Dans une récente étude publiée sur bioRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont évalué le de novo et rappeler les réponses des lymphocytes T lors de la percée de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).
Sommaire
Arrière plan
Il a été émis l’hypothèse que la mémoire des lymphocytes T CD8+ et CD4+ sont des déterminants essentiels de la protection associée au vaccin contre les conséquences graves. Curieusement, bien que les groupes non vaccinés et vaccinés contre le COVID-19 affichent un pic comparable de charge du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) après l’infection, la cohorte vaccinée a présenté une clairance virale plus rapide dans les voies respiratoires supérieures (URT) commençant quatre à six jours depuis l’apparition des symptômes. Il est plausible que les cellules T CD8+ soient responsables de la promotion de la cytolyse ou de la libération de cytokines antivirales, et que les cellules T CD4+, qui peuvent aider au rappel de l’immunité humorale ou éventuellement afficher une activité cytotoxique, jouent un rôle dans le déclin viral dû au vaccin. Pourtant, on ne connaît pas suffisamment de données corrélant le rappel des lymphocytes T CD4+ et/ou CD8+ à la clairance du SRAS-CoV-2.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont caractérisé la cinétique et le phénotype associés aux réponses rappelées et primaires des lymphocytes T après une infection par le SRAS-CoV-2 Omicron ou Delta.
L’équipe a recruté 23 personnes avec SARS-CoV-2 Delta ou Omicron BA.1 ou BA.2 percée infection (BTI). Des échantillons de sang longitudinaux fréquents et des écouvillons nasaux ont été prélevés de zéro à 14 jours après l’apparition des symptômes (PSO), avec des échantillons de sang de suivi supplémentaires prélevés jusqu’au jour 44 PSO. Chaque individu testé a soumis en moyenne neuf échantillons, avec 138 échantillons de sang et 150 prélèvements nasaux analysés. Tous les BTI étaient mineurs et sont survenus en moyenne 100 jours après la dernière vaccination. Une réaction en chaîne par polymérase quantitative (qPCR) du gène de la nucléocapside (N) a été réalisée pour évaluer la charge virale dans les écouvillons nasaux.
À l’aide d’un test de neutralisation virale vivante, le rappel des anticorps neutralisants a été évalué. Une régression linéaire par morceaux a été utilisée pour estimer la cinétique du rappel immunologique après BTI pour mesurer : (1) la durée depuis l’apparition des symptômes et la première altération du titre d’anticorps neutralisant (2) le temps de réaction maximal concernant l’apparition des symptômes, et (3) taux de décomposition et de croissance. En utilisant les multimères DP04-S167 et DR15-S751-pMHC, des lymphocytes T CD4+ mémoire spécifiques au S ont été trouvés chez tous les participants ayant les allèles pertinents de l’antigène leucocytaire humain (HLA).
Indépendamment de la spécificité de l’épitope, les cellules T CD8 + spécifiques au S ont augmenté après le BTI à partir du jour 4,4 PSO, atteignant un pic au jour 5,8 et restant raisonnablement stables par la suite. Cependant, une variation de rappel observée entre les individus a été notée, une minorité de participants présentant une augmentation significative du nombre de lymphocytes T CD8+ spécifiques au S. La fréquence des cellules spécifiques à la pointe chez le reste des six sujets est restée relativement stable au cours de la période de suivi.
Résultats
La charge virale la plus élevée s’est produite peu de temps après l’apparition des symptômes, et aucune différence considérable n’a été notée dans la charge virale maximale entre les trois variantes préoccupantes (COV). En analysant le taux de clairance virale mesuré par régression linéaire, le taux de décroissance des flambées de SARS-CoV-2 Delta était nettement plus rapide que pour Omicron. Les titres d’anticorps trouvés contre le COV infectieux ont augmenté à partir du jour 4,3 PSO et ont culminé à environ 14,6 jours PSO. L’analyse de régression linéaire par morceaux n’a révélé aucune variation significative de la cinétique des anticorps neutralisants entre les participants infectés par BA.1, BA.2 ou Delta COV.
Après BTI, le suivi longitudinal a révélé une augmentation évidente du niveau de cellules T CD4+ spécifiques au S. L’évaluation de la cinétique des lymphocytes T à l’aide d’un modèle linéaire par morceaux a montré que la fréquence des lymphocytes T CD4 + spécifiques au S augmentait à 2, 5 jours de PSO, culminait à 5, 4 jours, puis diminuait progressivement par la suite. Fait intéressant, l’émergence de cellules Tet + activées en circulation a été synchronisée dans tout le groupe, l’activation commençant environ 1,1 jour PSO et atteignant son pic le jour 3,6. Au cours de cette période, le nombre de lymphocytes T pMHC-II+ CD4+ activés est passé de 2,44 %, noté lors de l’échantillonnage initial, à 74,5 %.
L’équipe a trouvé des preuves insignifiantes de lymphocytes T rappelés exprimant un phénotype auxiliaire folliculaire T circulant (cTFH) chez BTI, même chez les individus dont les cellules spécifiques CXCR5 + S étaient détectables après la primo-vaccination. Par conséquent, aucun lien n’a été trouvé entre le taux de croissance ou le pic des titres d’anticorps neutralisants et les mécanismes de mémoire/rappel des lymphocytes T CD4+ spécifiques au S dans l’ensemble du groupe.
L’équipe a détecté une régulation positive globale du CD38 présent sur les lymphocytes T CD8+ spécifiques au S, qui devrait commencer peu de temps après l’apparition des symptômes et atteindre un maximum à 7,1 jours. Les six individus de la cohorte d’étude avec une croissance limitée des lymphocytes T ont affiché une activation des cellules S-spécifiques, trois présentant des fréquences relativement élevées de cellules CD38+ dans leur échantillon initial, qui ont diminué avec le temps. Par conséquent, il est plausible que l’initiation de l’activation et de la prolifération des lymphocytes T CD8+ se soit produite avant le premier échantillon accessible chez les individus évalués, soit en raison d’un délai entre l’infection et l’apparition des symptômes, soit en raison d’un rappel rapide des lymphocytes T.
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont montré que les cellules T CD4+ et CD8+ sont rapidement activées avant une augmentation du niveau d’anticorps neutralisants. De plus, l’équipe a observé une corrélation entre les niveaux élevés d’activation des lymphocytes T CD8+ spécifiques au S et une réduction plus rapide des niveaux d’ARN du SRAS-CoV-2 dans l’URT. Cela a mis en évidence la nécessité d’une compréhension approfondie de la fonction de l’immunité des lymphocytes T induite par le vaccin sur le plan mécanique et d’un prédicteur de la protection.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
