Les scientifiques ont travaillé sans relâche pour contenir la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) causée par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2). À cette fin, plusieurs stratégies pharmaceutiques et non pharmaceutiques ont été développées pour empêcher la transmission ultérieure du SRAS-CoV-2 et protéger les individus contre une infection grave.
Étude: Les tests SARS-CoV-2 sur les eaux usées des avions montrent que les tests obligatoires et la réussite de la vaccination avant l’embarquement n’ont pas empêché l’importation massive de la variante d’Omicron en Europe. Crédit d’image : heychli/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière plan
Il a été découvert que des variantes du SRAS-CoV-2 nouvellement apparues étaient transmises par les voyages en avion et les croisières par des passagers infectés. Pour limiter la survenue de ces événements, plusieurs stratégies ont été mises en œuvre, telles que des restrictions de voyage, des périodes de quarantaine et une vaccination obligatoire pour empêcher la propagation du SRAS-CoV-2.
À ce jour, la plupart des études disponibles se sont concentrées sur l’impact des restrictions de voyage sur la phase précoce de la pandémie de COVID-19. Bien que certaines études aient montré que ces restrictions retardaient considérablement la transmission virale, d’autres ont contredit ces observations et ont plutôt signalé que les restrictions de voyage étaient insuffisantes pour empêcher la transmission mondiale du SRAS-CoV-2.
De nombreux pays ont renforcé diverses règles avant et après le voyage pour limiter la propagation des variantes du SRAS-CoV-2. Récemment, la variante Omicron, qui a été signalée pour la première fois en Afrique du Sud, est devenue la souche dominante en circulation dans la plupart des pays du monde.
Des études antérieures ont signalé la présence d’une concentration élevée d’acide ribonucléique (ARN) viable du SRAS-CoV-2 dans des échantillons de selles d’individus asymptomatiques et symptomatiques atteints de COVID-19. En conséquence, l’analyse du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées a été proposée comme stratégie efficace pour déterminer les charges virales au sein des communautés.
En fait, plusieurs études ont réussi à isoler des génotypes viraux circulant au sein d’une communauté en séquençant le génome du SRAS-CoV-2 à partir d’échantillons d’eaux usées.
À cette fin, diverses souches de SRAS-CoV-2 ont été identifiées dans des échantillons d’eaux usées qui étaient similaires à des variants isolés à partir d’échantillons cliniques. Cependant, de nouveaux génotypes de SRAS-CoV-2 ont également été découverts qui n’ont pas été signalés dans les échantillons cliniques.
À ce jour, peu d’études ont démontré la présence d’ARN du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées des avions de passagers. Une étude connexe a rapporté la détection réussie de variantes du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées des avions par séquençage du génome.
À propos de l’étude
Un nouveau Virus étude a détecté avec succès des variantes du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées des avions. Ici, les chercheurs ont obtenu des échantillons d’eaux usées de deux vols voyageant d’Addis-Abeba, en Éthiopie, à Marseille, en France.
Dans cette étude, les scientifiques ont testé à la fois des échantillons d’eaux usées et des passagers pour détecter la présence de SARS-CoV-2 lors du débarquement afin de déterminer si les résultats de l’analyse des eaux usées et les tests SARS-CoV-2 des passagers étaient corrélés. Le test de transcription inverse-amplification en chaîne par polymérase (RT-PCR) et le séquençage intégral du génome ont été utilisés pour détecter les variants du SRAS-CoV-2 à partir des échantillons.
Résultats de l’étude
L’analyse des eaux usées des deux vols a révélé la présence de la variante Omicron, le séquençage génomique confirmant les schémas de mutation de cette variante.
Pris ensemble, 12 passagers du vol du 24 décembre 2021 ont été testés positifs pour le SRAS-CoV-2 par un test de flux latéral. Le séquençage génomique de 11 de ces échantillons a confirmé la présence du variant Omicron.
Cela indique que malgré le respect de l’exigence de produire un test RT-PCR négatif dans les 72 heures suivant l’embarquement et la vaccination, un cinquième des passagers ont été infectés par le SRAS-CoV-2. Ces observations concordent avec celles d’une étude récente rapportant la détection de la variante Omicron dans les eaux usées d’un vol voyageant de Johannesburg, en Afrique du Sud, à Darwin, en Australie.
Les résultats congruents des tests COVID-19 des passagers et de l’analyse des eaux usées des avions indiquent que cette méthode est efficace pour surveiller les variants en circulation et évaluer le risque d’importer des souches nouvellement apparues. Cependant, ce processus nécessiterait d’interroger les passagers qui ont utilisé les toilettes pendant le vol.
Bien que les réservoirs d’eaux usées aient été soigneusement nettoyés entre les vols, la possibilité d’une contamination par des traces d’ARN du SRAS-CoV-2 dans les réservoirs d’eaux noires des vols précédents ne peut être entièrement omise. Cependant, dans ce cas, la charge virale élevée ne peut pas être le résultat d’une contamination et est fortement liée à l’excrétion virale par les passagers à bord ou l’équipage de l’avion.
L’importation de la variante Omicron d’Afrique du Sud vers l’Europe a démontré que les voyages en avion sont une voie d’entrée puissante pour de nouvelles variantes. Étant donné que le dépistage des eaux usées des avions peut être effectué en une heure, cette approche pourrait être un outil plus puissant par rapport aux règles de voyage actuelles consistant à fournir des résultats de test COVID-19 négatifs et des certificats de vaccination des passagers.
conclusion
L’étude actuelle a souligné l’importance de surveiller les eaux usées des avions, car elle offre des informations importantes liées à la transmission mondiale des variantes SARS-CoV-2 nouvellement apparues.
De plus, un test COVID-19 négatif avant l’embarquement ou la vaccination ne confirme pas que les passagers ne sont pas porteurs du virus. Au lieu de cela, l’approche d’analyse des eaux usées des avions est un outil rout pour contrôler l’importation et l’exportation du SRAS-CoV-2.
