Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de pré-impression, une équipe de chercheurs a démontré qu’entre août et décembre 2021, le Japon avait été témoin d’une endémie induite par la variante delta du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère.
Une sérosurveillance antérieure dans la préfecture de Hyogo, une région située dans le centre-sud du Japon avec une population de 5,4 millions d’habitants, en octobre 2020, a montré une activité neutralisante de 0,15 % contre le SARS-CoV-2.
La surveillance séroépidémiologique menée en août et décembre 2021 a montré une activité neutralisante supérieure à celle estimée par l’analyse de la réaction en chaîne par polymérase (PCR), soulignant que, combinée au diagnostic basé sur la PCR, il s’agit d’une approche puissante pour déterminer la situation du COVID-19 à tout moment. temps donné.
Sommaire
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont recueilli des sérums d’individus qui se sont rendus pour un bilan de santé dans les cliniques de la préfecture de Hyogo à Kobe, au Japon, entre août et décembre 2021. Il y avait deux cohortes d’étude, la cohorte d’août 2021 et la cohorte de décembre 2021. , à partir desquels les chercheurs ont collecté 1 000 échantillons de sérum chacun.
Les cohortes comprenaient des personnes de plusieurs tranches d’âge, dont 20-29, 30-39, 40-49 et 70-79 ans, les sujets testés tombant principalement dans la tranche d’âge 20-69 ans. Quelques sujets de test appartenaient au groupe d’âge de 70 à 80 ans, moins avaient moins de 20 ans et aucun n’avait moins de 18 ans.
L’immunodosage par électrochimioluminescence (ECLIA) et le dosage immuno-enzymatique (ELISA) ont mesuré les titres d’anticorps contre les antigènes SARS-CoV-2 N et spike (S), respectivement.
Résultats
ECLIA a détecté un taux de positivité anti-N de 2,1 % et 3,9 % dans les cohortes d’août 2021 et de décembre 2021, respectivement. Dans la cohorte d’août 2021, avec des taux de positivité anti-N respectifs de 3,4 % et de 4,1 % chez les individus des tranches d’âge 30-39 ans et 40-49 ans, ce taux était relativement élevé, alors qu’aucun cas positif n’est survenu dans la tranche d’âge groupes de 18-19 et 70-83 ans. Dans la cohorte de décembre 2021, le taux de positivité anti-N pour le groupe d’âge 20-29 ans était de 10,6 %, et celui dans le groupe d’âge le plus âgé des 70-79 ans était de 5,0 %, ce qui suggère que les infections ont augmenté chez les plus jeunes. et les groupes plus âgés pendant cette période.
Les taux de positivité anti-S, estimés par ELISA, ont tenu compte des antécédents de vaccination et d’infection des sujets testés. Le taux de positivité anti-S pour les cohortes d’août et de décembre 2021 était de 38,7 % et 90,8 %, respectivement, à l’indice seuil (COI) de 0,3 pour la dilution sérique de 40 fois.
Dans la cohorte d’août, les taux de positivité anti-S pour les tranches d’âge de 60 à 69 ans et de 70 à 83 ans étaient relativement élevés à 70,7 % et 90,2 %, respectivement. En revanche, dans la cohorte de décembre 2021, un taux positif aplati entre 87,2 % et 100 % a été observé dans toutes les tranches d’âge testées. Notamment, tous les sérums anti-N-positifs étaient également anti-S-positifs, à une seule exception près dans les deux cohortes.
Les estimations du test de Kruskal-Wallis n’ont montré aucune différence significative dans la distribution des titres d’anticorps anti-S entre les différents groupes d’âge dans la cohorte d’août 2021, tandis que la distribution a diminué dans le groupe d’âge 70-79 ans de la cohorte de décembre 2021.
Dans la cohorte d’août 2021, le sous-ensemble anti-S positif de 387 individus a montré des titres neutralisants de 85,5 % contre la souche WT, contre 77,3 % contre la variante Delta. Les estimations du test U de Mann-Whitney ont donc indiqué l’efficacité de deux doses de vaccination contre le COVID-19.
La cohorte de décembre 2021, qui représente la population vaccinée, avait un taux de neutralisation-positivité élevé de 78,7 % contre la variante Delta, indiquant une immunité sociale efficace. À l’opposé, cette cohorte était vulnérable à l’infection par Omicron, comme le suggère un faible taux de neutralisation de 36,6 %. Dans l’ensemble, ces résultats ont démontré que la vaccination en deux doses a supprimé la propagation de la variante Delta, entraînant un taux d’infection relativement réduit de 3,9 % au cours de la période d’étude.
L’examen de ces cohortes séparées en fonction des groupes d’âge a révélé que dans le groupe d’âge de 70 à 79 ans, le taux de neutralisation-positivité était plus faible contre les variantes Delta et Omicron, avec seulement 15 % de sérums ayant une activité de neutralisation contre Omicron.
Les cas Delta et Omicron avaient des titres d’anticorps anti-S plus élevés, ce qui suggère que l’activité de neutralisation est largement attribuée à la présence d’anticorps anti-S.
conclusion
Entre août et décembre 2021, les taux d’infection basés sur la PCR étaient d’env. deux fois plus faible que le taux d’infection révélé par la sérosurveillance de la présente étude, suggérant ainsi que la surveillance séroépidémiologique transversale périodique est une approche puissante pour interpréter la situation de pandémie induite par le COVID-19 combinée à un diagnostic basé sur la PCR et à des tests antigéniques.
Au 6 janvier 2022, 74 % de la population du Japon avaient reçu deux doses de vaccin contre le COVID-19, ce qui a contribué à renforcer l’immunité sociale chez 38,7 % des individus de la cohorte d’août 2021, comme le démontrent leurs résultats de séroprévalence anti-S. Ces résultats étaient également corrélés avec les taux de vaccination à dose unique et à deux doses de la préfecture de Hyogo de 32,79 % et 42,05 %, respectivement.
En décembre 2021, le taux de vaccination a atteint un plateau au Japon et l’enquête de sérosurveillance a révélé un taux de séropositivité élevé de 90,8 %. De plus, cette enquête a révélé un taux de séropositivité élevé de 78,7% contre la variante Delta mais un taux beaucoup plus faible de 36,6% contre l’Omicron. Dans l’ensemble, ces résultats suggèrent que les vaccinations au Japon ont établi une immunité collective et ont contribué à réduire la gravité de la situation du COVID-19 d’ici décembre 2021.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.