Dans une étude récente publiée dans Le microbe lancetteles chercheurs ont évalué le rôle de l’assemblage du microbiome bactérien intestinal et du mycobiome intestinal en relation avec la santé, la pathologie et les applications cliniques.
Sommaire
Arrière plan
Des études ont établi un cadre pour étudier comment les champignons intestinaux sont liés à différentes maladies, ou peut-être à l’origine de celles-ci, et comment modifier les champignons intestinaux pour traiter les maladies en révélant le paysage de la composition du mycobiome intestinal chez l’homme. Il est important de noter que les découvertes disponibles sur les mycobiomes ne sont pas largement appliquées à la pratique clinique et que les champignons intestinaux sont encore largement ignorés dans le contexte des traitements basés sur le microbiote.
Mycobiome intestinal et maladie
Dysbiose du mycobiome intestinal au cours des maladies
Selon des études menées sur des souris, la modification des champignons intestinaux par l’administration orale de médicaments antifongiques a aggravé la rhinite et la colite allergiques, indiquant qu’un déséquilibre du mycobiome intestinal peut jouer un rôle dans la pathogenèse des maladies intestinales et extra-intestinales. Des comparaisons similaires entre les mycobiomes intestinaux de personnes en bonne santé et de patients souffrant de divers troubles intestinaux et extra-intestinaux ont été documentées dans de nombreuses études.
De plus, des altérations du mycobiome intestinal ont également été liées de manière causale ou associative à l’apparition et au développement de cancers tels que les adénocarcinomes canalaires colorectaux et pancréatiques. Une relation a également été trouvée entre les altérations du mycobiome et l’émergence de la maladie intestinale du greffon contre l’hôte (GVHD) après une allogreffe de cellules hématopoïétiques.
Rôles néfastes des champignons intestinaux associés à la maladie
De nombreux troubles, tels que les maladies inflammatoires de l’intestin (MICI), la GVHD, C difficile l’infection, l’asthme, les maladies du foie, la schizophrénie et la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), ont été continuellement associés à la prolifération de C albicans dans le mycobiome intestinal. C. albicans était plus répandue dans l’estomac en raison d’une inflammation intestinale, ce qui a également conduit au développement de cellules Th17 antifongiques qui ont montré une réactivité croisée avec Aspergillus fumigatus et d’autres espèces de champignons.
La croissance de la population de cellules Th17 dans les poumons et l’inflammation subséquente des voies respiratoires causée par une telle interaction croisée des cellules Th17 induites par le C-albicans intestinal avec des champignons en suspension dans l’air soutiennent une relation systémique et distale entre les champignons intestinaux et les maladies respiratoires.
Association perturbée entre les champignons intestinaux et les bactéries dans la maladie
Pour suivre l’évolution de l’écologie du microbiome intestinal, une étude de 2021 a recueilli les abondances absolues longitudinales d’espèces fongiques et bactériennes dans l’intestin des nourrissons prématurés. Une corrélation inverse entre les charges bactériennes et fongiques dans les intestins des prématurés a été observée, et une seule espèce fongique (c. C. albicans) ont entravé plusieurs genres dominants de bactéries intestinales au cours du développement du nourrisson. Les chercheurs ont conclu que les interactions transversales et directionnelles pourraient affecter l’assemblage du microbiome intestinal.
Les études futures devraient reconnaître et explorer de manière approfondie l’importance des interactions intra ou interroyaumes entre les champignons et les bactéries intestinales, tandis que la majorité des recherches actuelles sur le mycobiome intestinal dans les troubles humains visent à trouver des espèces fongiques pathogènes.
Association entre les champignons intestinaux, les bactéries et l’immunité de l’hôte
Interactions entre l’immunité de l’hôte et les champignons intestinaux
Des études sur des souris ont révélé que la monocolonisation avec soit C. albicans ou S. cerevisiae renversé efficacement la vulnérabilité à la colite et à l’infection par le virus de la grippe A suite à l’élimination des bactéries commensales intestinales par un traitement antibiotique. Des recherches ultérieures ont révélé que les mannanes étaient les principaux médiateurs des effets protecteurs des champignons commensaux. Ces résultats ont démontré que les champignons intestinaux pouvaient remplacer efficacement les bactéries en fournissant une immunité contre les maladies inflammatoires et infectieuses.
De plus, il a été constaté que les personnes en bonne santé et les personnes atteintes d’une maladie intestinale inflammatoire ont des anticorps contre le bêta-glucane fongique et d’autres antigènes fongiques dans leur sérum, ce qui indique que les champignons peuvent également déclencher une réponse humorale de l’hôte.
Interactions entre les bactéries et les champignons intestinaux en ce qui concerne la physiopathologie de l’hôte
Les champignons intestinaux interagissent largement avec les populations bactériennes intestinales en plus d’avoir un impact direct sur l’hôte. Pour affecter la colonisation bactérienne, les champignons intestinaux peuvent générer des peptides antimicrobiens avec de l’alcool et d’autres métabolites. En produisant des acides gras, les bactéries contrôlent à leur tour la germination et la prolifération des hyphes chez les champignons. Car C. albicans diminué la quantité d’oxygène dissous dans la zone, C difficile et d’autres bactéries anaérobies pourraient proliférer plus facilement. Dans les échantillons de biopsie gastrique, C. albicans et Helicobacter pylori ont été découverts pour interagir avec H. pylori existant dans les vacuoles dans C. albicans cellules, peut-être pour survivre à l’environnement acide de l’estomac.
Mycobiome intestinal en application clinique
Transplantation de microbiote fécal (FMT)
Le FMT a été scientifiquement prouvé pour la première fois comme étant extrêmement efficace pour les réfractaires C difficile infection. Il s’agit d’administrer des solutions fécales de donneurs sains dans le système digestif d’un patient dans le but de reconstituer le microbiote intestinal. Depuis lors, un nombre croissant d’essais cliniques ont utilisé la FMT pour traiter une variété de troubles supplémentaires. Cependant, l’efficacité thérapeutique variait selon les personnes et les conditions, et la greffe bactérienne n’était pas en mesure de tenir compte de toutes les variations dans les résultats du traitement. Des recherches récentes soulignent l’importance des champignons intestinaux dans les traitements FMT.
Médicaments antifongiques et antibiotiques
Il a été démontré que le traitement au fluconazole prévient avec succès C. albicans colonisation chez les patients atteints de colite ulcéreuse et pour abaisser l’indice d’activité de la colite ulcéreuse chez les animaux. De même, chez les rats atteints du syndrome du côlon irritable, les fongicides peuvent réduire l’hypersensibilité viscérale. Bien que les antifongiques puissent cibler involontairement les champignons colonisateurs de l’intestin, tels que les lignées bénéfiques, il est encore difficile de traiter des troubles autres que les infections fongiques à l’aide d’antifongiques à large spectre.
Selon la recherche, le mycobiome intestinal, en conjonction avec l’assemblage du microbiome bactérien intestinal, jouerait une influence significative sur la santé humaine et un certain nombre de troubles.
