de mutations de novo, des différences génétiques qui surviennent d’abord chez la personne autiste mais ne sont présentes chez aucun de ses parents. Les résultats indiquent que les chercheurs ne devraient pas supposer que l’ensemble des gènes de l’autisme altérés par des mutations de novo sont les mêmes gènes que ces variantes rares héritées nouvellement identifiées.
Selon l’auteur principal Amy B. Wilfert, Ph.D., de l’Université de Washington, dans une analyse de 10 905 personnes autistes, les chercheurs ont identifié et reproduit une classe rare de variantes génétiques qui sont transmises (surtransmises) par des parents sans l’autisme aux enfants autistes.
Alors que la plupart des études sur l’autisme se concentrent sur les mutations de novo, cette étude se concentre sur les mutations héréditaires rares, qui sont souvent peu étudiées dans l’autisme. Nous constatons que ces variantes sont individuellement moins dommageables que les mutations de novo, mais ont le potentiel de contribuer presque autant au risque et d’avoir un impact sur les mêmes voies moléculaires, via un ensemble distinct de gènes. Ces variantes, cependant, ne sont capables de persister dans la population générale que pendant quelques générations avant d’être sélectionnées par l’évolution. »
Amy B. Wilfert, Ph.D., Université de Washington
« Il est largement admis que les mutations de novo ne peuvent pas et n’expliquent pas toutes les causes génétiques de l’autisme, un phénomène parfois appelé « héritabilité manquante » », déclare Pamela Feliciano, Ph.D., directrice scientifique, SPARK (Simons Powering Recherche sur l’autisme). Le consortium SPARK a contribué à plus de 50 % des données génétiques analysées dans cette étude, y compris les exomes de 21 331 participants à SPARK, dont 6 539 personnes atteintes de troubles du spectre autistique (TSA). Le nombre de génomes accessibles aux scientifiques à l’heure actuelle permet de rechercher certaines catégories de modifications génétiques – telles que les modifications de novo et les variantes héréditaires ultra-rares – mais pas toutes. Au fur et à mesure que de plus en plus de génomes seront mis en ligne, de plus grandes catégories de variantes seront accessibles pour analyse.
« Il est intéressant de noter que la grande majorité de ces variantes (95 %) ne se trouvent pas dans des gènes déjà connus pour être des gènes de l’autisme, ce qui indique qu’il y a beaucoup plus à apprendre sur la génétique de l’autisme », a déclaré le Dr Feliciano, notant que cette étude est la première étape d’une enquête beaucoup plus vaste. « Bien que l’étude actuelle ne soit pas assez importante pour identifier en toute confiance les gènes individuels qui ont ces rares variantes héréditaires, nous en apprenons davantage sur ces gènes. Les recherches futures axées sur les familles multiplexes sont de plus en plus importantes pour fournir de nouvelles informations. »
Les chercheurs ont également déclaré que l’étude a confirmé leurs attentes selon lesquelles cette classe de variantes héréditaires rares est plus importante dans les familles avec plusieurs membres atteints d’autisme que dans les familles avec une seule personne affectée. Conformément à cette constatation, les enfants atteints de TSA dans ces familles sont plus susceptibles de porter deux de ces variantes par rapport à leurs frères et sœurs non affectés.
L’étude a également souligné la nécessité d’une plus grande diversité lors de la conduite de recherches de ce type, car les chercheurs étaient moins en mesure de détecter des variantes rares chez les personnes appartenant à des groupes ancestraux sous-représentés dans la recherche génomique, y compris les personnes d’origine africaine, est-asiatique et sud-asiatique. .
