Dans une étude publiée dans mBio, des chercheurs de l’Ohio State University ont étudié des mutations dans le reste de la protéine de pointe, en particulier la mutation Q677H.
Étude : Neutralisation des variantes préoccupantes du SRAS-CoV-2 hébergeant Q677H. Crédit d’image : joshimerbin/Shutterstock
Fond
Depuis le début de la vaccination de masse, la plupart des inquiétudes concernant la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) dans les pays développés se concentrent sur les variantes préoccupantes (COV). En effet, certaines variantes, telles que la souche Delta, ont montré la capacité d’éviter à la fois l’immunité induite par le vaccin et l’immunité naturelle, restant même transmissibles chez les patients vaccinés. Certaines études ont suggéré que seule une infection antérieure avec une souche alternative et la vaccination suffisent à fournir une protection.
La plupart des recherches sur les mutations des COV se sont concentrées sur la protéine de pointe, en particulier le domaine de liaison au récepteur (RBD) de la sous-unité S1. La protéine de pointe est essentielle à la pathogénicité du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2). Le RBD de la sous-unité S1 se lie à l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) pour permettre l’entrée des cellules virales, et le domaine N-terminal de la sous-unité S2 est responsable de la fusion membranaire.
Q677H est une mutation qui est apparue dans deux souches, B.1.525 et Bluebird, respectivement au Nigeria et aux États-Unis. Ces deux souches commandent une proportion substantielle de nouveaux cas dans les deux pays. B.1.525 comprend également une mutation RBD supplémentaire, E484K. Q677H est également présent dans B.1.1.7, B.1.351 et P1, également connus sous le nom de variantes Alpha, Beta et Gamma.
Les chercheurs ont examiné l’infectiosité et la neutralisation des variants porteurs de Q677H, et les effets se sont manifestés lorsqu’ils sont exprimés en conjonction avec d’importantes mutations RBD telles que D614G, qui est connue pour augmenter la transmissibilité et l’évasion immunitaire.
L’étude
Une luciférase portant des tests de neutralisation de pseudo-type lentiviral a été utilisée pour examiner l’activité neutralisante contre les COV. Des sérums ont été prélevés sur neuf patients en unité de soins intensifs (USI) et neuf patients hospitalisés non-USI. Ils ont effectué leur test pour déterminer l’activité de neutralisation contre le SRAS-CoV-2 de type sauvage (WT) et les variantes avec les mutations D614G Q677H.
Les sérums ont été collectés au moins 14 jours avant l’apparition des symptômes, et les virus pseudo-typés ont été ajustés à une infectivité similaire à celle du variant avant neutralisation pour éviter les variations d’infectiosité, affectant les résultats en raison de changements dans la neutralisation. Comme prévu, la mutation D614G a montré un titre de neutralisation significativement plus élevé (50 % de plus) par rapport au WT. Les variantes B.1.525 et Bluebird ont montré des titres de neutralisation réduits et des titres encore réduits chez les patients non-USI.
Les chercheurs ont également examiné les capacités de neutralisation des sérums d’individus vaccinés. Ils ont collecté des sérums de 20 personnes de près de 35 ans qui avaient pris le vaccin Moderna et de 20 personnes de près de 35 ans qui avaient pris le vaccin Pfizer. Encore une fois, les variants avec le Q677H ont montré des titres de neutralisation réduits par rapport au D614G. L’introduction de la mutation Q667H dans les variants B.1.1.7, B.1.351 et P1 a entraîné une réduction des titres de neutralisation d’environ 30 % dans B.1.1.7 et P.1. Aucune différence n’a été observée dans B.1.351. Des conclusions similaires provenant d’autres études récentes appuient ces résultats.
Conclusion
Les auteurs soulignent l’importance de leur travail pour prouver que la mutation E484K augmente la résistance à la neutralisation et a un effet épistatique lorsqu’elle est associée à des COV contenant déjà des mutations RBD. Ils suggèrent que Q677H pourrait altérer la confirmation du pic – mais cela n’a pas été observé.
Les recherches sur les mutations observées dans les COV sont de plus en plus importantes ; ils peuvent aider à diriger la recherche sur les soins de santé, la production de vaccins et aider à cibler les traitements par anticorps monoclonaux à un moment où le WT COVID-19 devient de moins en moins un problème et où les COV augmentent en nombre et en variété.
L’effet de la mutation E484K sur les sérums d’individus vaccinés est le plus préoccupant. Les vaccins se sont déjà avérés nettement moins efficaces contre certains COV. Une étude récente a montré une réduction de 12 fois de la liaison des anticorps à la souche Delta à partir de sérums recueillis auprès d’individus vaccinés. Alors que les restrictions et les blocages de distanciation sociale prennent fin, les souches résistantes aux vaccins pourraient être mortelles pour les groupes à risque tels que les personnes immunodéprimées, les personnes âgées et les personnes souffrant de troubles respiratoires.
